RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495123.5

PKP4-216, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 580 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-216ENST00000495123 PDE3BQ13370 1112 aa11.74□□□□□ -0.53
PKP4-216ENST00000495123 DDB1Q16531 1140 aa11.74□□□□□ -0.53
PKP4-216ENST00000495123 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
PKP4-216ENST00000495123 MEGF6O75095 1541 aa11.74□□□□□ -0.53
PKP4-216ENST00000495123 NCAPD2Q15021 1401 aa11.73□□□□□ -0.53
PKP4-216ENST00000495123 TNS2Q63HR2 1409 aa11.73□□□□□ -0.53
PKP4-216ENST00000495123 EYA1Q99502 592 aa11.73□□□□□ -0.53
PKP4-216ENST00000495123 EXOC5O00471 708 aa11.72□□□□□ -0.53
PKP4-216ENST00000495123 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
PKP4-216ENST00000495123 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
PKP4-216ENST00000495123 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa11.71□□□□□ -0.53
PKP4-216ENST00000495123 PARD3Q8TEW0 1356 aa11.71□□□□□ -0.53
PKP4-216ENST00000495123 PPP2R1AP30153 589 aa11.71□□□□□ -0.53
PKP4-216ENST00000495123 IL13P35225 146 aa11.71□□□□□ -0.53
PKP4-216ENST00000495123 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
PKP4-216ENST00000495123 IGSF1Q8N6C5 1336 aa11.7□□□□□ -0.54
PKP4-216ENST00000495123 FAM196AQ6ZSG2 479 aa11.7□□□□□ -0.54
PKP4-216ENST00000495123 TATP17735 454 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
PKP4-216ENST00000495123 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa11.69□□□□□ -0.54
PKP4-216ENST00000495123 RGPD1P0DJD0 1748 aa11.69□□□□□ -0.54
PKP4-216ENST00000495123 SHANK3Q9BYB0 1731 aa11.69□□□□□ -0.54
PKP4-216ENST00000495123 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
PKP4-216ENST00000495123 AEBP1Q8IUX7 1158 aa11.68□□□□□ -0.54
PKP4-216ENST00000495123 TRIM37O94972 964 aa11.67□□□□□ -0.54
PKP4-216ENST00000495123 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
PKP4-216ENST00000495123 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
PKP4-216ENST00000495123 SULT6B1Q6IMI4 303 aa11.66□□□□□ -0.54
PKP4-216ENST00000495123 PTF1AQ7RTS3 328 aa11.66□□□□□ -0.54
PKP4-216ENST00000495123 DEFB132Q7Z7B7 95 aa11.66□□□□□ -0.54
PKP4-216ENST00000495123 CCDC125Q86Z20 511 aa11.66□□□□□ -0.54
PKP4-216ENST00000495123 BCL9O00512 1426 aa11.66□□□□□ -0.54
PKP4-216ENST00000495123 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PKP4-216ENST00000495123 HMOX1P09601 288 aa11.65□□□□□ -0.54
PKP4-216ENST00000495123 RALBP1Q15311 655 aa11.65□□□□□ -0.54
PKP4-216ENST00000495123 ACSBG1Q96GR2 724 aa11.65□□□□□ -0.54
PKP4-216ENST00000495123 PKD1L3Q7Z443 1732 aa11.65□□□□□ -0.54
PKP4-216ENST00000495123 KDRP35968 1356 aa11.65□□□□□ -0.55
PKP4-216ENST00000495123 CYP27B1O15528 508 aa11.64□□□□□ -0.55
PKP4-216ENST00000495123 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PKP4-216ENST00000495123 CFAP53Q96M91 514 aa11.64□□□□□ -0.55
PKP4-216ENST00000495123 SBF2Q86WG5 1849 aa11.64□□□□□ -0.55
PKP4-216ENST00000495123 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa11.63□□□□□ -0.55
PKP4-216ENST00000495123 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa11.63□□□□□ -0.55
PKP4-216ENST00000495123 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PKP4-216ENST00000495123 KCNQ2O43526 872 aa11.63□□□□□ -0.55
PKP4-216ENST00000495123 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PKP4-216ENST00000495123 APBA3O96018 575 aa11.62□□□□□ -0.55
PKP4-216ENST00000495123 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
PKP4-216ENST00000495123 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP11.62□□□□□ -0.551e-13■□□□□ 9.7
PKP4-216ENST00000495123 SPG7Q9UQ90 795 aa11.62□□□□□ -0.55
PKP4-216ENST00000495123 NHSQ6T4R5 1651 aa11.62□□□□□ -0.55
PKP4-216ENST00000495123 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
PKP4-216ENST00000495123 DOT1LQ8TEK3 1739 aa11.61□□□□□ -0.55
PKP4-216ENST00000495123 BAG6P46379 1132 aa11.61□□□□□ -0.55
PKP4-216ENST00000495123 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
PKP4-216ENST00000495123 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa11.61□□□□□ -0.55
PKP4-216ENST00000495123 PHKG2P15735 406 aa11.6□□□□□ -0.55
PKP4-216ENST00000495123 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
PKP4-216ENST00000495123 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PKP4-216ENST00000495123 EP400Q96L91 3159 aa11.59□□□□□ -0.55
PKP4-216ENST00000495123 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PKP4-216ENST00000495123 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
PKP4-216ENST00000495123 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP11.59□□□□□ -0.55
PKP4-216ENST00000495123 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PKP4-216ENST00000495123 AMOTQ4VCS5 1084 aa11.59□□□□□ -0.55
PKP4-216ENST00000495123 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PKP4-216ENST00000495123 IFNL2Q8IZJ0 200 aa11.59□□□□□ -0.55
PKP4-216ENST00000495123 CAMKK2Q96RR4 588 aa11.59□□□□□ -0.55
PKP4-216ENST00000495123 RSPH6AQ9H0K4 717 aa11.59□□□□□ -0.55
PKP4-216ENST00000495123 NUDCQ9Y266 331 aa11.59□□□□□ -0.55
PKP4-216ENST00000495123 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa11.59□□□□□ -0.55
PKP4-216ENST00000495123 FKBP8Q14318 412 aa11.58□□□□□ -0.56
PKP4-216ENST00000495123 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
PKP4-216ENST00000495123 PRKAR2BP31323 418 aa11.57□□□□□ -0.56
PKP4-216ENST00000495123 POLA2Q14181 598 aa11.57□□□□□ -0.56
PKP4-216ENST00000495123 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
PKP4-216ENST00000495123 BTAF1O14981 1849 aa11.57□□□□□ -0.56
PKP4-216ENST00000495123 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
PKP4-216ENST00000495123 PLSCR1O15162 318 aa11.56□□□□□ -0.56
PKP4-216ENST00000495123 PHACTR3Q96KR7 559 aa11.56□□□□□ -0.56
PKP4-216ENST00000495123 C1orf141Q5JVX7 400 aa11.55□□□□□ -0.56
PKP4-216ENST00000495123 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa11.55□□□□□ -0.56
PKP4-216ENST00000495123 PROM2Q8N271 834 aa11.55□□□□□ -0.56
PKP4-216ENST00000495123 RREB1Q92766 1687 aa11.55□□□□□ -0.56
PKP4-216ENST00000495123 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
PKP4-216ENST00000495123 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa11.54□□□□□ -0.56
PKP4-216ENST00000495123 ANP32CO43423 234 aa11.54□□□□□ -0.56
PKP4-216ENST00000495123 FCHSD2O94868 740 aa11.54□□□□□ -0.56
PKP4-216ENST00000495123 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
PKP4-216ENST00000495123 CCDC184Q52MB2 194 aa11.54□□□□□ -0.56
PKP4-216ENST00000495123 AKAP4Q5JQC9 854 aa11.54□□□□□ -0.56
PKP4-216ENST00000495123 DCAF5Q96JK2 942 aa11.54□□□□□ -0.56
PKP4-216ENST00000495123 ITGB4P16144 1822 aa11.53□□□□□ -0.56
PKP4-216ENST00000495123 NUP188Q5SRE5 1749 aa11.53□□□□□ -0.56
PKP4-216ENST00000495123 TXNRD1Q16881 649 aa11.53□□□□□ -0.56
PKP4-216ENST00000495123 GAS2L2Q8NHY3 880 aa11.53□□□□□ -0.56
PKP4-216ENST00000495123 PIGBQ92521 554 aa11.53□□□□□ -0.56
PKP4-216ENST00000495123 PLEKHF1Q96S99 279 aa11.53□□□□□ -0.56
PKP4-216ENST00000495123 LGR6Q9HBX8 967 aa11.53□□□□□ -0.56
PKP4-216ENST00000495123 TMOD3Q9NYL9 352 aa11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.5 ms