RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486517.5

C1orf61-217, Transcript of chromosome 1 open reading frame 61, humanhuman

TSL 3

Gene C1orf61, Length 726 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61-217ENST00000486517 AKT1S1Q96B36 256 aa22.05■■□□□ 1.12
C1orf61-217ENST00000486517 ATP10DQ9P241 1426 aa22.05■■□□□ 1.12
C1orf61-217ENST00000486517 GRIN3BO60391 1043 aa22.04■■□□□ 1.12
C1orf61-217ENST00000486517 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
C1orf61-217ENST00000486517 USP54Q70EL1 1684 aa22.04■■□□□ 1.12
C1orf61-217ENST00000486517 NFAT5O94916 1531 aa22.03■■□□□ 1.12
C1orf61-217ENST00000486517 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.03■■□□□ 1.12
C1orf61-217ENST00000486517 HSPA6P17066 643 aa22.01■■□□□ 1.11
C1orf61-217ENST00000486517 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
C1orf61-217ENST00000486517 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.01■■□□□ 1.11
C1orf61-217ENST00000486517 NME9Q86XW9 330 aa22■■□□□ 1.11
C1orf61-217ENST00000486517 FYB1O15117 783 aa21.99■■□□□ 1.11
C1orf61-217ENST00000486517 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
C1orf61-217ENST00000486517 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.98■■□□□ 1.11
C1orf61-217ENST00000486517 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa21.98■■□□□ 1.11
C1orf61-217ENST00000486517 IL2RBP14784 551 aa21.97■■□□□ 1.11
C1orf61-217ENST00000486517 LTN1O94822 1766 aa21.97■■□□□ 1.11
C1orf61-217ENST00000486517 NLRP2Q9NX02 1062 aa21.96■■□□□ 1.11
C1orf61-217ENST00000486517 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.95■■□□□ 1.1
C1orf61-217ENST00000486517 LY75O60449 1722 aa21.94■■□□□ 1.1
C1orf61-217ENST00000486517 COG3Q96JB2 828 aa21.94■■□□□ 1.1
C1orf61-217ENST00000486517 ERBB3P21860 1342 aa21.94■■□□□ 1.1
C1orf61-217ENST00000486517 KCNQ4P56696 695 aa21.93■■□□□ 1.1
C1orf61-217ENST00000486517 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
C1orf61-217ENST00000486517 ADCY9O60503 1353 aa21.91■■□□□ 1.1
C1orf61-217ENST00000486517 NSD3Q9BZ95 1437 aa21.9■■□□□ 1.1
C1orf61-217ENST00000486517 CGNL1Q0VF96 1302 aa21.9■■□□□ 1.1
C1orf61-217ENST00000486517 DOT1LQ8TEK3 1739 aa21.9■■□□□ 1.1
C1orf61-217ENST00000486517 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
C1orf61-217ENST00000486517 PANK3Q9H999 370 aa21.9■■□□□ 1.1
C1orf61-217ENST00000486517 MSH5O43196 834 aa21.88■■□□□ 1.09
C1orf61-217ENST00000486517 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.87■■□□□ 1.09
C1orf61-217ENST00000486517 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
C1orf61-217ENST00000486517 KIF24Q5T7B8 1368 aa21.87■■□□□ 1.09
C1orf61-217ENST00000486517 ANKRD24Q8TF21 1146 aa21.86■■□□□ 1.09
C1orf61-217ENST00000486517 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
C1orf61-217ENST00000486517 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.86■■□□□ 1.09
C1orf61-217ENST00000486517 NSD2O96028 1365 aa21.86■■□□□ 1.09
C1orf61-217ENST00000486517 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
C1orf61-217ENST00000486517 MSL1Q68DK7 614 aa21.85■■□□□ 1.09
C1orf61-217ENST00000486517 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
C1orf61-217ENST00000486517 IP6K1Q92551 441 aa21.85■■□□□ 1.09
C1orf61-217ENST00000486517 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
C1orf61-217ENST00000486517 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
C1orf61-217ENST00000486517 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.83■■□□□ 1.09
C1orf61-217ENST00000486517 CD2APQ9Y5K6 639 aa21.83■■□□□ 1.09
C1orf61-217ENST00000486517 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
C1orf61-217ENST00000486517 MAP3K19Q56UN5 1328 aa21.81■■□□□ 1.08
C1orf61-217ENST00000486517 RTL1A6NKG5 1358 aa21.81■■□□□ 1.08
C1orf61-217ENST00000486517 C5P01031 1676 aa21.81■■□□□ 1.08
C1orf61-217ENST00000486517 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa21.8■■□□□ 1.08
C1orf61-217ENST00000486517 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
C1orf61-217ENST00000486517 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.8■■□□□ 1.08
C1orf61-217ENST00000486517 KIF3CO14782 793 aa21.79■■□□□ 1.08
C1orf61-217ENST00000486517 APLP1P51693 650 aa21.78■■□□□ 1.08
C1orf61-217ENST00000486517 HOXC9P31274 260 aa21.77■■□□□ 1.08
C1orf61-217ENST00000486517 TAF1LQ8IZX4 1826 aa21.76■■□□□ 1.07
C1orf61-217ENST00000486517 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.76■■□□□ 1.07
C1orf61-217ENST00000486517 RGPD2P0DJD1 1756 aa21.74■■□□□ 1.07
C1orf61-217ENST00000486517 FBLN1P23142 703 aa21.74■■□□□ 1.07
C1orf61-217ENST00000486517 WWC3Q9ULE0 1092 aa21.74■■□□□ 1.07
C1orf61-217ENST00000486517 INSRP06213 1382 aa21.74■■□□□ 1.07
C1orf61-217ENST00000486517 AMPHP49418 695 aa21.73■■□□□ 1.07
C1orf61-217ENST00000486517 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa21.73■■□□□ 1.07
C1orf61-217ENST00000486517 IGSF1Q8N6C5 1336 aa21.73■■□□□ 1.07
C1orf61-217ENST00000486517 FLT4P35916 1363 aa21.73■■□□□ 1.07
C1orf61-217ENST00000486517 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
C1orf61-217ENST00000486517 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
C1orf61-217ENST00000486517 POLKQ9UBT6 870 aa21.72■■□□□ 1.07
C1orf61-217ENST00000486517 WDR90Q96KV7 1748 aa21.71■■□□□ 1.07
C1orf61-217ENST00000486517 FLAD1Q8NFF5 587 aa21.7■■□□□ 1.06
C1orf61-217ENST00000486517 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
C1orf61-217ENST00000486517 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
C1orf61-217ENST00000486517 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
C1orf61-217ENST00000486517 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa21.68■■□□□ 1.06
C1orf61-217ENST00000486517 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa21.67■■□□□ 1.06
C1orf61-217ENST00000486517 MEGF6O75095 1541 aa21.67■■□□□ 1.06
C1orf61-217ENST00000486517 TOMM70O94826 608 aa21.67■■□□□ 1.06
C1orf61-217ENST00000486517 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa21.67■■□□□ 1.06
C1orf61-217ENST00000486517 MORC1Q86VD1 984 aa21.67■■□□□ 1.06
C1orf61-217ENST00000486517 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa21.67■■□□□ 1.06
C1orf61-217ENST00000486517 UBR3Q6ZT12 1888 aa21.66■■□□□ 1.06
C1orf61-217ENST00000486517 C4BP0C0L5 1744 aa21.66■■□□□ 1.06
C1orf61-217ENST00000486517 CAPN15O75808 1086 aa21.66■■□□□ 1.06
C1orf61-217ENST00000486517 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
C1orf61-217ENST00000486517 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
C1orf61-217ENST00000486517 NCAPD2Q15021 1401 aa21.63■■□□□ 1.05
C1orf61-217ENST00000486517 PALLDQ8WX93 1383 aa21.61■■□□□ 1.05
C1orf61-217ENST00000486517 NBPF6Q5VWK0 638 aa21.61■■□□□ 1.05
C1orf61-217ENST00000486517 NBPF4Q96M43 638 aa21.61■■□□□ 1.05
C1orf61-217ENST00000486517 ITGB4P16144 1822 aa21.6■■□□□ 1.05
C1orf61-217ENST00000486517 AMIGO3Q86WK7 504 aa21.6■■□□□ 1.05
C1orf61-217ENST00000486517 AK7Q96M32 723 aa21.6■■□□□ 1.05
C1orf61-217ENST00000486517 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa21.6■■□□□ 1.05
C1orf61-217ENST00000486517 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
C1orf61-217ENST00000486517 PHF14O94880 888 aa21.59■■□□□ 1.05
C1orf61-217ENST00000486517 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
C1orf61-217ENST00000486517 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa21.58■■□□□ 1.05
C1orf61-217ENST00000486517 KIF13BQ9NQT8 1826 aa21.58■■□□□ 1.05
C1orf61-217ENST00000486517 KLRG1Q96E93 195 aa21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms