RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP8.97□□□□□ -0.97
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC125Q86Z20 511 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRC-211ENST00000484135 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRC-211ENST00000484135 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PTPRC-211ENST00000484135 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRC-211ENST00000484135 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRC-211ENST00000484135 ADD1P35611 737 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
PTPRC-211ENST00000484135 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP8.96□□□□□ -0.98
PTPRC-211ENST00000484135 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
PTPRC-211ENST00000484135 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PTPRC-211ENST00000484135 VAC14Q08AM6 782 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRC-211ENST00000484135 IRF5Q13568 498 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRC-211ENST00000484135 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRC-211ENST00000484135 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRC-211ENST00000484135 PTGIRP43119 386 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRC-211ENST00000484135 SVOPQ8N4V2 548 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRC-211ENST00000484135 ERVK-9P63128 1117 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRC-211ENST00000484135 IGHA1P01876 353 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRC-211ENST00000484135 GPAT2Q6NUI2 795 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRC-211ENST00000484135 CEP126Q9P2H0 1117 aa8.92□□□□□ -0.98
PTPRC-211ENST00000484135 SCTRP47872 440 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRC-211ENST00000484135 PTSQ03393 145 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRC-211ENST00000484135 WASHC4Q2M389 1173 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRC-211ENST00000484135 SLFNL1Q499Z3 407 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRC-211ENST00000484135 CYP2U1Q7Z449 544 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRC-211ENST00000484135 RNF217Q8TC41 542 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRC-211ENST00000484135 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
PTPRC-211ENST00000484135 MEN1O00255 615 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRC-211ENST00000484135 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
PTPRC-211ENST00000484135 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
PTPRC-211ENST00000484135 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
PTPRC-211ENST00000484135 COG6Q9Y2V7 657 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRC-211ENST00000484135 MYCP01106 439 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
PTPRC-211ENST00000484135 IRS1P35568 1242 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRC-211ENST00000484135 MARSP56192 900 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
PTPRC-211ENST00000484135 KRT76Q01546 638 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM132AQ24JP5 1023 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRC-211ENST00000484135 RNF135Q8IUD6 432 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRC-211ENST00000484135 WWC1Q8IX03 1113 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRC-211ENST00000484135 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
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PTPRC-211ENST00000484135 FOXK2Q01167 660 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRC-211ENST00000484135 SEMA3FQ13275 785 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
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PTPRC-211ENST00000484135 FLIIQ13045 1269 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
PTPRC-211ENST00000484135 KANK3Q6NY19 840 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRC-211ENST00000484135 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC155Q8N6L0 562 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRC-211ENST00000484135 NLRP3Q96P20 1036 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRC-211ENST00000484135 OSBPL3Q9H4L5 887 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRC-211ENST00000484135 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1W2PRU2 124 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRC-211ENST00000484135 POM121Q96HA1 1249 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRC-211ENST00000484135 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
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PTPRC-211ENST00000484135 SOX11P35716 441 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-211ENST00000484135 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-211ENST00000484135 OXLD1Q5BKU9 147 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-211ENST00000484135 SLC27A3Q5K4L6 730 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-211ENST00000484135 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-211ENST00000484135 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-211ENST00000484135 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-211ENST00000484135 RAB6BQ9NRW1 208 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-211ENST00000484135 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRC-211ENST00000484135 SLC35F4A4IF30 521 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRC-211ENST00000484135 NACADO15069 1562 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRC-211ENST00000484135 GPC1P35052 558 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRC-211ENST00000484135 CLN3Q13286 438 aa8.83□□□□□ -1
PTPRC-211ENST00000484135 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa8.82□□□□□ -1
PTPRC-211ENST00000484135 CDC14CA4D256 554 aa8.82□□□□□ -1
PTPRC-211ENST00000484135 GNRH1P01148 92 aa8.82□□□□□ -1
PTPRC-211ENST00000484135 RHOQP17081 205 aa8.82□□□□□ -1
PTPRC-211ENST00000484135 USP4Q13107 963 aa8.82□□□□□ -1
PTPRC-211ENST00000484135 TSGA10IPQ3SY00 556 aa8.82□□□□□ -1
PTPRC-211ENST00000484135 PHTF2Q8N3S3 785 aa8.82□□□□□ -1
PTPRC-211ENST00000484135 ITGA6P23229 1130 aa8.81□□□□□ -1
PTPRC-211ENST00000484135 SV2AQ7L0J3 742 aa8.81□□□□□ -1
PTPRC-211ENST00000484135 PLPP7Q8NBV4 271 aa8.81□□□□□ -1
PTPRC-211ENST00000484135 SIRT1Q96EB6 747 aa8.81□□□□□ -1
PTPRC-211ENST00000484135 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa8.8□□□□□ -1
PTPRC-211ENST00000484135 SLURP2P0DP57 97 aa8.8□□□□□ -1
PTPRC-211ENST00000484135 MAP3K10Q02779 954 aa8.8□□□□□ -1
PTPRC-211ENST00000484135 RNFT1Q5M7Z0 435 aa8.8□□□□□ -1
PTPRC-211ENST00000484135 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa8.79□□□□□ -1
PTPRC-211ENST00000484135 ESCO1Q5FWF5 840 aa8.79□□□□□ -1
PTPRC-211ENST00000484135 VWA5B2Q8N398 1253 aa8.79□□□□□ -1
PTPRC-211ENST00000484135 CNKSR1Q969H4 720 aa8.79□□□□□ -1
PTPRC-211ENST00000484135 MYO15BQ96JP2 1530 aa8.79□□□□□ -1
PTPRC-211ENST00000484135 ARHGEF15O94989 841 aa8.78□□□□□ -1
PTPRC-211ENST00000484135 IL2RAP01589 272 aa8.78□□□□□ -1
PTPRC-211ENST00000484135 MAP7D1Q3KQU3 841 aa8.78□□□□□ -1
PTPRC-211ENST00000484135 WHAMMQ8TF30 809 aa8.78□□□□□ -1
PTPRC-211ENST00000484135 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa8.78□□□□□ -1
PTPRC-211ENST00000484135 PIK3CDO00329 1044 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRC-211ENST00000484135 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
PTPRC-211ENST00000484135 POU4F2Q12837 409 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRC-211ENST00000484135 GRIP2Q9C0E4 1043 aa8.77□□□□□ -1.01
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