RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511105.1

PTPN13-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 13, human

TSL 3

Gene PTPN13, Length 645 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN13-208	ENST00000511105	TRIM47	Q96LD4	638 aa		7.71	□□□□□ -1.18
PTPN13-208	ENST00000511105	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		7.71	□□□□□ -1.18
PTPN13-208	ENST00000511105	KIF27	Q86VH2	1401 aa		7.7	□□□□□ -1.18
PTPN13-208	ENST00000511105	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	7.7	□□□□□ -1.18
PTPN13-208	ENST00000511105	ZFP42	Q96MM3	310 aa		7.7	□□□□□ -1.18
PTPN13-208	ENST00000511105	ADAMTS12	P58397	1594 aa		7.7	□□□□□ -1.18
PTPN13-208	ENST00000511105	TIMP2	P16035	220 aa		7.69	□□□□□ -1.18
PTPN13-208	ENST00000511105	LCE2C	Q5TA81	110 aa		7.69	□□□□□ -1.18
PTPN13-208	ENST00000511105	WWC1	Q8IX03	1113 aa		7.69	□□□□□ -1.18
PTPN13-208	ENST00000511105	ITPKC	Q96DU7	683 aa		7.69	□□□□□ -1.18
PTPN13-208	ENST00000511105	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	7.69	□□□□□ -1.18
PTPN13-208	ENST00000511105	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		7.69	□□□□□ -1.18
PTPN13-208	ENST00000511105	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	7.69	□□□□□ -1.18
PTPN13-208	ENST00000511105	WFS1	O76024	890 aa		7.68	□□□□□ -1.18
PTPN13-208	ENST00000511105	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	7.68	□□□□□ -1.18
PTPN13-208	ENST00000511105	ADH1C	P00326	375 aa		7.68	□□□□□ -1.18
PTPN13-208	ENST00000511105	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	7.68	□□□□□ -1.18
PTPN13-208	ENST00000511105	SENP2	Q9HC62	589 aa		7.68	□□□□□ -1.18
PTPN13-208	ENST00000511105	NUP160	Q12769	1436 aa		7.68	□□□□□ -1.18
PTPN13-208	ENST00000511105	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		7.68	□□□□□ -1.18
PTPN13-208	ENST00000511105	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	7.67	□□□□□ -1.18
PTPN13-208	ENST00000511105	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		7.67	□□□□□ -1.18
PTPN13-208	ENST00000511105	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		7.67	□□□□□ -1.18
PTPN13-208	ENST00000511105	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		7.67	□□□□□ -1.18
PTPN13-208	ENST00000511105	CDK15	Q96Q40	435 aa		7.67	□□□□□ -1.18
PTPN13-208	ENST00000511105	FSHR	P23945	695 aa		7.66	□□□□□ -1.18
PTPN13-208	ENST00000511105	IRF5	Q13568	498 aa		7.66	□□□□□ -1.18
PTPN13-208	ENST00000511105	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	7.66	□□□□□ -1.18
PTPN13-208	ENST00000511105	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		7.66	□□□□□ -1.18
PTPN13-208	ENST00000511105	GLMN	Q92990	594 aa		7.66	□□□□□ -1.18
PTPN13-208	ENST00000511105	WIPF1	O43516	503 aa		7.65	□□□□□ -1.18
PTPN13-208	ENST00000511105	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	7.65	□□□□□ -1.18
PTPN13-208	ENST00000511105	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		7.65	□□□□□ -1.18
PTPN13-208	ENST00000511105	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	7.64	□□□□□ -1.19
PTPN13-208	ENST00000511105	PDE4C	Q08493	712 aa		7.64	□□□□□ -1.19
PTPN13-208	ENST00000511105	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		7.64	□□□□□ -1.19
PTPN13-208	ENST00000511105	ERFE	Q4G0M1	354 aa		7.64	□□□□□ -1.19
PTPN13-208	ENST00000511105	NBPF14	Q5TI25	921 aa		7.64	□□□□□ -1.19
PTPN13-208	ENST00000511105	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		7.64	□□□□□ -1.19
PTPN13-208	ENST00000511105	MPND	Q8N594	471 aa		7.64	□□□□□ -1.19
PTPN13-208	ENST00000511105	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		7.64	□□□□□ -1.19
PTPN13-208	ENST00000511105	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		7.64	□□□□□ -1.19
PTPN13-208	ENST00000511105	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		7.64	□□□□□ -1.19
PTPN13-208	ENST00000511105	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		7.64	□□□□□ -1.19
PTPN13-208	ENST00000511105	POM121C	A8CG34	1229 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PTPN13-208	ENST00000511105	USP17L8	P0C7I0	530 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PTPN13-208	ENST00000511105	RAB15	P59190	212 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PTPN13-208	ENST00000511105	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	7.63	□□□□□ -1.19
