RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498399.1

TIMMDC1-209, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TIMMDC1, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-209ENST00000498399 SEMA3FQ13275 785 aa8.29□□□□□ -1.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLFNL1Q499Z3 407 aa8.29□□□□□ -1.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa8.29□□□□□ -1.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 DNMT3LQ9UJW3 386 aa8.29□□□□□ -1.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 PTGIRP43119 386 aa8.28□□□□□ -1.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa8.28□□□□□ -1.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 RNF135Q8IUD6 432 aa8.28□□□□□ -1.08
TIMMDC1-209ENST00000498399 POM121CA8CG34 1229 aa8.27□□□□□ -1.09
TIMMDC1-209ENST00000498399 ERVK-9P63128 1117 aa8.27□□□□□ -1.09
TIMMDC1-209ENST00000498399 WWC1Q8IX03 1113 aa8.27□□□□□ -1.09
TIMMDC1-209ENST00000498399 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
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TIMMDC1-209ENST00000498399 OXLD1Q5BKU9 147 aa8.26□□□□□ -1.09
TIMMDC1-209ENST00000498399 PHTF2Q8N3S3 785 aa8.26□□□□□ -1.09
TIMMDC1-209ENST00000498399 DOLKQ9UPQ8 538 aa8.26□□□□□ -1.09
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TIMMDC1-209ENST00000498399 A0A1W2PRU2 124 aa8.23□□□□□ -1.09
TIMMDC1-209ENST00000498399 MYCP01106 439 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
TIMMDC1-209ENST00000498399 SOX11P35716 441 aa8.23□□□□□ -1.09
TIMMDC1-209ENST00000498399 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
TIMMDC1-209ENST00000498399 ALG2Q9H553 416 aa8.23□□□□□ -1.09
TIMMDC1-209ENST00000498399 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa8.23□□□□□ -1.09
TIMMDC1-209ENST00000498399 STAU1O95793 577 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP8.22□□□□□ -1.09
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TIMMDC1-209ENST00000498399 CYP2U1Q7Z449 544 aa8.22□□□□□ -1.09
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TIMMDC1-209ENST00000498399 RNF217Q8TC41 542 aa8.22□□□□□ -1.09
TIMMDC1-209ENST00000498399 TRIM52Q96A61 297 aa8.22□□□□□ -1.09
TIMMDC1-209ENST00000498399 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa8.22□□□□□ -1.09
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TIMMDC1-209ENST00000498399 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
TIMMDC1-209ENST00000498399 VWA5B2Q8N398 1253 aa8.1□□□□□ -1.11
TIMMDC1-209ENST00000498399 NBPF15Q8N660 670 aa8.1□□□□□ -1.11
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
TIMMDC1-209ENST00000498399 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa8.1□□□□□ -1.11
TIMMDC1-209ENST00000498399 USP17L3A6NCW0 530 aa8.09□□□□□ -1.11
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