RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520657.1

EIF4EBP1-202, Transcript of eukaryotic translation initiation factor 4E binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene EIF4EBP1, Length 695 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1-202ENST00000520657 TATP17735 454 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1-202ENST00000520657 GAS2L2Q8NHY3 880 aa14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1-202ENST00000520657 GLI3P10071 1580 aa14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1-202ENST00000520657 SHANK3Q9BYB0 1731 aa14.93□□□□□ -0.02
EIF4EBP1-202ENST00000520657 CCDC27Q2M243 656 aa14.92□□□□□ -0.02
EIF4EBP1-202ENST00000520657 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
EIF4EBP1-202ENST00000520657 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
EIF4EBP1-202ENST00000520657 USHBP1Q8N6Y0 703 aa14.92□□□□□ -0.02
EIF4EBP1-202ENST00000520657 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
EIF4EBP1-202ENST00000520657 LRRC37A3O60309 1634 aa14.92□□□□□ -0.02
EIF4EBP1-202ENST00000520657 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa14.91□□□□□ -0.02
EIF4EBP1-202ENST00000520657 LMOD3Q0VAK6 560 aa14.91□□□□□ -0.02
EIF4EBP1-202ENST00000520657 NFE2L2Q16236 605 aa14.91□□□□□ -0.02
EIF4EBP1-202ENST00000520657 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
EIF4EBP1-202ENST00000520657 SPG7Q9UQ90 795 aa14.91□□□□□ -0.02
EIF4EBP1-202ENST00000520657 TNS2Q63HR2 1409 aa14.91□□□□□ -0.02
EIF4EBP1-202ENST00000520657 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
EIF4EBP1-202ENST00000520657 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
EIF4EBP1-202ENST00000520657 TMPOP42166 694 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
EIF4EBP1-202ENST00000520657 CCDC146Q8IYE0 955 aa14.9□□□□□ -0.02
EIF4EBP1-202ENST00000520657 APAF1O14727 1248 aa14.89□□□□□ -0.03
EIF4EBP1-202ENST00000520657 PHACTR3Q96KR7 559 aa14.89□□□□□ -0.03
EIF4EBP1-202ENST00000520657 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
EIF4EBP1-202ENST00000520657 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa14.89□□□□□ -0.03
EIF4EBP1-202ENST00000520657 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa14.89□□□□□ -0.03
EIF4EBP1-202ENST00000520657 SCN11AQ9UI33 1791 aa14.88□□□□□ -0.03
EIF4EBP1-202ENST00000520657 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
EIF4EBP1-202ENST00000520657 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
EIF4EBP1-202ENST00000520657 ZBED9Q6R2W3 1325 aa14.88□□□□□ -0.03
EIF4EBP1-202ENST00000520657 MAP3K5Q99683 1374 aa14.87□□□□□ -0.03
EIF4EBP1-202ENST00000520657 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
EIF4EBP1-202ENST00000520657 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
EIF4EBP1-202ENST00000520657 AKAP4Q5JQC9 854 aa14.87□□□□□ -0.03
EIF4EBP1-202ENST00000520657 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
EIF4EBP1-202ENST00000520657 USP35Q9P2H5 1018 aa14.87□□□□□ -0.03
EIF4EBP1-202ENST00000520657 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
EIF4EBP1-202ENST00000520657 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.03
EIF4EBP1-202ENST00000520657 C1orf141Q5JVX7 400 aa14.86□□□□□ -0.03
EIF4EBP1-202ENST00000520657 GNAT3A8MTJ3 354 aa14.85□□□□□ -0.03
EIF4EBP1-202ENST00000520657 EXOC5O00471 708 aa14.85□□□□□ -0.03
EIF4EBP1-202ENST00000520657 RIPK4P57078 832 aa14.85□□□□□ -0.03
EIF4EBP1-202ENST00000520657 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
EIF4EBP1-202ENST00000520657 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
EIF4EBP1-202ENST00000520657 IFNL2Q8IZJ0 200 aa14.85□□□□□ -0.03
EIF4EBP1-202ENST00000520657 ZNF521Q96K83 1311 aa14.85□□□□□ -0.03
EIF4EBP1-202ENST00000520657 BCL9O00512 1426 aa14.84□□□□□ -0.03
EIF4EBP1-202ENST00000520657 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
EIF4EBP1-202ENST00000520657 DDB1Q16531 1140 aa14.84□□□□□ -0.03
EIF4EBP1-202ENST00000520657 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa14.84□□□□□ -0.03
EIF4EBP1-202ENST00000520657 MRC1P22897 1456 aa14.83□□□□□ -0.03
EIF4EBP1-202ENST00000520657 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
EIF4EBP1-202ENST00000520657 PHKG2P15735 406 aa14.83□□□□□ -0.04
EIF4EBP1-202ENST00000520657 PDE3BQ13370 1112 aa14.83□□□□□ -0.04
EIF4EBP1-202ENST00000520657 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
EIF4EBP1-202ENST00000520657 WDR63Q8IWG1 891 aa14.83□□□□□ -0.04
EIF4EBP1-202ENST00000520657 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
EIF4EBP1-202ENST00000520657 IL16Q14005 1332 aa14.83□□□□□ -0.04
EIF4EBP1-202ENST00000520657 WWC1Q8IX03 1113 aa14.82□□□□□ -0.04
EIF4EBP1-202ENST00000520657 DCAF5Q96JK2 942 aa14.82□□□□□ -0.04
EIF4EBP1-202ENST00000520657 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
EIF4EBP1-202ENST00000520657 TRIM35Q9UPQ4 493 aa14.82□□□□□ -0.04
EIF4EBP1-202ENST00000520657 CYP27B1O15528 508 aa14.81□□□□□ -0.04
EIF4EBP1-202ENST00000520657 BABAM1Q9NWV8 329 aa14.81□□□□□ -0.04
EIF4EBP1-202ENST00000520657 BRWD3Q6RI45 1802 aa14.8□□□□□ -0.04
EIF4EBP1-202ENST00000520657 RXRBP28702 533 aa14.8□□□□□ -0.04
EIF4EBP1-202ENST00000520657 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
EIF4EBP1-202ENST00000520657 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
EIF4EBP1-202ENST00000520657 ITGB4P16144 1822 aa14.78□□□□□ -0.04
EIF4EBP1-202ENST00000520657 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa14.78□□□□□ -0.04
EIF4EBP1-202ENST00000520657 ERVV-2B6SEH9 535 aa14.78□□□□□ -0.04
EIF4EBP1-202ENST00000520657 NEUROD2Q15784 382 aa14.78□□□□□ -0.04
EIF4EBP1-202ENST00000520657 SEPT12Q8IYM1 358 aa14.78□□□□□ -0.04
EIF4EBP1-202ENST00000520657 DOT1LQ8TEK3 1739 aa14.78□□□□□ -0.04
EIF4EBP1-202ENST00000520657 RNMTO43148 476 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
EIF4EBP1-202ENST00000520657 GOLGA2Q08379 1002 aa14.77□□□□□ -0.05
EIF4EBP1-202ENST00000520657 IL17REQ8NFR9 667 aa14.77□□□□□ -0.05
EIF4EBP1-202ENST00000520657 SBF2Q86WG5 1849 aa14.77□□□□□ -0.05
EIF4EBP1-202ENST00000520657 KDM3BQ7LBC6 1761 aa14.77□□□□□ -0.05
EIF4EBP1-202ENST00000520657 E9PSI1 815 aa14.76□□□□□ -0.05
EIF4EBP1-202ENST00000520657 IFT57Q9NWB7 429 aa14.76□□□□□ -0.05
EIF4EBP1-202ENST00000520657 NHSQ6T4R5 1651 aa14.76□□□□□ -0.05
EIF4EBP1-202ENST00000520657 PAPPAQ13219 1627 aa14.75□□□□□ -0.05
EIF4EBP1-202ENST00000520657 GNAI1P63096 354 aa14.75□□□□□ -0.05
EIF4EBP1-202ENST00000520657 POTEAQ6S8J7 498 aa14.75□□□□□ -0.05
EIF4EBP1-202ENST00000520657 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
EIF4EBP1-202ENST00000520657 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
EIF4EBP1-202ENST00000520657 CFAP44Q96MT7 982 aa14.75□□□□□ -0.05
EIF4EBP1-202ENST00000520657 RGS12O14924 1447 aa14.75□□□□□ -0.05
EIF4EBP1-202ENST00000520657 A0A0G2JS52 829 aa14.74□□□□□ -0.05
EIF4EBP1-202ENST00000520657 ZNF853P0CG23 659 aa14.74□□□□□ -0.05
EIF4EBP1-202ENST00000520657 MYT1Q01538 1121 aa14.74□□□□□ -0.05
EIF4EBP1-202ENST00000520657 TEFQ10587 303 aa14.74□□□□□ -0.05
EIF4EBP1-202ENST00000520657 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa14.74□□□□□ -0.05
EIF4EBP1-202ENST00000520657 MCM10Q7L590 875 aa14.74□□□□□ -0.05
EIF4EBP1-202ENST00000520657 MYH16Q9H6N6 1097 aa14.74□□□□□ -0.05
EIF4EBP1-202ENST00000520657 SLC52A2Q9HAB3 445 aa14.74□□□□□ -0.05
EIF4EBP1-202ENST00000520657 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
EIF4EBP1-202ENST00000520657 KRT27Q7Z3Y8 459 aa14.73□□□□□ -0.05
EIF4EBP1-202ENST00000520657 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
EIF4EBP1-202ENST00000520657 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms