RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528484.5

CMTM1-211, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CMTM1, Length 726 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-211ENST00000528484 TONSLQ96HA7 1378 aa16.27■□□□□ 0.2
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CMTM1-211ENST00000528484 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
CMTM1-211ENST00000528484 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
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CMTM1-211ENST00000528484 USHBP1Q8N6Y0 703 aa16.14■□□□□ 0.17
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CMTM1-211ENST00000528484 CD2APQ9Y5K6 639 aa16.14■□□□□ 0.17
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CMTM1-211ENST00000528484 PALLDQ8WX93 1383 aa16.13■□□□□ 0.17
CMTM1-211ENST00000528484 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP16.13■□□□□ 0.17
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CMTM1-211ENST00000528484 FLT4P35916 1363 aa16.13■□□□□ 0.17
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CMTM1-211ENST00000528484 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa16.01■□□□□ 0.15
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CMTM1-211ENST00000528484 GNPATO15228 680 aa16■□□□□ 0.15
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CMTM1-211ENST00000528484 TRAPPC3LQ5T215 181 aa15.95■□□□□ 0.14
CMTM1-211ENST00000528484 AMIGO3Q86WK7 504 aa15.95■□□□□ 0.14
CMTM1-211ENST00000528484 NLGN1Q8N2Q7 840 aa15.95■□□□□ 0.14
CMTM1-211ENST00000528484 EYA1Q99502 592 aa15.95■□□□□ 0.14
CMTM1-211ENST00000528484 ASAP1Q9ULH1 1129 aa15.95■□□□□ 0.14
CMTM1-211ENST00000528484 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CMTM1-211ENST00000528484 TGFB2P61812 414 aa15.94■□□□□ 0.14
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