PTPN13-208	ENST00000511105	RGS22	Q8NE09	1264 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PTPN13-208	ENST00000511105	KIFC2	Q96AC6	838 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PTPN13-208	ENST00000511105	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	7.63	□□□□□ -1.19
PTPN13-208	ENST00000511105	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PTPN13-208	ENST00000511105	UST	Q9Y2C2	406 aa		7.63	□□□□□ -1.19
PTPN13-208	ENST00000511105	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	7.62	□□□□□ -1.19
PTPN13-208	ENST00000511105	ABL2	P42684	1182 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PTPN13-208	ENST00000511105	CBLB	Q13191	982 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PTPN13-208	ENST00000511105	NR5A1	Q13285	461 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PTPN13-208	ENST00000511105	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PTPN13-208	ENST00000511105	ZBTB33	Q86T24	672 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PTPN13-208	ENST00000511105	GPR37L1	O60883	481 aa		7.61	□□□□□ -1.19
PTPN13-208	ENST00000511105	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		7.61	□□□□□ -1.19
PTPN13-208	ENST00000511105	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
PTPN13-208	ENST00000511105	PTPRG	P23470	1445 aa		7.61	□□□□□ -1.19
PTPN13-208	ENST00000511105	BMP2	P12643	396 aa		7.6	□□□□□ -1.19
PTPN13-208	ENST00000511105	SCARF1	Q14162	830 aa		7.6	□□□□□ -1.19
PTPN13-208	ENST00000511105	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		7.6	□□□□□ -1.19
PTPN13-208	ENST00000511105	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		7.6	□□□□□ -1.19
PTPN13-208	ENST00000511105	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		7.6	□□□□□ -1.19
PTPN13-208	ENST00000511105	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
PTPN13-208	ENST00000511105	ADAM32	Q8TC27	787 aa		7.59	□□□□□ -1.19
PTPN13-208	ENST00000511105	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		7.59	□□□□□ -1.19
PTPN13-208	ENST00000511105	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
PTPN13-208	ENST00000511105	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		7.59	□□□□□ -1.19
PTPN13-208	ENST00000511105	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PTPN13-208	ENST00000511105	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
PTPN13-208	ENST00000511105	KCNA1	Q09470	495 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PTPN13-208	ENST00000511105	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PTPN13-208	ENST00000511105	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PTPN13-208	ENST00000511105	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PTPN13-208	ENST00000511105	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PTPN13-208	ENST00000511105	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
PTPN13-208	ENST00000511105	SHROOM2	Q13796	1616 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PTPN13-208	ENST00000511105	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		7.57	□□□□□ -1.2
PTPN13-208	ENST00000511105	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
PTPN13-208	ENST00000511105	ERBB4	Q15303	1308 aa		7.56	□□□□□ -1.2
PTPN13-208	ENST00000511105	BRD1	O95696	1058 aa		7.56	□□□□□ -1.2
PTPN13-208	ENST00000511105	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
PTPN13-208	ENST00000511105	PTK2	Q05397	1052 aa		7.56	□□□□□ -1.2
PTPN13-208	ENST00000511105	WASHC4	Q2M389	1173 aa		7.56	□□□□□ -1.2
PTPN13-208	ENST00000511105	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		7.56	□□□□□ -1.2
PTPN13-208	ENST00000511105	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		7.56	□□□□□ -1.2
PTPN13-208	ENST00000511105	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
PTPN13-208	ENST00000511105	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		7.56	□□□□□ -1.2
PTPN13-208	ENST00000511105	CUL7	Q14999	1698 aa		7.55	□□□□□ -1.2
PTPN13-208	ENST00000511105	MAN1A2	O60476	641 aa		7.55	□□□□□ -1.2
PTPN13-208	ENST00000511105	GMPR	P36959	345 aa		7.55	□□□□□ -1.2
PTPN13-208	ENST00000511105	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	7.55	□□□□□ -1.2
PTPN13-208	ENST00000511105	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		7.55	□□□□□ -1.2
PTPN13-208	ENST00000511105	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		7.54	□□□□□ -1.2
PTPN13-208	ENST00000511105	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms