RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481414.5

KCNS3-205, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3, human

TSL 4

Gene KCNS3, Length 560 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KCNS3-205	ENST00000481414	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		32.56	■■■□□ 2.8
KCNS3-205	ENST00000481414	TNS2	Q63HR2	1409 aa		32.55	■■■□□ 2.8
KCNS3-205	ENST00000481414	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8
KCNS3-205	ENST00000481414	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	32.55	■■■□□ 2.8
KCNS3-205	ENST00000481414	CCDC184	Q52MB2	194 aa		32.54	■■■□□ 2.8
KCNS3-205	ENST00000481414	ILDR2	Q71H61	639 aa		32.54	■■■□□ 2.8
KCNS3-205	ENST00000481414	LRRC37A3	O60309	1634 aa		32.54	■■■□□ 2.8
KCNS3-205	ENST00000481414	FCHSD2	O94868	740 aa		32.53	■■■□□ 2.8
KCNS3-205	ENST00000481414	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		32.51	■■■□□ 2.79
KCNS3-205	ENST00000481414	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		32.5	■■■□□ 2.79
KCNS3-205	ENST00000481414	MRS2	Q9HD23	443 aa		32.5	■■■□□ 2.79
KCNS3-205	ENST00000481414	SPG7	Q9UQ90	795 aa		32.5	■■■□□ 2.79
KCNS3-205	ENST00000481414	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		32.49	■■■□□ 2.79
KCNS3-205	ENST00000481414	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
KCNS3-205	ENST00000481414	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	32.47	■■■□□ 2.79
KCNS3-205	ENST00000481414	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
KCNS3-205	ENST00000481414	PRKAR2B	P31323	418 aa		32.45	■■■□□ 2.79
KCNS3-205	ENST00000481414	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.79
KCNS3-205	ENST00000481414	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		32.45	■■■□□ 2.78
KCNS3-205	ENST00000481414	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		32.45	■■■□□ 2.78
KCNS3-205	ENST00000481414	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		32.45	■■■□□ 2.78
KCNS3-205	ENST00000481414	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
KCNS3-205	ENST00000481414	CCER2	I3L3R5	266 aa		32.43	■■■□□ 2.78
KCNS3-205	ENST00000481414	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
KCNS3-205	ENST00000481414	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		32.42	■■■□□ 2.78
KCNS3-205	ENST00000481414	CYP27B1	O15528	508 aa		32.41	■■■□□ 2.78
KCNS3-205	ENST00000481414	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		32.41	■■■□□ 2.78
KCNS3-205	ENST00000481414	MIER1	Q8N108	512 aa		32.41	■■■□□ 2.78
KCNS3-205	ENST00000481414	BCL9	O00512	1426 aa		32.41	■■■□□ 2.78
KCNS3-205	ENST00000481414	FAM182B	Q5T319	152 aa		32.4	■■■□□ 2.78
KCNS3-205	ENST00000481414	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		32.4	■■■□□ 2.78
KCNS3-205	ENST00000481414	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		32.39	■■■□□ 2.78
KCNS3-205	ENST00000481414	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		32.39	■■■□□ 2.78
KCNS3-205	ENST00000481414	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		32.38	■■■□□ 2.77
KCNS3-205	ENST00000481414	PHKG2	P15735	406 aa		32.37	■■■□□ 2.77
KCNS3-205	ENST00000481414	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
KCNS3-205	ENST00000481414	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	32.37	■■■□□ 2.77
KCNS3-205	ENST00000481414	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
KCNS3-205	ENST00000481414	NEFM	P07197	916 aa		32.35	■■■□□ 2.77
KCNS3-205	ENST00000481414	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		32.35	■■■□□ 2.77
KCNS3-205	ENST00000481414	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		32.33	■■■□□ 2.77
KCNS3-205	ENST00000481414	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
KCNS3-205	ENST00000481414	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		32.31	■■■□□ 2.76
KCNS3-205	ENST00000481414	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		32.3	■■■□□ 2.76
KCNS3-205	ENST00000481414	RUNDC1	Q96C34	613 aa		32.3	■■■□□ 2.76
KCNS3-205	ENST00000481414	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		32.27	■■■□□ 2.76
KCNS3-205	ENST00000481414	DCAF5	Q96JK2	942 aa		32.27	■■■□□ 2.76
KCNS3-205	ENST00000481414	EP400	Q96L91	3159 aa		32.25	■■■□□ 2.75
KCNS3-205	ENST00000481414	NFE2L2	Q16236	605 aa		32.24	■■■□□ 2.75
