RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495399.1

C9orf135-204, Transcript of chromosome 9 open reading frame 135, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf135, Length 502 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-204ENST00000495399 CRB1P82279 1406 aa11.23□□□□□ -0.61
C9orf135-204ENST00000495399 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa11.23□□□□□ -0.61
C9orf135-204ENST00000495399 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa11.23□□□□□ -0.61
C9orf135-204ENST00000495399 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP11.22□□□□□ -0.61
C9orf135-204ENST00000495399 DDB1Q16531 1140 aa11.22□□□□□ -0.61
C9orf135-204ENST00000495399 KLRG1Q96E93 195 aa11.22□□□□□ -0.61
C9orf135-204ENST00000495399 TULP4Q9NRJ4 1543 aa11.22□□□□□ -0.61
C9orf135-204ENST00000495399 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
C9orf135-204ENST00000495399 NUTM2GQ5VZR2 741 aa11.21□□□□□ -0.61
C9orf135-204ENST00000495399 KLHL34Q8N239 644 aa11.21□□□□□ -0.61
C9orf135-204ENST00000495399 SLAIN1Q8ND83 568 aa11.21□□□□□ -0.61
C9orf135-204ENST00000495399 SLC16A10Q8TF71 515 aa11.21□□□□□ -0.61
C9orf135-204ENST00000495399 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
C9orf135-204ENST00000495399 LRRC4BQ9NT99 713 aa11.21□□□□□ -0.61
C9orf135-204ENST00000495399 NHSQ6T4R5 1651 aa11.2□□□□□ -0.62
C9orf135-204ENST00000495399 USP19O94966 1318 aa11.2□□□□□ -0.62
C9orf135-204ENST00000495399 TTLL13PA6NNM8 815 aa11.2□□□□□ -0.62
C9orf135-204ENST00000495399 ST18O60284 1047 aa11.2□□□□□ -0.62
C9orf135-204ENST00000495399 HTRA3P83110 453 aa11.2□□□□□ -0.62
C9orf135-204ENST00000495399 COL18A1P39060 1754 aa11.2□□□□□ -0.62
C9orf135-204ENST00000495399 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa11.19□□□□□ -0.62
C9orf135-204ENST00000495399 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa11.19□□□□□ -0.62
C9orf135-204ENST00000495399 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
C9orf135-204ENST00000495399 BTAF1O14981 1849 aa11.17□□□□□ -0.62
C9orf135-204ENST00000495399 TOMM70O94826 608 aa11.17□□□□□ -0.62
C9orf135-204ENST00000495399 POLD1P28340 1107 aa11.17□□□□□ -0.62
C9orf135-204ENST00000495399 MMRN1Q13201 1228 aa11.17□□□□□ -0.62
C9orf135-204ENST00000495399 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
C9orf135-204ENST00000495399 CFAP70Q5T0N1 1121 aa11.16□□□□□ -0.62
C9orf135-204ENST00000495399 IER5LQ5T953 404 aa11.16□□□□□ -0.62
C9orf135-204ENST00000495399 WWC3Q9ULE0 1092 aa11.16□□□□□ -0.62
C9orf135-204ENST00000495399 WASLO00401 505 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
C9orf135-204ENST00000495399 RGL3Q3MIN7 710 aa11.15□□□□□ -0.62
C9orf135-204ENST00000495399 TRIM35Q9UPQ4 493 aa11.15□□□□□ -0.62
C9orf135-204ENST00000495399 GCP02774 474 aa11.14□□□□□ -0.63
C9orf135-204ENST00000495399 ADGRB1O14514 1584 aa11.14□□□□□ -0.63
C9orf135-204ENST00000495399 ITSN1Q15811 1721 aa11.14□□□□□ -0.63
C9orf135-204ENST00000495399 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
C9orf135-204ENST00000495399 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
C9orf135-204ENST00000495399 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
C9orf135-204ENST00000495399 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
C9orf135-204ENST00000495399 SPNS2Q8IVW8 549 aa11.12□□□□□ -0.63
C9orf135-204ENST00000495399 POGKQ9P215 609 aa11.12□□□□□ -0.63
C9orf135-204ENST00000495399 AXIN2Q9Y2T1 843 aa11.12□□□□□ -0.63
C9orf135-204ENST00000495399 ACSBG1Q96GR2 724 aa11.11□□□□□ -0.63
C9orf135-204ENST00000495399 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
C9orf135-204ENST00000495399 RGPD5Q99666 1765 aa11.11□□□□□ -0.63
C9orf135-204ENST00000495399 WDR17Q8IZU2 1322 aa11.1□□□□□ -0.63
C9orf135-204ENST00000495399 USP6P35125 1406 aa11.1□□□□□ -0.63
C9orf135-204ENST00000495399 TNS2Q63HR2 1409 aa11.1□□□□□ -0.63
C9orf135-204ENST00000495399 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa11.1□□□□□ -0.63
C9orf135-204ENST00000495399 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
C9orf135-204ENST00000495399 CD2APQ9Y5K6 639 aa11.1□□□□□ -0.63
C9orf135-204ENST00000495399 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
C9orf135-204ENST00000495399 ACEP12821 1306 aa11.09□□□□□ -0.63
C9orf135-204ENST00000495399 SLIT3O75094 1523 aa11.09□□□□□ -0.63
C9orf135-204ENST00000495399 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa11.09□□□□□ -0.63
C9orf135-204ENST00000495399 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
C9orf135-204ENST00000495399 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
C9orf135-204ENST00000495399 RASEFQ8IZ41 740 aa11.09□□□□□ -0.63
C9orf135-204ENST00000495399 ABTB2Q8N961 1025 aa11.09□□□□□ -0.63
C9orf135-204ENST00000495399 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
C9orf135-204ENST00000495399 NMRK2Q9NPI5 230 aa11.09□□□□□ -0.63
C9orf135-204ENST00000495399 EXOC5O00471 708 aa11.08□□□□□ -0.64
C9orf135-204ENST00000495399 ABCC6O95255 1503 aa11.08□□□□□ -0.64
C9orf135-204ENST00000495399 PLEKHG3A1L390 1219 aa11.07□□□□□ -0.64
C9orf135-204ENST00000495399 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
C9orf135-204ENST00000495399 CARD10Q9BWT7 1032 aa11.07□□□□□ -0.64
C9orf135-204ENST00000495399 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa11.07□□□□□ -0.64
C9orf135-204ENST00000495399 LY75O60449 1722 aa11.06□□□□□ -0.64
C9orf135-204ENST00000495399 QRICH2Q9H0J4 1663 aa11.06□□□□□ -0.64
C9orf135-204ENST00000495399 PLCG2P16885 1265 aa11.06□□□□□ -0.64
C9orf135-204ENST00000495399 KCNQ4P56696 695 aa11.06□□□□□ -0.64
C9orf135-204ENST00000495399 SLC27A3Q5K4L6 730 aa11.06□□□□□ -0.64
C9orf135-204ENST00000495399 NLRP13Q86W25 1043 aa11.06□□□□□ -0.64
C9orf135-204ENST00000495399 MIER1Q8N108 512 aa11.06□□□□□ -0.64
C9orf135-204ENST00000495399 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
C9orf135-204ENST00000495399 TRAK1Q9UPV9 953 aa11.06□□□□□ -0.64
C9orf135-204ENST00000495399 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa11.05□□□□□ -0.64
C9orf135-204ENST00000495399 FSTL1Q12841 308 aa11.04□□□□□ -0.64
C9orf135-204ENST00000495399 IGSF1Q8N6C5 1336 aa11.04□□□□□ -0.64
C9orf135-204ENST00000495399 MSL1Q68DK7 614 aa11.03□□□□□ -0.64
C9orf135-204ENST00000495399 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa11.03□□□□□ -0.64
C9orf135-204ENST00000495399 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa11.02□□□□□ -0.64
C9orf135-204ENST00000495399 SNPHO15079 494 aa11.02□□□□□ -0.65
C9orf135-204ENST00000495399 FAM161AQ3B820 660 aa11.02□□□□□ -0.65
C9orf135-204ENST00000495399 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
C9orf135-204ENST00000495399 KAT6BQ8WYB5 2073 aa11.01□□□□□ -0.65
C9orf135-204ENST00000495399 ARHGEF25Q86VW2 580 aa11.01□□□□□ -0.65
C9orf135-204ENST00000495399 CDK19Q9BWU1 502 aa11.01□□□□□ -0.65
C9orf135-204ENST00000495399 PIK3C2AO00443 1686 aa11.01□□□□□ -0.65
C9orf135-204ENST00000495399 USP54Q70EL1 1684 aa11.01□□□□□ -0.65
C9orf135-204ENST00000495399 NSD2O96028 1365 aa11.01□□□□□ -0.65
C9orf135-204ENST00000495399 CCDC7Q96M83 1385 aa11.01□□□□□ -0.65
C9orf135-204ENST00000495399 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa11.01□□□□□ -0.65
C9orf135-204ENST00000495399 C10orf71Q711Q0 1435 aa11.01□□□□□ -0.65
C9orf135-204ENST00000495399 ZBTB7CA1YPR0 619 aa11□□□□□ -0.65
C9orf135-204ENST00000495399 TMEM106CQ9BVX2 250 aa10.99□□□□□ -0.65
C9orf135-204ENST00000495399 MARVELD3Q96A59 401 aa10.98□□□□□ -0.65
C9orf135-204ENST00000495399 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms