RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SYCE3A1L190 88 aa20.29■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KIAA0754O94854 1291 aa20.29■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PDRG1Q9NUG6 133 aa20.29■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.29■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.845e-17■■■■■ 409.9
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GOLGA6L10A6NI86 522 aa20.29■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TTC39AQ5SRH9 613 aa20.29■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PDCL2Q8N4E4 241 aa20.28■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ADAMTS12P58397 1594 aa20.28■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IDI1Q13907 227 aa20.28■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ERICH4A6NGS2 130 aa20.28■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PLCD4Q9BRC7 762 aa20.28■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC181Q5TID7 509 aa20.27■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 WAPLQ7Z5K2 1190 aa20.27■□□□□ 0.84
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ERLIN2O94905 339 aa20.26■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa20.26■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 STK11IPQ8N1F8 1099 aa20.26■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa20.26■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC158Q5M9N0 1113 aa20.25■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CEP57L1Q8IYX8 460 aa20.25■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SIL1Q9H173 461 aa20.25■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DEF6Q9H4E7 631 aa20.25■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PIP4K2BP78356 416 aa20.25■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM193AP78312 1265 aa20.25■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 WDR97A6NE52 1622 aa20.24■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.24■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa20.24■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CFAP45Q9UL16 551 aa20.24■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PLCH2O75038 1416 aa20.24■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRT18P05783 430 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ATAD2Q6PL18 1390 aa20.23■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLFN5Q08AF3 891 aa20.22■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SYCP1Q15431 976 aa20.22■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRIM22Q8IYM9 498 aa20.22■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IKQ13123 557 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 STIM1Q13586 685 aa20.22■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20.22■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MAP3K11Q16584 847 aa20.22■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP20.22■□□□□ 0.832e-6■■■■■ 37.8
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SULT6B1Q6IMI4 303 aa20.21■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 WDR62O43379 1518 aa20.21■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CAMK4Q16566 473 aa20.21■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC102AQ96A19 550 aa20.21■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa20.21■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC69A6NI79 296 aa20.21■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CENPHQ9H3R5 247 aa20.21■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRDM10Q9NQV6 1147 aa20.21■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC61Q9Y6R9 512 aa20.21■□□□□ 0.83
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AACSQ86V21 672 aa20.2■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM177BA6PVY3 158 aa20.2■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.2■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CBX1P83916 185 aa20.2■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SKAP1Q86WV1 359 aa20.2■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM57Q8N5G2 664 aa20.2■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF428Q96B54 188 aa20.2■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TANGO6Q9C0B7 1094 aa20.2■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SMTNL1A8MU46 457 aa20.19■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KIF6Q6ZMV9 814 aa20.19■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa20.19■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CNNM1Q9NRU3 951 aa20.19■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UBXN4Q92575 508 aa20.19■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KIAA0556O60303 1618 aa20.19■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.19■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NEFHP12036 1026 aa20.18■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TATP17735 454 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TXLNBQ8N3L3 684 aa20.18■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.18■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa20.18■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa20.18■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.18■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CASTP20810 708 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IQCEQ6IPM2 695 aa20.17■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa20.17■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TAF3Q5VWG9 929 aa20.17■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRDM11Q9NQV5 511 aa20.17■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SRGAP3O43295 1099 aa20.17■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NUP133Q8WUM0 1156 aa20.17■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMCO3Q6UWJ1 677 aa20.16■□□□□ 0.82
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
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