RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472108.1

USP20-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 2

Gene USP20, Length 1,811 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-204ENST00000472108 CRB1P82279 1406 aa21.12■□□□□ 0.97
USP20-204ENST00000472108 CHL1O00533 1208 aa21.11■□□□□ 0.97
USP20-204ENST00000472108 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
USP20-204ENST00000472108 AMOTQ4VCS5 1084 aa21.11■□□□□ 0.97
USP20-204ENST00000472108 ZNF428Q96B54 188 aa21.11■□□□□ 0.97
USP20-204ENST00000472108 MAP3K5Q99683 1374 aa21.1■□□□□ 0.97
USP20-204ENST00000472108 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
USP20-204ENST00000472108 PRDM11Q9NQV5 511 aa21.1■□□□□ 0.97
USP20-204ENST00000472108 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
USP20-204ENST00000472108 LMO7Q8WWI1 1683 aa21.1■□□□□ 0.97
USP20-204ENST00000472108 CRBNQ96SW2 442 aa21.09■□□□□ 0.97
USP20-204ENST00000472108 NLRP2Q9NX02 1062 aa21.09■□□□□ 0.97
USP20-204ENST00000472108 PDE3AQ14432 1141 aa21.08■□□□□ 0.97
USP20-204ENST00000472108 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa21.08■□□□□ 0.96
USP20-204ENST00000472108 VAMP4O75379 141 aa21.07■□□□□ 0.96
USP20-204ENST00000472108 ALDH1L2Q3SY69 923 aa21.07■□□□□ 0.96
USP20-204ENST00000472108 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.07■□□□□ 0.96
USP20-204ENST00000472108 IL17REQ8NFR9 667 aa21.07■□□□□ 0.96
USP20-204ENST00000472108 ABCA3Q99758 1704 aa21.07■□□□□ 0.96
USP20-204ENST00000472108 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
USP20-204ENST00000472108 SSH1Q8WYL5 1049 aa21.06■□□□□ 0.96
USP20-204ENST00000472108 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.06■□□□□ 0.96
USP20-204ENST00000472108 TOM1O60784 492 aa21.06■□□□□ 0.96
USP20-204ENST00000472108 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
USP20-204ENST00000472108 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
USP20-204ENST00000472108 AKAP4Q5JQC9 854 aa21.05■□□□□ 0.96
USP20-204ENST00000472108 TSPYL6Q8N831 410 aa21.05■□□□□ 0.96
USP20-204ENST00000472108 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.05■□□□□ 0.96
USP20-204ENST00000472108 C8orf58Q8NAV2 365 aa21.04■□□□□ 0.96
USP20-204ENST00000472108 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.04■□□□□ 0.96
USP20-204ENST00000472108 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
USP20-204ENST00000472108 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
USP20-204ENST00000472108 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa21.04■□□□□ 0.96
USP20-204ENST00000472108 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
USP20-204ENST00000472108 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
USP20-204ENST00000472108 BABAM1Q9NWV8 329 aa21.03■□□□□ 0.96
USP20-204ENST00000472108 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa21.03■□□□□ 0.96
USP20-204ENST00000472108 LRRC37A3O60309 1634 aa21.03■□□□□ 0.96
USP20-204ENST00000472108 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa21.02■□□□□ 0.96
USP20-204ENST00000472108 WDR17Q8IZU2 1322 aa21.02■□□□□ 0.95
USP20-204ENST00000472108 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.01■□□□□ 0.95
USP20-204ENST00000472108 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
USP20-204ENST00000472108 TATP17735 454 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
USP20-204ENST00000472108 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
USP20-204ENST00000472108 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.01■□□□□ 0.95
USP20-204ENST00000472108 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.01■□□□□ 0.95
USP20-204ENST00000472108 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.01■□□□□ 0.95
USP20-204ENST00000472108 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP21.01■□□□□ 0.95
USP20-204ENST00000472108 MIS18AQ9NYP9 233 aa21.01■□□□□ 0.95
USP20-204ENST00000472108 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
USP20-204ENST00000472108 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
USP20-204ENST00000472108 KIF16BQ96L93 1317 aa20.99■□□□□ 0.95
USP20-204ENST00000472108 MS4A1P11836 297 aa20.99■□□□□ 0.95
USP20-204ENST00000472108 PANK1Q8TE04 598 aa20.99■□□□□ 0.95
USP20-204ENST00000472108 LGR6Q9HBX8 967 aa20.99■□□□□ 0.95
USP20-204ENST00000472108 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
USP20-204ENST00000472108 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
USP20-204ENST00000472108 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa20.97■□□□□ 0.95
USP20-204ENST00000472108 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
USP20-204ENST00000472108 SPG7Q9UQ90 795 aa20.97■□□□□ 0.95
USP20-204ENST00000472108 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
USP20-204ENST00000472108 PIP4K2BP78356 416 aa20.97■□□□□ 0.95
USP20-204ENST00000472108 MEGF6O75095 1541 aa20.96■□□□□ 0.95
USP20-204ENST00000472108 PHLPP1O60346 1717 aa20.96■□□□□ 0.95
USP20-204ENST00000472108 RNMTO43148 476 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
USP20-204ENST00000472108 KRT24Q2M2I5 525 aa20.96■□□□□ 0.95
USP20-204ENST00000472108 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa20.96■□□□□ 0.95
USP20-204ENST00000472108 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa20.96■□□□□ 0.95
USP20-204ENST00000472108 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa20.95■□□□□ 0.94
USP20-204ENST00000472108 RLBP1P12271 317 aa20.95■□□□□ 0.94
USP20-204ENST00000472108 EVA1CP58658 441 aa20.95■□□□□ 0.94
USP20-204ENST00000472108 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
USP20-204ENST00000472108 CARD10Q9BWT7 1032 aa20.95■□□□□ 0.94
USP20-204ENST00000472108 COG6Q9Y2V7 657 aa20.95■□□□□ 0.94
USP20-204ENST00000472108 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
USP20-204ENST00000472108 UBAP1LF5GYI3 381 aa20.94■□□□□ 0.94
USP20-204ENST00000472108 TRIM27P14373 513 aa20.94■□□□□ 0.94
USP20-204ENST00000472108 TNNQ9UQP3 1299 aa20.94■□□□□ 0.94
USP20-204ENST00000472108 ARHGAP45Q92619 1136 aa20.94■□□□□ 0.94
USP20-204ENST00000472108 TEFQ10587 303 aa20.93■□□□□ 0.94
USP20-204ENST00000472108 CLUAP1Q96AJ1 413 aa20.93■□□□□ 0.94
USP20-204ENST00000472108 AAMPQ13685 434 aa20.92■□□□□ 0.94
USP20-204ENST00000472108 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
USP20-204ENST00000472108 STRN4Q9NRL3 753 aa20.92■□□□□ 0.94
USP20-204ENST00000472108 PHKG2P15735 406 aa20.92■□□□□ 0.94
USP20-204ENST00000472108 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
USP20-204ENST00000472108 IFNL2Q8IZJ0 200 aa20.92■□□□□ 0.94
USP20-204ENST00000472108 BTG4Q9NY30 223 aa20.92■□□□□ 0.94
USP20-204ENST00000472108 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
USP20-204ENST00000472108 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
USP20-204ENST00000472108 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa20.9■□□□□ 0.94
USP20-204ENST00000472108 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
USP20-204ENST00000472108 MVPQ14764 893 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
USP20-204ENST00000472108 PKD1L3Q7Z443 1732 aa20.89■□□□□ 0.93
USP20-204ENST00000472108 BTBD11A6QL63 1104 aa20.88■□□□□ 0.93
USP20-204ENST00000472108 CYP27B1O15528 508 aa20.88■□□□□ 0.93
USP20-204ENST00000472108 IL2RBP14784 551 aa20.88■□□□□ 0.93
USP20-204ENST00000472108 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
USP20-204ENST00000472108 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
USP20-204ENST00000472108 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms