RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472446.1

PEMT-208, Transcript of phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, human

TSL 3

Gene PEMT, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PEMT-208	ENST00000472446	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
PEMT-208	ENST00000472446	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	32.52	■■■□□ 2.8
PEMT-208	ENST00000472446	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.79
PEMT-208	ENST00000472446	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		32.51	■■■□□ 2.79
PEMT-208	ENST00000472446	GPR162	Q16538	588 aa		32.5	■■■□□ 2.79
PEMT-208	ENST00000472446	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		32.5	■■■□□ 2.79
PEMT-208	ENST00000472446	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		32.5	■■■□□ 2.79
PEMT-208	ENST00000472446	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PEMT-208	ENST00000472446	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PEMT-208	ENST00000472446	CHD4	Q14839	1912 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PEMT-208	ENST00000472446	CDCA8	Q53HL2	280 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PEMT-208	ENST00000472446	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
PEMT-208	ENST00000472446	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		32.48	■■■□□ 2.79
PEMT-208	ENST00000472446	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		32.47	■■■□□ 2.79
PEMT-208	ENST00000472446	FYB1	O15117	783 aa		32.47	■■■□□ 2.79
PEMT-208	ENST00000472446	KCNQ4	P56696	695 aa		32.47	■■■□□ 2.79
PEMT-208	ENST00000472446	MEGF6	O75095	1541 aa		32.46	■■■□□ 2.79
PEMT-208	ENST00000472446	USP47	Q96K76	1375 aa		32.46	■■■□□ 2.79
PEMT-208	ENST00000472446	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	32.46	■■■□□ 2.79
PEMT-208	ENST00000472446	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		32.46	■■■□□ 2.79
PEMT-208	ENST00000472446	NBPF4	Q96M43	638 aa		32.46	■■■□□ 2.79
PEMT-208	ENST00000472446	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.79
PEMT-208	ENST00000472446	MSH5	O43196	834 aa		32.44	■■■□□ 2.78
PEMT-208	ENST00000472446	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		32.44	■■■□□ 2.78
PEMT-208	ENST00000472446	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
PEMT-208	ENST00000472446	LY75	O60449	1722 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PEMT-208	ENST00000472446	NSD2	O96028	1365 aa		32.42	■■■□□ 2.78
PEMT-208	ENST00000472446	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PEMT-208	ENST00000472446	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PEMT-208	ENST00000472446	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PEMT-208	ENST00000472446	INSR	P06213	1382 aa		32.37	■■■□□ 2.77
PEMT-208	ENST00000472446	FLT4	P35916	1363 aa		32.37	■■■□□ 2.77
PEMT-208	ENST00000472446	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		32.36	■■■□□ 2.77
PEMT-208	ENST00000472446	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		32.36	■■■□□ 2.77
PEMT-208	ENST00000472446	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PEMT-208	ENST00000472446	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PEMT-208	ENST00000472446	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PEMT-208	ENST00000472446	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.76
PEMT-208	ENST00000472446	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PEMT-208	ENST00000472446	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PEMT-208	ENST00000472446	UTRN	P46939	3433 aa		32.29	■■■□□ 2.76
PEMT-208	ENST00000472446	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		32.28	■■■□□ 2.76
PEMT-208	ENST00000472446	GRIN3B	O60391	1043 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PEMT-208	ENST00000472446	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
PEMT-208	ENST00000472446	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
PEMT-208	ENST00000472446	PALLD	Q8WX93	1383 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PEMT-208	ENST00000472446	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	32.26	■■■□□ 2.75
PEMT-208	ENST00000472446	MSL1	Q68DK7	614 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PEMT-208	ENST00000472446	C1QTNF8	P60827	252 aa		32.24	■■■□□ 2.75
PEMT-208	ENST00000472446	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		32.24	■■■□□ 2.75
PEMT-208	ENST00000472446	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		32.24	■■■□□ 2.75
PEMT-208	ENST00000472446	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PEMT-208	ENST00000472446	C5	P01031	1676 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PEMT-208	ENST00000472446	CYP27B1	O15528	508 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PEMT-208	ENST00000472446	SPG7	Q9UQ90	795 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PEMT-208	ENST00000472446	AK7	Q96M32	723 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PEMT-208	ENST00000472446	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PEMT-208	ENST00000472446	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	32.2	■■■□□ 2.75
PEMT-208	ENST00000472446	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PEMT-208	ENST00000472446	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PEMT-208	ENST00000472446	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PEMT-208	ENST00000472446	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	32.14	■■■□□ 2.74
PEMT-208	ENST00000472446	PIGB	Q92521	554 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PEMT-208	ENST00000472446	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PEMT-208	ENST00000472446	ITGB4	P16144	1822 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PEMT-208	ENST00000472446	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PEMT-208	ENST00000472446	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	32.12	■■■□□ 2.73
PEMT-208	ENST00000472446	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PEMT-208	ENST00000472446	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PEMT-208	ENST00000472446	PHF14	O94880	888 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PEMT-208	ENST00000472446	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	32.11	■■■□□ 2.73
PEMT-208	ENST00000472446	C4B	P0C0L5	1744 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PEMT-208	ENST00000472446	EYA1	Q99502	592 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PEMT-208	ENST00000472446	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PEMT-208	ENST00000472446	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PEMT-208	ENST00000472446	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	32.09	■■■□□ 2.73
PEMT-208	ENST00000472446	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PEMT-208	ENST00000472446	SIK1	P57059	783 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PEMT-208	ENST00000472446	NCAPD2	Q15021	1401 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PEMT-208	ENST00000472446	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
PEMT-208	ENST00000472446	SSFA2	P28290	1259 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PEMT-208	ENST00000472446	POLK	Q9UBT6	870 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PEMT-208	ENST00000472446	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PEMT-208	ENST00000472446	ATP6V1A	P38606	617 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PEMT-208	ENST00000472446	PHKG2	P15735	406 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PEMT-208	ENST00000472446	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	32.02	■■■□□ 2.72
PEMT-208	ENST00000472446	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		32.01	■■■□□ 2.71
PEMT-208	ENST00000472446	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		32.01	■■■□□ 2.71
PEMT-208	ENST00000472446	GNPAT	O15228	680 aa		32	■■■□□ 2.71
PEMT-208	ENST00000472446	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PEMT-208	ENST00000472446	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	31.98	■■■□□ 2.71
PEMT-208	ENST00000472446	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		31.98	■■■□□ 2.71
PEMT-208	ENST00000472446	SMIM5	Q71RC9	77 aa		31.97	■■■□□ 2.71
PEMT-208	ENST00000472446	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		31.97	■■■□□ 2.71
PEMT-208	ENST00000472446	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		31.97	■■■□□ 2.71
PEMT-208	ENST00000472446	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71
PEMT-208	ENST00000472446	ATP10D	Q9P241	1426 aa		31.96	■■■□□ 2.71
PEMT-208	ENST00000472446	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	31.95	■■■□□ 2.71
PEMT-208	ENST00000472446	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		31.94	■■■□□ 2.7
PEMT-208	ENST00000472446	ITPK1	Q13572	414 aa		31.94	■■■□□ 2.7

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