RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494977.1

FGD4-208, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4, human

TSL 2

Gene FGD4, Length 2,349 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGD4-208	ENST00000494977	ATP8B1	O43520	1251 aa		7.5	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	CP	P00450	1065 aa		7.5	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	NEFH	P12036	1026 aa		7.5	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		7.5	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		7.5	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	KDM4A	O75164	1064 aa		7.5	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	ACTN2	P35609	894 aa		7.5	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		7.5	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	SMARCE1	Q969G3	411 aa		7.5	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		7.49	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	SLFN5	Q08AF3	891 aa		7.49	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		7.49	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		7.49	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		7.49	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	EXOC4	Q96A65	974 aa		7.49	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		7.49	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	AK9	Q5TCS8	1911 aa		7.49	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	C21orf2	O43822	256 aa		7.49	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	MNAT1	P51948	309 aa		7.49	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	7.49	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	CEP135	Q66GS9	1140 aa		7.49	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		7.49	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	IFT57	Q9NWB7	429 aa		7.49	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	COG6	Q9Y2V7	657 aa		7.49	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977		E9PCH4	1651 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	NRDC	O43847	1150 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	COQ9	O75208	318 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	CORO7	P57737	925 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	ELF2	Q15723	593 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	FAM107B	Q9H098	131 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	ETAA1	Q9NY74	926 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	SHROOM2	Q13796	1616 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		7.48	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	PLA2G4A	P47712	749 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	CCDC96	Q2M329	555 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	ZNF521	Q96K83	1311 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	KDM5C	P41229	1560 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	SGSM2	O43147	1006 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	BCAR3	O75815	825 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	NEBL	O76041	1014 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	SETDB1	Q15047	1291 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	MIEF2	Q96C03	454 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	KIF2C	Q99661	725 aa		7.47	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		7.46	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	ST5	P78524	1137 aa		7.46	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	ADCY2	Q08462	1091 aa		7.46	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	GBP6	Q6ZN66	633 aa		7.46	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		7.46	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	SH3GL3	Q99963	347 aa		7.46	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		7.46	□□□□□ -1.21
FGD4-208	ENST00000494977	SCP2	P22307	547 aa		7.46	□□□□□ -1.22
FGD4-208	ENST00000494977	PLCB2	Q00722	1185 aa		7.46	□□□□□ -1.22
FGD4-208	ENST00000494977	TRAF1	Q13077	416 aa		7.46	□□□□□ -1.22
FGD4-208	ENST00000494977	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		7.46	□□□□□ -1.22
FGD4-208	ENST00000494977	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		7.46	□□□□□ -1.22
FGD4-208	ENST00000494977	MORC1	Q86VD1	984 aa		7.46	□□□□□ -1.22
FGD4-208	ENST00000494977	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		7.46	□□□□□ -1.22
FGD4-208	ENST00000494977	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
FGD4-208	ENST00000494977	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		7.46	□□□□□ -1.22
FGD4-208	ENST00000494977	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		7.46	□□□□□ -1.22
FGD4-208	ENST00000494977		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
FGD4-208	ENST00000494977	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		7.45	□□□□□ -1.22
FGD4-208	ENST00000494977	RPS6KA5	O75582	802 aa		7.45	□□□□□ -1.22
FGD4-208	ENST00000494977	LMAN1	P49257	510 aa		7.45	□□□□□ -1.22
FGD4-208	ENST00000494977	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
FGD4-208	ENST00000494977	TEX11	Q8IYF3	940 aa		7.45	□□□□□ -1.22
FGD4-208	ENST00000494977	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		7.45	□□□□□ -1.22
FGD4-208	ENST00000494977	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		7.45	□□□□□ -1.22
FGD4-208	ENST00000494977	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
FGD4-208	ENST00000494977	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	7.45	□□□□□ -1.22
FGD4-208	ENST00000494977	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
FGD4-208	ENST00000494977	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		7.45	□□□□□ -1.22

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