RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525861.5

ACER3-204, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 2,058 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-204ENST00000525861 ABCC6O95255 1503 aa29.88■■■□□ 2.37
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ACER3-204ENST00000525861 ERBB3P21860 1342 aa29.87■■■□□ 2.37
ACER3-204ENST00000525861 COL18A1P39060 1754 aa29.86■■■□□ 2.37
ACER3-204ENST00000525861 GNAT3A8MTJ3 354 aa29.86■■■□□ 2.37
ACER3-204ENST00000525861 VAMP4O75379 141 aa29.86■■■□□ 2.37
ACER3-204ENST00000525861 PANK1Q8TE04 598 aa29.86■■■□□ 2.37
ACER3-204ENST00000525861 LRRC37A3O60309 1634 aa29.86■■■□□ 2.37
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ACER3-204ENST00000525861 MAP3K5Q99683 1374 aa29.86■■■□□ 2.37
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ACER3-204ENST00000525861 TSPYL6Q8N831 410 aa29.84■■■□□ 2.37
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ACER3-204ENST00000525861 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa29.75■■■□□ 2.35
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ACER3-204ENST00000525861 BABAM1Q9NWV8 329 aa29.72■■■□□ 2.35
ACER3-204ENST00000525861 NLRP2Q9NX02 1062 aa29.72■■■□□ 2.35
ACER3-204ENST00000525861 MIS18AQ9NYP9 233 aa29.72■■■□□ 2.35
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ACER3-204ENST00000525861 LGR6Q9HBX8 967 aa29.63■■■□□ 2.33
ACER3-204ENST00000525861 TMEM57Q8N5G2 664 aa29.62■■■□□ 2.33
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ACER3-204ENST00000525861 WDR17Q8IZU2 1322 aa29.59■■■□□ 2.33
ACER3-204ENST00000525861 RNMTO43148 476 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
ACER3-204ENST00000525861 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa29.59■■■□□ 2.33
ACER3-204ENST00000525861 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
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ACER3-204ENST00000525861 KDM3BQ7LBC6 1761 aa29.57■■■□□ 2.32
ACER3-204ENST00000525861 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa29.56■■■□□ 2.32
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ACER3-204ENST00000525861 PTPRCP08575 1304 aa29.52■■■□□ 2.32
ACER3-204ENST00000525861 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
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ACER3-204ENST00000525861 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
ACER3-204ENST00000525861 BTBD11A6QL63 1104 aa29.5■■■□□ 2.31
ACER3-204ENST00000525861 PHKG2P15735 406 aa29.5■■■□□ 2.31
ACER3-204ENST00000525861 CCDC30Q5VVM6 783 aa29.49■■■□□ 2.31
ACER3-204ENST00000525861 RGS12O14924 1447 aa29.49■■■□□ 2.31
ACER3-204ENST00000525861 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
ACER3-204ENST00000525861 IFNL2Q8IZJ0 200 aa29.49■■■□□ 2.31
ACER3-204ENST00000525861 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
ACER3-204ENST00000525861 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
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