RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472427.5

RALGPS1-212, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2

Gene RALGPS1, Length 764 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-212ENST00000472427 SPG7Q9UQ90 795 aa29.09■■■□□ 2.25
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RALGPS1-212ENST00000472427 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa29.07■■■□□ 2.24
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RALGPS1-212ENST00000472427 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
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RALGPS1-212ENST00000472427 PLEKHF1Q96S99 279 aa28.77■■■□□ 2.2
RALGPS1-212ENST00000472427 ERVV-2B6SEH9 535 aa28.76■■■□□ 2.19
RALGPS1-212ENST00000472427 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa28.76■■■□□ 2.19
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RALGPS1-212ENST00000472427 FAM9BQ8IZU0 186 aa28.65■■■□□ 2.18
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RALGPS1-212ENST00000472427 LGR6Q9HBX8 967 aa28.65■■■□□ 2.18
RALGPS1-212ENST00000472427 DLG5Q8TDM6 1919 aa28.64■■■□□ 2.18
RALGPS1-212ENST00000472427 TMPOP42166 694 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
RALGPS1-212ENST00000472427 RIPK4P57078 832 aa28.63■■■□□ 2.17
RALGPS1-212ENST00000472427 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
RALGPS1-212ENST00000472427 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa28.63■■■□□ 2.17
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