RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468576.1

PTPRG-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRG, Length 854 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-202ENST00000468576 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRG-202ENST00000468576 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa11.7□□□□□ -0.54
PTPRG-202ENST00000468576 GSK3AP49840 483 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRG-202ENST00000468576 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
PTPRG-202ENST00000468576 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa11.69□□□□□ -0.54
PTPRG-202ENST00000468576 RHOQP17081 205 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRG-202ENST00000468576 CCDC125Q86Z20 511 aa11.68□□□□□ -0.54
PTPRG-202ENST00000468576 A0A1W2PRU2 124 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPRG-202ENST00000468576 SLURP2P0DP57 97 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPRG-202ENST00000468576 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PTPRG-202ENST00000468576 RNF20Q5VTR2 975 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPRG-202ENST00000468576 WHAMMQ8TF30 809 aa11.67□□□□□ -0.54
PTPRG-202ENST00000468576 MEN1O00255 615 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRG-202ENST00000468576 GPC1P35052 558 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRG-202ENST00000468576 TRIM52Q96A61 297 aa11.66□□□□□ -0.54
PTPRG-202ENST00000468576 TRAK2O60296 914 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRG-202ENST00000468576 KCNMA1Q12791 1236 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRG-202ENST00000468576 TPRNQ4KMQ1 711 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRG-202ENST00000468576 OSBPL3Q9H4L5 887 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRG-202ENST00000468576 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRG-202ENST00000468576 GAS6Q14393 721 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRG-202ENST00000468576 ADAMTS8Q9UP79 889 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRG-202ENST00000468576 CYP2U1Q7Z449 544 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRG-202ENST00000468576 GRIP2Q9C0E4 1043 aa11.62□□□□□ -0.55
PTPRG-202ENST00000468576 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
PTPRG-202ENST00000468576 ARHGEF15O94989 841 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRG-202ENST00000468576 CLN3Q13286 438 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRG-202ENST00000468576 SVOPQ8N4V2 548 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRG-202ENST00000468576 ZNF592Q92610 1267 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRG-202ENST00000468576 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
PTPRG-202ENST00000468576 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PTPRG-202ENST00000468576 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRG-202ENST00000468576 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRG-202ENST00000468576 APBB1O00213 710 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRG-202ENST00000468576 POU4F2Q12837 409 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRG-202ENST00000468576 TRIM22Q8IYM9 498 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRG-202ENST00000468576 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PTPRG-202ENST00000468576 CEP126Q9P2H0 1117 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRG-202ENST00000468576 ADAMTS2O95450 1211 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRG-202ENST00000468576 DBN1Q16643 649 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRG-202ENST00000468576 NLRP3Q96P20 1036 aa11.58□□□□□ -0.56
PTPRG-202ENST00000468576 SLC27A3Q5K4L6 730 aa11.57□□□□□ -0.56
PTPRG-202ENST00000468576 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
PTPRG-202ENST00000468576 NBPF15Q8N660 670 aa11.57□□□□□ -0.56
PTPRG-202ENST00000468576 RAB6BQ9NRW1 208 aa11.57□□□□□ -0.56
PTPRG-202ENST00000468576 DYRK1BQ9Y463 629 aa11.57□□□□□ -0.56
PTPRG-202ENST00000468576 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa11.56□□□□□ -0.56
PTPRG-202ENST00000468576 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
PTPRG-202ENST00000468576 IRF5Q13568 498 aa11.56□□□□□ -0.56
PTPRG-202ENST00000468576 LYPD4Q6UWN0 246 aa11.56□□□□□ -0.56
PTPRG-202ENST00000468576 GPR25O00155 361 aa11.55□□□□□ -0.56
PTPRG-202ENST00000468576 GMCL1Q96IK5 515 aa11.55□□□□□ -0.56
PTPRG-202ENST00000468576 IL2RAP01589 272 aa11.54□□□□□ -0.56
PTPRG-202ENST00000468576 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa11.54□□□□□ -0.56
PTPRG-202ENST00000468576 GNRH1P01148 92 aa11.53□□□□□ -0.56
PTPRG-202ENST00000468576 RASSF7Q02833 373 aa11.53□□□□□ -0.56
PTPRG-202ENST00000468576 TSGA10IPQ3SY00 556 aa11.53□□□□□ -0.56
PTPRG-202ENST00000468576 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
PTPRG-202ENST00000468576 HRH3Q9Y5N1 445 aa11.53□□□□□ -0.56
PTPRG-202ENST00000468576 PHTF2Q8N3S3 785 aa11.52□□□□□ -0.57
PTPRG-202ENST00000468576 KCTD17Q8N5Z5 321 aa11.52□□□□□ -0.57
PTPRG-202ENST00000468576 WASLO00401 505 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
PTPRG-202ENST00000468576 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
PTPRG-202ENST00000468576 WDR44Q5JSH3 913 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRG-202ENST00000468576 CNKSR1Q969H4 720 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRG-202ENST00000468576 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRG-202ENST00000468576 MBIPQ9NS73 344 aa11.51□□□□□ -0.57
PTPRG-202ENST00000468576 THBS1P07996 1170 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRG-202ENST00000468576 CENPCQ03188 943 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRG-202ENST00000468576 TAS1R3Q7RTX0 852 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRG-202ENST00000468576 TMEM151AQ8N4L1 468 aa11.5□□□□□ -0.57
PTPRG-202ENST00000468576 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
PTPRG-202ENST00000468576 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PTPRG-202ENST00000468576 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PTPRG-202ENST00000468576 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
PTPRG-202ENST00000468576 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa11.49□□□□□ -0.57
PTPRG-202ENST00000468576 H7C1W4 665 aa11.48□□□□□ -0.57
PTPRG-202ENST00000468576 GDF11O95390 407 aa11.48□□□□□ -0.57
PTPRG-202ENST00000468576 MYCP01106 439 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
PTPRG-202ENST00000468576 XAGE2Q96GT9 111 aa11.48□□□□□ -0.57
PTPRG-202ENST00000468576 IGF1RP08069 1367 aa11.48□□□□□ -0.57
PTPRG-202ENST00000468576 STAU1O95793 577 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
PTPRG-202ENST00000468576 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP11.46□□□□□ -0.57
PTPRG-202ENST00000468576 FOXR1Q6PIV2 292 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRG-202ENST00000468576 CHIC2Q9UKJ5 165 aa11.46□□□□□ -0.57
PTPRG-202ENST00000468576 F11P03951 625 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRG-202ENST00000468576 IRS1P35568 1242 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRG-202ENST00000468576 VAC14Q08AM6 782 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRG-202ENST00000468576 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
PTPRG-202ENST00000468576 DOLKQ9UPQ8 538 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRG-202ENST00000468576 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
PTPRG-202ENST00000468576 ETNK1Q9HBU6 452 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRG-202ENST00000468576 GDPD2Q9HCC8 539 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRG-202ENST00000468576 PHKA2P46019 1235 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRG-202ENST00000468576 MARSP56192 900 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
PTPRG-202ENST00000468576 MAP3K10Q02779 954 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRG-202ENST00000468576 ACDQ96AP0 544 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRG-202ENST00000468576 PRM3Q9NNZ6 103 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRG-202ENST00000468576 SLFNL1Q499Z3 407 aa11.42□□□□□ -0.58
PTPRG-202ENST00000468576 RNF135Q8IUD6 432 aa11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms