RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497251.1

TRAPPC3-207, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC3, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-207ENST00000497251 USP47Q96K76 1375 aa23.52■■□□□ 1.36
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TRAPPC3-207ENST00000497251 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC3-207ENST00000497251 MYOM1P52179 1685 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZNF827Q17R98 1081 aa23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC3-207ENST00000497251 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC3-207ENST00000497251 POLD1P28340 1107 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC3-207ENST00000497251 INSRP06213 1382 aa23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC3-207ENST00000497251 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
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TRAPPC3-207ENST00000497251 NBPF4Q96M43 638 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3-207ENST00000497251 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.46■■□□□ 1.35
TRAPPC3-207ENST00000497251 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.46■■□□□ 1.35
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TRAPPC3-207ENST00000497251 FLT4P35916 1363 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC3-207ENST00000497251 QSER1Q2KHR3 1735 aa23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC3-207ENST00000497251 MEGF6O75095 1541 aa23.43■■□□□ 1.34
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TRAPPC3-207ENST00000497251 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC3-207ENST00000497251 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
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TRAPPC3-207ENST00000497251 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC3-207ENST00000497251 UTRNP46939 3433 aa23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC3-207ENST00000497251 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa23.39■■□□□ 1.33
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TRAPPC3-207ENST00000497251 LY75O60449 1722 aa23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC3-207ENST00000497251 CHD4Q14839 1912 aa23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC3-207ENST00000497251 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
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TRAPPC3-207ENST00000497251 COL24A1Q17RW2 1714 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC3-207ENST00000497251 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC3-207ENST00000497251 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC3-207ENST00000497251 GPR162Q16538 588 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC3-207ENST00000497251 CARD14Q9BXL6 1004 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC3-207ENST00000497251 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC3-207ENST00000497251 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC3-207ENST00000497251 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC3-207ENST00000497251 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.33■■□□□ 1.32
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TRAPPC3-207ENST00000497251 KCNQ4P56696 695 aa23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC3-207ENST00000497251 SPG7Q9UQ90 795 aa23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC3-207ENST00000497251 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa23.31■■□□□ 1.32
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TRAPPC3-207ENST00000497251 NSD3Q9BZ95 1437 aa23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC3-207ENST00000497251 CYP27B1O15528 508 aa23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC3-207ENST00000497251 NCAPD2Q15021 1401 aa23.3■■□□□ 1.32
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TRAPPC3-207ENST00000497251 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC3-207ENST00000497251 PALLDQ8WX93 1383 aa23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC3-207ENST00000497251 MSH5O43196 834 aa23.28■■□□□ 1.32
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TRAPPC3-207ENST00000497251 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa23.28■■□□□ 1.32
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TRAPPC3-207ENST00000497251 EYA1Q99502 592 aa23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC3-207ENST00000497251 POLKQ9UBT6 870 aa23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC3-207ENST00000497251 PKD1L3Q7Z443 1732 aa23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC3-207ENST00000497251 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC3-207ENST00000497251 C5P01031 1676 aa23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC3-207ENST00000497251 NLGN2Q8NFZ4 835 aa23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC3-207ENST00000497251 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.2■■□□□ 1.3
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TRAPPC3-207ENST00000497251 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa23.18■■□□□ 1.3
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TRAPPC3-207ENST00000497251 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.18■■□□□ 1.3
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TRAPPC3-207ENST00000497251 ITGB4P16144 1822 aa23.16■■□□□ 1.3
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TRAPPC3-207ENST00000497251 MSL1Q68DK7 614 aa23.14■■□□□ 1.29
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TRAPPC3-207ENST00000497251 IGSF1Q8N6C5 1336 aa23.11■■□□□ 1.29
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TRAPPC3-207ENST00000497251 ATP6V1AP38606 617 aa23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC3-207ENST00000497251 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC3-207ENST00000497251 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC3-207ENST00000497251 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC3-207ENST00000497251 PANK3Q9H999 370 aa23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC3-207ENST00000497251 LINC00116Q8NCU8 138 aa23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC3-207ENST00000497251 ATG3Q9NT62 314 aa23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC3-207ENST00000497251 UBR3Q6ZT12 1888 aa23.08■■□□□ 1.29
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