RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP35.99■■■■□ 3.35
SH3BP2-212ENST00000508338 KDRP35968 1356 aa35.99■■■■□ 3.35
SH3BP2-212ENST00000508338 BCL9O00512 1426 aa35.99■■■■□ 3.35
SH3BP2-212ENST00000508338 SPG7Q9UQ90 795 aa35.96■■■■□ 3.35
SH3BP2-212ENST00000508338 SULT6B1Q6IMI4 303 aa35.95■■■■□ 3.35
SH3BP2-212ENST00000508338 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP35.94■■■■□ 3.34
SH3BP2-212ENST00000508338 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa35.93■■■■□ 3.34
SH3BP2-212ENST00000508338 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa35.93■■■■□ 3.34
SH3BP2-212ENST00000508338 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP35.93■■■■□ 3.34
SH3BP2-212ENST00000508338 PKD1L3Q7Z443 1732 aa35.93■■■■□ 3.34
SH3BP2-212ENST00000508338 EP400Q96L91 3159 aa35.93■■■■□ 3.34
SH3BP2-212ENST00000508338 ANP32CO43423 234 aa35.92■■■■□ 3.34
SH3BP2-212ENST00000508338 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
SH3BP2-212ENST00000508338 AMOTQ4VCS5 1084 aa35.9■■■■□ 3.34
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM182BQ5T319 152 aa35.89■■■■□ 3.34
SH3BP2-212ENST00000508338 SHANK3Q9BYB0 1731 aa35.88■■■■□ 3.34
SH3BP2-212ENST00000508338 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.33
SH3BP2-212ENST00000508338 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
SH3BP2-212ENST00000508338 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.33
SH3BP2-212ENST00000508338 AEBP1Q8IUX7 1158 aa35.86■■■■□ 3.33
SH3BP2-212ENST00000508338 HMOX1P09601 288 aa35.83■■■■□ 3.33
SH3BP2-212ENST00000508338 SBF2Q86WG5 1849 aa35.83■■■■□ 3.33
SH3BP2-212ENST00000508338 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP35.82■■■■□ 3.32
SH3BP2-212ENST00000508338 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP35.82■■■■□ 3.32
SH3BP2-212ENST00000508338 IFNL2Q8IZJ0 200 aa35.8■■■■□ 3.32
SH3BP2-212ENST00000508338 FCHSD2O94868 740 aa35.79■■■■□ 3.32
SH3BP2-212ENST00000508338 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP35.79■■■■□ 3.32
SH3BP2-212ENST00000508338 TRIM37O94972 964 aa35.78■■■■□ 3.32
SH3BP2-212ENST00000508338 CYP27B1O15528 508 aa35.77■■■■□ 3.32
SH3BP2-212ENST00000508338 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
SH3BP2-212ENST00000508338 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
SH3BP2-212ENST00000508338 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP35.76■■■■□ 3.32
SH3BP2-212ENST00000508338 NHSQ6T4R5 1651 aa35.75■■■■□ 3.31
SH3BP2-212ENST00000508338 KAT6BQ8WYB5 2073 aa35.74■■■■□ 3.31
SH3BP2-212ENST00000508338 PHKG2P15735 406 aa35.74■■■■□ 3.31
SH3BP2-212ENST00000508338 C1orf141Q5JVX7 400 aa35.74■■■■□ 3.31
SH3BP2-212ENST00000508338 RSPH6AQ9H0K4 717 aa35.74■■■■□ 3.31
SH3BP2-212ENST00000508338 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
SH3BP2-212ENST00000508338 BAG6P46379 1132 aa35.73■■■■□ 3.31
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
SH3BP2-212ENST00000508338 NEFMP07197 916 aa35.72■■■■□ 3.31
SH3BP2-212ENST00000508338 PRKAR2BP31323 418 aa35.7■■■■□ 3.31
SH3BP2-212ENST00000508338 GAS2L2Q8NHY3 880 aa35.69■■■■□ 3.3
SH3BP2-212ENST00000508338 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP35.68■■■■□ 3.3
SH3BP2-212ENST00000508338 AKAP4Q5JQC9 854 aa35.68■■■■□ 3.3
SH3BP2-212ENST00000508338 DOT1LQ8TEK3 1739 aa35.68■■■■□ 3.3
SH3BP2-212ENST00000508338 APBA3O96018 575 aa35.67■■■■□ 3.3
SH3BP2-212ENST00000508338 DCAF5Q96JK2 942 aa35.67■■■■□ 3.3
SH3BP2-212ENST00000508338 ACSBG1Q96GR2 724 aa35.66■■■■□ 3.3
SH3BP2-212ENST00000508338 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
SH3BP2-212ENST00000508338 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP35.62■■■■□ 3.29
SH3BP2-212ENST00000508338 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa35.62■■■■□ 3.29
SH3BP2-212ENST00000508338 PLSCR1O15162 318 aa35.62■■■■□ 3.29
SH3BP2-212ENST00000508338 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
SH3BP2-212ENST00000508338 KCNQ2O43526 872 aa35.61■■■■□ 3.29
SH3BP2-212ENST00000508338 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
SH3BP2-212ENST00000508338 ERVV-2B6SEH9 535 aa35.6■■■■□ 3.29
SH3BP2-212ENST00000508338 BTAF1O14981 1849 aa35.59■■■■□ 3.29
SH3BP2-212ENST00000508338 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa35.57■■■■□ 3.29
SH3BP2-212ENST00000508338 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa35.57■■■■□ 3.28
SH3BP2-212ENST00000508338 ITGB4P16144 1822 aa35.56■■■■□ 3.28
SH3BP2-212ENST00000508338 DEFB132Q7Z7B7 95 aa35.56■■■■□ 3.28
SH3BP2-212ENST00000508338 PHACTR3Q96KR7 559 aa35.56■■■■□ 3.28
SH3BP2-212ENST00000508338 MAP3K5Q99683 1374 aa35.55■■■■□ 3.28
SH3BP2-212ENST00000508338 PLEKHF1Q96S99 279 aa35.55■■■■□ 3.28
SH3BP2-212ENST00000508338 MRS2Q9HD23 443 aa35.55■■■■□ 3.28
SH3BP2-212ENST00000508338 SCN11AQ9UI33 1791 aa35.54■■■■□ 3.28
SH3BP2-212ENST00000508338 GNAT3A8MTJ3 354 aa35.54■■■■□ 3.28
SH3BP2-212ENST00000508338 TMOD3Q9NYL9 352 aa35.54■■■■□ 3.28
SH3BP2-212ENST00000508338 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP35.53■■■■□ 3.28
SH3BP2-212ENST00000508338 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP35.53■■■■□ 3.28
SH3BP2-212ENST00000508338 PTF1AQ7RTS3 328 aa35.53■■■■□ 3.28
SH3BP2-212ENST00000508338 CAMKK2Q96RR4 588 aa35.53■■■■□ 3.28
SH3BP2-212ENST00000508338 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa35.52■■■■□ 3.28
SH3BP2-212ENST00000508338 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.28
SH3BP2-212ENST00000508338 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
SH3BP2-212ENST00000508338 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
SH3BP2-212ENST00000508338 CABP4P57796 275 aa35.5■■■■□ 3.27
SH3BP2-212ENST00000508338 ADAMTS8Q9UP79 889 aa35.5■■■■□ 3.27
SH3BP2-212ENST00000508338 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa35.49■■■■□ 3.27
SH3BP2-212ENST00000508338 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP35.49■■■■□ 3.27
SH3BP2-212ENST00000508338 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
SH3BP2-212ENST00000508338 RNMTO43148 476 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
SH3BP2-212ENST00000508338 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
SH3BP2-212ENST00000508338 RUNDC1Q96C34 613 aa35.47■■■■□ 3.27
SH3BP2-212ENST00000508338 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
SH3BP2-212ENST00000508338 PIGBQ92521 554 aa35.46■■■■□ 3.27
SH3BP2-212ENST00000508338 NFE2L2Q16236 605 aa35.45■■■■□ 3.27
SH3BP2-212ENST00000508338 RREB1Q92766 1687 aa35.44■■■■□ 3.26
SH3BP2-212ENST00000508338 MRC1P22897 1456 aa35.44■■■■□ 3.26
SH3BP2-212ENST00000508338 CCDC184Q52MB2 194 aa35.44■■■■□ 3.26
SH3BP2-212ENST00000508338 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP35.44■■■■□ 3.26
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC52A2Q9HAB3 445 aa35.43■■■■□ 3.26
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC27A3Q5K4L6 730 aa35.42■■■■□ 3.26
SH3BP2-212ENST00000508338 TXNRD1Q16881 649 aa35.41■■■■□ 3.26
SH3BP2-212ENST00000508338 LGR6Q9HBX8 967 aa35.41■■■■□ 3.26
SH3BP2-212ENST00000508338 LY75O60449 1722 aa35.4■■■■□ 3.26
SH3BP2-212ENST00000508338 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa35.39■■■■□ 3.26
SH3BP2-212ENST00000508338 CCER2I3L3R5 266 aa35.39■■■■□ 3.26
SH3BP2-212ENST00000508338 LMOD3Q0VAK6 560 aa35.39■■■■□ 3.26
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