RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462351.5

PTPRN-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRN, Length 5,099 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRN-211ENST00000462351 PRIMPOLQ96LW4 560 aa16.93■□□□□ 0.3
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PTPRN-211ENST00000462351 PAF1Q8N7H5 531 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRN-211ENST00000462351 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
PTPRN-211ENST00000462351 KRT222Q8N1A0 295 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRN-211ENST00000462351 PRKAR2BP31323 418 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRN-211ENST00000462351 EIF5P55010 431 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
PTPRN-211ENST00000462351 TRIM22Q8IYM9 498 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRN-211ENST00000462351 CCDC113Q9H0I3 377 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRN-211ENST00000462351 SPDYE4A6NLX3 237 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRN-211ENST00000462351 CD109Q6YHK3 1445 aa16.89■□□□□ 0.29
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