KCNS3-205	ENST00000481414	MAP3K5	Q99683	1374 aa		32.23	■■■□□ 2.75
KCNS3-205	ENST00000481414	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		32.23	■■■□□ 2.75
KCNS3-205	ENST00000481414	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		32.23	■■■□□ 2.75
KCNS3-205	ENST00000481414	TRIM37	O94972	964 aa		32.22	■■■□□ 2.75
KCNS3-205	ENST00000481414	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		32.22	■■■□□ 2.75
KCNS3-205	ENST00000481414	CCDC125	Q86Z20	511 aa		32.22	■■■□□ 2.75
KCNS3-205	ENST00000481414	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		32.22	■■■□□ 2.75
KCNS3-205	ENST00000481414	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	32.22	■■■□□ 2.75
KCNS3-205	ENST00000481414	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	32.2	■■■□□ 2.75
KCNS3-205	ENST00000481414	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.75
KCNS3-205	ENST00000481414	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.75
KCNS3-205	ENST00000481414	SBF2	Q86WG5	1849 aa		32.19	■■■□□ 2.74
KCNS3-205	ENST00000481414	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		32.19	■■■□□ 2.74
KCNS3-205	ENST00000481414	KCNQ2	O43526	872 aa		32.19	■■■□□ 2.74
KCNS3-205	ENST00000481414	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	32.19	■■■□□ 2.74
KCNS3-205	ENST00000481414	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
KCNS3-205	ENST00000481414	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
KCNS3-205	ENST00000481414	LGR6	Q9HBX8	967 aa		32.17	■■■□□ 2.74
KCNS3-205	ENST00000481414	NHS	Q6T4R5	1651 aa		32.15	■■■□□ 2.74
KCNS3-205	ENST00000481414	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		32.15	■■■□□ 2.74
KCNS3-205	ENST00000481414	APAF1	O14727	1248 aa		32.15	■■■□□ 2.74
KCNS3-205	ENST00000481414	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		32.15	■■■□□ 2.74
KCNS3-205	ENST00000481414	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		32.15	■■■□□ 2.74
KCNS3-205	ENST00000481414	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
KCNS3-205	ENST00000481414	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	32.15	■■■□□ 2.74
KCNS3-205	ENST00000481414	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		32.14	■■■□□ 2.74
KCNS3-205	ENST00000481414	RIPK4	P57078	832 aa		32.14	■■■□□ 2.74
KCNS3-205	ENST00000481414	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		32.14	■■■□□ 2.74
KCNS3-205	ENST00000481414	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		32.14	■■■□□ 2.74
KCNS3-205	ENST00000481414	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		32.12	■■■□□ 2.73
KCNS3-205	ENST00000481414	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
KCNS3-205	ENST00000481414	CABP4	P57796	275 aa		32.11	■■■□□ 2.73
KCNS3-205	ENST00000481414	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		32.11	■■■□□ 2.73
KCNS3-205	ENST00000481414	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	32.11	■■■□□ 2.73
KCNS3-205	ENST00000481414	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		32.11	■■■□□ 2.73
KCNS3-205	ENST00000481414	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		32.1	■■■□□ 2.73
KCNS3-205	ENST00000481414	PIGB	Q92521	554 aa		32.1	■■■□□ 2.73
KCNS3-205	ENST00000481414	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		32.09	■■■□□ 2.73
KCNS3-205	ENST00000481414	SOCS7	O14512	581 aa		32.08	■■■□□ 2.73
KCNS3-205	ENST00000481414	APBA3	O96018	575 aa		32.08	■■■□□ 2.73
KCNS3-205	ENST00000481414	NEUROD2	Q15784	382 aa		32.08	■■■□□ 2.73
KCNS3-205	ENST00000481414	MCM10	Q7L590	875 aa		32.08	■■■□□ 2.73
KCNS3-205	ENST00000481414	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		32.08	■■■□□ 2.73
KCNS3-205	ENST00000481414	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
KCNS3-205	ENST00000481414	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		32.07	■■■□□ 2.72
KCNS3-205	ENST00000481414	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
KCNS3-205	ENST00000481414	MRC1	P22897	1456 aa		32.07	■■■□□ 2.72
KCNS3-205	ENST00000481414	ITGB4	P16144	1822 aa		32.06	■■■□□ 2.72
KCNS3-205	ENST00000481414	DCTN1	Q14203	1278 aa		32.06	■■■□□ 2.72
KCNS3-205	ENST00000481414	PLSCR1	O15162	318 aa		32.05	■■■□□ 2.72
KCNS3-205	ENST00000481414	TEF	Q10587	303 aa		32.05	■■■□□ 2.72

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms