RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 TJAP1Q5JTD0 557 aa3.34□□□□□ -1.87
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RNU6-548P-201ENST00000517083 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARHGEF10O15013 1369 aa3.34□□□□□ -1.88
RNU6-548P-201ENST00000517083 ERBINQ96RT1 1412 aa3.34□□□□□ -1.88
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RNU6-548P-201ENST00000517083 TRANK1O15050 2925 aa3.33□□□□□ -1.88
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RNU6-548P-201ENST00000517083 EN2P19622 333 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
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RNU6-548P-201ENST00000517083 ST18O60284 1047 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-548P-201ENST00000517083 ITGB8P26012 769 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-548P-201ENST00000517083 CHRNA2Q15822 529 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-548P-201ENST00000517083 AKAP4Q5JQC9 854 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-548P-201ENST00000517083 DPY19L2Q6NUT2 758 aa3.32□□□□□ -1.88
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RNU6-548P-201ENST00000517083 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
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RNU6-548P-201ENST00000517083 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-548P-201ENST00000517083 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-548P-201ENST00000517083 IQCA1LA6NCM1 817 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-548P-201ENST00000517083 RGL2O15211 777 aa3.28□□□□□ -1.88
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RNU6-548P-201ENST00000517083 NOGQ13253 232 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-548P-201ENST00000517083 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-548P-201ENST00000517083 ANKRD24Q8TF21 1146 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM161BQ96MY7 647 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-548P-201ENST00000517083 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-548P-201ENST00000517083 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-548P-201ENST00000517083 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-548P-201ENST00000517083 RNF186Q9NXI6 227 aa3.28□□□□□ -1.88
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