RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	SBF2	Q86WG5	1849 aa		24.02	■■□□□ 1.44
USP19-210	ENST00000465902	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	24.01	■■□□□ 1.43
USP19-210	ENST00000465902	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	24.01	■■□□□ 1.43
USP19-210	ENST00000465902	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		24	■■□□□ 1.43
USP19-210	ENST00000465902	BCL9	O00512	1426 aa		23.96	■■□□□ 1.43
USP19-210	ENST00000465902	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	23.96	■■□□□ 1.43
USP19-210	ENST00000465902	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		23.95	■■□□□ 1.42
USP19-210	ENST00000465902	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		23.95	■■□□□ 1.42
USP19-210	ENST00000465902	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		23.94	■■□□□ 1.42
USP19-210	ENST00000465902	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	23.93	■■□□□ 1.42
USP19-210	ENST00000465902	IL13	P35225	146 aa		23.93	■■□□□ 1.42
USP19-210	ENST00000465902	NCAPD2	Q15021	1401 aa		23.93	■■□□□ 1.42
USP19-210	ENST00000465902	PPP2R1A	P30153	589 aa		23.92	■■□□□ 1.42
USP19-210	ENST00000465902	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	23.92	■■□□□ 1.42
USP19-210	ENST00000465902	SPG7	Q9UQ90	795 aa		23.92	■■□□□ 1.42
USP19-210	ENST00000465902	PLSCR1	O15162	318 aa		23.91	■■□□□ 1.42
USP19-210	ENST00000465902	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	23.91	■■□□□ 1.42
USP19-210	ENST00000465902	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		23.91	■■□□□ 1.42
USP19-210	ENST00000465902	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		23.91	■■□□□ 1.42
USP19-210	ENST00000465902	CFAP53	Q96M91	514 aa		23.91	■■□□□ 1.42
USP19-210	ENST00000465902	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		23.9	■■□□□ 1.42
USP19-210	ENST00000465902	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		23.9	■■□□□ 1.42
USP19-210	ENST00000465902	KCNQ2	O43526	872 aa		23.9	■■□□□ 1.42
USP19-210	ENST00000465902	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	23.89	■■□□□ 1.41
USP19-210	ENST00000465902	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		23.89	■■□□□ 1.41
USP19-210	ENST00000465902	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	23.89	■■□□□ 1.41
USP19-210	ENST00000465902	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		23.89	■■□□□ 1.41
USP19-210	ENST00000465902	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	23.88	■■□□□ 1.41
USP19-210	ENST00000465902	NHS	Q6T4R5	1651 aa		23.87	■■□□□ 1.41
USP19-210	ENST00000465902	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		23.87	■■□□□ 1.41
USP19-210	ENST00000465902	HMOX1	P09601	288 aa		23.86	■■□□□ 1.41
USP19-210	ENST00000465902	NBPF14	Q5TI25	921 aa		23.86	■■□□□ 1.41
USP19-210	ENST00000465902	CYP27B1	O15528	508 aa		23.85	■■□□□ 1.41
USP19-210	ENST00000465902	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	23.85	■■□□□ 1.41
USP19-210	ENST00000465902	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	23.84	■■□□□ 1.41
USP19-210	ENST00000465902	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	23.84	■■□□□ 1.41
USP19-210	ENST00000465902	BTAF1	O14981	1849 aa		23.84	■■□□□ 1.41
USP19-210	ENST00000465902	RREB1	Q92766	1687 aa		23.83	■■□□□ 1.4
USP19-210	ENST00000465902	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	23.82	■■□□□ 1.4
USP19-210	ENST00000465902	RALBP1	Q15311	655 aa		23.82	■■□□□ 1.4
USP19-210	ENST00000465902	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		23.81	■■□□□ 1.4
USP19-210	ENST00000465902	PROM2	Q8N271	834 aa		23.81	■■□□□ 1.4
USP19-210	ENST00000465902	NUDC	Q9Y266	331 aa		23.81	■■□□□ 1.4
USP19-210	ENST00000465902	LRP5	O75197	1615 aa		23.81	■■□□□ 1.4
USP19-210	ENST00000465902	KDR	P35968	1356 aa		23.8	■■□□□ 1.4
USP19-210	ENST00000465902	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		23.8	■■□□□ 1.4
USP19-210	ENST00000465902	PHKG2	P15735	406 aa		23.79	■■□□□ 1.4
USP19-210	ENST00000465902	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	23.79	■■□□□ 1.4
USP19-210	ENST00000465902	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		23.79	■■□□□ 1.4
USP19-210	ENST00000465902	ITGB4	P16144	1822 aa		23.77	■■□□□ 1.4
USP19-210	ENST00000465902	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		23.77	■■□□□ 1.4
USP19-210	ENST00000465902	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	23.77	■■□□□ 1.4
USP19-210	ENST00000465902	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		23.77	■■□□□ 1.4
USP19-210	ENST00000465902	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		23.77	■■□□□ 1.4
USP19-210	ENST00000465902	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	23.76	■■□□□ 1.39
USP19-210	ENST00000465902	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	23.76	■■□□□ 1.39
USP19-210	ENST00000465902	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		23.76	■■□□□ 1.39
USP19-210	ENST00000465902	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	23.75	■■□□□ 1.39
USP19-210	ENST00000465902	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		23.74	■■□□□ 1.39
USP19-210	ENST00000465902	TXNRD1	Q16881	649 aa		23.74	■■□□□ 1.39
USP19-210	ENST00000465902	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	23.73	■■□□□ 1.39
USP19-210	ENST00000465902	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	23.72	■■□□□ 1.39
USP19-210	ENST00000465902	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	23.72	■■□□□ 1.39
USP19-210	ENST00000465902	DCAF5	Q96JK2	942 aa		23.7	■■□□□ 1.38
USP19-210	ENST00000465902	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		23.7	■■□□□ 1.38
USP19-210	ENST00000465902	PRKAR2B	P31323	418 aa		23.69	■■□□□ 1.38
USP19-210	ENST00000465902	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	23.69	■■□□□ 1.38
USP19-210	ENST00000465902	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	23.68	■■□□□ 1.38
USP19-210	ENST00000465902	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	23.68	■■□□□ 1.38
USP19-210	ENST00000465902	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		23.67	■■□□□ 1.38
USP19-210	ENST00000465902	PIGB	Q92521	554 aa		23.67	■■□□□ 1.38
USP19-210	ENST00000465902	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		23.67	■■□□□ 1.38
USP19-210	ENST00000465902	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		23.65	■■□□□ 1.38
USP19-210	ENST00000465902	FCHSD2	O94868	740 aa		23.65	■■□□□ 1.38
USP19-210	ENST00000465902	CABP4	P57796	275 aa		23.65	■■□□□ 1.38
USP19-210	ENST00000465902	SPON1	Q9HCB6	807 aa		23.65	■■□□□ 1.38
USP19-210	ENST00000465902	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		23.65	■■□□□ 1.38
USP19-210	ENST00000465902	LY75	O60449	1722 aa		23.64	■■□□□ 1.38
USP19-210	ENST00000465902	KCNQ4	P56696	695 aa		23.64	■■□□□ 1.37
USP19-210	ENST00000465902	SLC15A2	Q16348	729 aa		23.64	■■□□□ 1.37
USP19-210	ENST00000465902	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		23.64	■■□□□ 1.37
USP19-210	ENST00000465902	STK32B	Q9NY57	414 aa		23.64	■■□□□ 1.37
USP19-210	ENST00000465902	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	23.64	■■□□□ 1.37
USP19-210	ENST00000465902	NEFM	P07197	916 aa		23.63	■■□□□ 1.37
USP19-210	ENST00000465902	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	23.63	■■□□□ 1.37
USP19-210	ENST00000465902	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		23.63	■■□□□ 1.37
USP19-210	ENST00000465902	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		23.62	■■□□□ 1.37
USP19-210	ENST00000465902	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		23.62	■■□□□ 1.37
USP19-210	ENST00000465902	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	23.62	■■□□□ 1.37
USP19-210	ENST00000465902	PALLD	Q8WX93	1383 aa		23.62	■■□□□ 1.37
USP19-210	ENST00000465902	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		23.61	■■□□□ 1.37
USP19-210	ENST00000465902	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		23.6	■■□□□ 1.37
USP19-210	ENST00000465902	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	23.6	■■□□□ 1.37
USP19-210	ENST00000465902	LGR6	Q9HBX8	967 aa		23.6	■■□□□ 1.37
USP19-210	ENST00000465902	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		23.59	■■□□□ 1.37
USP19-210	ENST00000465902	ANP32C	O43423	234 aa		23.59	■■□□□ 1.37
USP19-210	ENST00000465902	MAP3K5	Q99683	1374 aa		23.58	■■□□□ 1.37
USP19-210	ENST00000465902	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	23.58	■■□□□ 1.37
USP19-210	ENST00000465902	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	23.58	■■□□□ 1.37
USP19-210	ENST00000465902	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	23.57	■■□□□ 1.36

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