RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468247.1

RERE-210, Transcript of arginine-glutamic acid dipeptide repeats, humanhuman

TSL 2

Gene RERE, Length 414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RERE-210ENST00000468247 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
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RERE-210ENST00000468247 PANK3Q9H999 370 aa28.96■■■□□ 2.23
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RERE-210ENST00000468247 POLKQ9UBT6 870 aa28.93■■■□□ 2.22
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RERE-210ENST00000468247 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa28.83■■■□□ 2.21
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RERE-210ENST00000468247 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
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RERE-210ENST00000468247 SLC16A10Q8TF71 515 aa28.58■■■□□ 2.17
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RERE-210ENST00000468247 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
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RERE-210ENST00000468247 LINC00116Q8NCU8 138 aa28.48■■■□□ 2.15
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RERE-210ENST00000468247 ERVV-2B6SEH9 535 aa28.47■■■□□ 2.15
RERE-210ENST00000468247 MSL1Q68DK7 614 aa28.47■■■□□ 2.15
RERE-210ENST00000468247 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
RERE-210ENST00000468247 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa28.46■■■□□ 2.15
RERE-210ENST00000468247 UTRNP46939 3433 aa28.45■■■□□ 2.15
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