RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MEGF6O75095 1541 aa32.16■■■□□ 2.74
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BTAF1O14981 1849 aa32.14■■■□□ 2.74
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PANK3Q9H999 370 aa32.14■■■□□ 2.74
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TATP17735 454 aaPredicted RBP32.13■■■□□ 2.73
HOXC-AS1-201ENST00000505700 STK32BQ9NY57 414 aa32.13■■■□□ 2.73
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP32.12■■■□□ 2.73
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP32.12■■■□□ 2.73
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SPON1Q9HCB6 807 aa32.11■■■□□ 2.73
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP32.09■■■□□ 2.73
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP32.09■■■□□ 2.73
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SHANK3Q9BYB0 1731 aa32.08■■■□□ 2.73
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC15A2Q16348 729 aa32.07■■■□□ 2.72
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WASHC2AQ641Q2 1341 aa32.06■■■□□ 2.72
HOXC-AS1-201ENST00000505700 POLKQ9UBT6 870 aa32.06■■■□□ 2.72
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP32.05■■■□□ 2.72
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa32.05■■■□□ 2.72
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DOT1LQ8TEK3 1739 aa32.04■■■□□ 2.72
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP32.03■■■□□ 2.72
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CASZ1Q86V15 1759 aa32.01■■■□□ 2.71
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa32■■■□□ 2.71
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa32■■■□□ 2.71
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZBTB7AO95365 584 aa31.99■■■□□ 2.71
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LRRC4BQ9NT99 713 aa31.99■■■□□ 2.71
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC27A3Q5K4L6 730 aa31.98■■■□□ 2.71
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EYA1Q99502 592 aa31.98■■■□□ 2.71
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NSD2O96028 1365 aa31.97■■■□□ 2.71
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KNSTRNQ9Y448 316 aa31.97■■■□□ 2.71
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MORC1Q86VD1 984 aa31.96■■■□□ 2.71
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP31.95■■■□□ 2.71
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PAPPAQ13219 1627 aa31.93■■■□□ 2.7
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CYP27B1O15528 508 aa31.93■■■□□ 2.7
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP31.93■■■□□ 2.7
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SPG7Q9UQ90 795 aa31.93■■■□□ 2.7
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIF7Q2M1P5 1343 aa31.93■■■□□ 2.7
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NCAPD2Q15021 1401 aa31.92■■■□□ 2.7
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KCNQ4P56696 695 aa31.92■■■□□ 2.7
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF827Q17R98 1081 aa31.92■■■□□ 2.7
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PKD1L3Q7Z443 1732 aa31.89■■■□□ 2.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa31.88■■■□□ 2.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AKT1S1Q96B36 256 aa31.88■■■□□ 2.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MTFR1LQ9H019 292 aa31.88■■■□□ 2.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP31.88■■■□□ 2.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LY75O60449 1722 aa31.88■■■□□ 2.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PTGER2P43116 358 aa31.85■■■□□ 2.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP31.85■■■□□ 2.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa31.84■■■□□ 2.69
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP31.82■■■□□ 2.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGSF1Q8N6C5 1336 aa31.8■■■□□ 2.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ITGB4P16144 1822 aa31.8■■■□□ 2.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP31.8■■■□□ 2.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IFNL2Q8IZJ0 200 aa31.8■■■□□ 2.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa31.79■■■□□ 2.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DCAF8L1A6NGE4 600 aa31.78■■■□□ 2.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PALLDQ8WX93 1383 aa31.78■■■□□ 2.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PHKG2P15735 406 aa31.77■■■□□ 2.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PIGBQ92521 554 aa31.77■■■□□ 2.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP31.77■■■□□ 2.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa31.76■■■□□ 2.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 QSER1Q2KHR3 1735 aa31.76■■■□□ 2.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC16A10Q8TF71 515 aa31.76■■■□□ 2.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SGIP1Q9BQI5 828 aa31.75■■■□□ 2.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP31.74■■■□□ 2.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMOD3Q9NYL9 352 aa31.74■■■□□ 2.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa31.73■■■□□ 2.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP31.73■■■□□ 2.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARXQ96QS3 562 aa31.73■■■□□ 2.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP31.72■■■□□ 2.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MSH5O43196 834 aa31.72■■■□□ 2.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP31.72■■■□□ 2.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa31.71■■■□□ 2.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AEBP1Q8IUX7 1158 aa31.69■■■□□ 2.66
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C5P01031 1676 aa31.69■■■□□ 2.66
HOXC-AS1-201ENST00000505700 POLD1P28340 1107 aa31.68■■■□□ 2.66
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MTHFSP49914 203 aa31.68■■■□□ 2.66
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AMOTQ4VCS5 1084 aa31.68■■■□□ 2.66
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SULT6B1Q6IMI4 303 aa31.68■■■□□ 2.66
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SYT17Q9BSW7 474 aa31.68■■■□□ 2.66
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IL13P35225 146 aa31.67■■■□□ 2.66
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP31.67■■■□□ 2.66
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP31.67■■■□□ 2.66
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP31.66■■■□□ 2.66
HOXC-AS1-201ENST00000505700 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP31.66■■■□□ 2.66
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TAF1LQ8IZX4 1826 aa31.65■■■□□ 2.66
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ASAP1Q9ULH1 1129 aa31.65■■■□□ 2.66
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa31.63■■■□□ 2.65
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SIK1P57059 783 aa31.63■■■□□ 2.65
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DCAF5Q96JK2 942 aa31.63■■■□□ 2.65
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ERVV-2B6SEH9 535 aa31.62■■■□□ 2.65
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C1orf141Q5JVX7 400 aa31.62■■■□□ 2.65
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AK7Q96M32 723 aa31.62■■■□□ 2.65
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KLHL34Q8N239 644 aa31.61■■■□□ 2.65
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FLAD1Q8NFF5 587 aa31.61■■■□□ 2.65
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATG3Q9NT62 314 aa31.6■■■□□ 2.65
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C4BP0C0L5 1744 aa31.59■■■□□ 2.65
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KDRP35968 1356 aa31.58■■■□□ 2.65
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATP6V1AP38606 617 aa31.57■■■□□ 2.64
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CABP4P57796 275 aa31.57■■■□□ 2.64
HOXC-AS1-201ENST00000505700 COL24A1Q17RW2 1714 aa31.57■■■□□ 2.64
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa31.56■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 6.6 ms