RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461648.2

TSC2-208, Transcript of TSC complex subunit 2, human

TSL 2

Gene TSC2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSC2-208	ENST00000461648	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		34.09	■■■■□ 3.05
TSC2-208	ENST00000461648	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	34.08	■■■■□ 3.05
TSC2-208	ENST00000461648	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	34.08	■■■■□ 3.05
TSC2-208	ENST00000461648	PDE3B	Q13370	1112 aa		34.08	■■■■□ 3.05
TSC2-208	ENST00000461648	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		34.07	■■■■□ 3.04
TSC2-208	ENST00000461648	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		34.05	■■■■□ 3.04
TSC2-208	ENST00000461648	CCDC184	Q52MB2	194 aa		34.05	■■■■□ 3.04
TSC2-208	ENST00000461648	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	34.05	■■■■□ 3.04
TSC2-208	ENST00000461648	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		34.05	■■■■□ 3.04
TSC2-208	ENST00000461648	MRS2	Q9HD23	443 aa		34.01	■■■■□ 3.03
TSC2-208	ENST00000461648	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	34.01	■■■■□ 3.03
TSC2-208	ENST00000461648	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		34	■■■■□ 3.03
TSC2-208	ENST00000461648	SPG7	Q9UQ90	795 aa		34	■■■■□ 3.03
TSC2-208	ENST00000461648	FCHSD2	O94868	740 aa		33.99	■■■■□ 3.03
TSC2-208	ENST00000461648	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	33.99	■■■■□ 3.03
TSC2-208	ENST00000461648	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	33.99	■■■■□ 3.03
TSC2-208	ENST00000461648	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	33.98	■■■■□ 3.03
TSC2-208	ENST00000461648	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	33.98	■■■■□ 3.03
TSC2-208	ENST00000461648	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		33.97	■■■■□ 3.03
TSC2-208	ENST00000461648	FAM182B	Q5T319	152 aa		33.97	■■■■□ 3.03
TSC2-208	ENST00000461648	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		33.97	■■■■□ 3.03
TSC2-208	ENST00000461648	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		33.97	■■■■□ 3.03
TSC2-208	ENST00000461648	PRKAR2B	P31323	418 aa		33.96	■■■■□ 3.03
TSC2-208	ENST00000461648	CYP27B1	O15528	508 aa		33.91	■■■■□ 3.02
TSC2-208	ENST00000461648	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		33.91	■■■■□ 3.02
TSC2-208	ENST00000461648	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	33.91	■■■■□ 3.02
TSC2-208	ENST00000461648	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		33.9	■■■■□ 3.02
TSC2-208	ENST00000461648	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	33.89	■■■■□ 3.02
TSC2-208	ENST00000461648	MIER1	Q8N108	512 aa		33.89	■■■■□ 3.02
TSC2-208	ENST00000461648	CCER2	I3L3R5	266 aa		33.88	■■■■□ 3.01
TSC2-208	ENST00000461648	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		33.88	■■■■□ 3.01
TSC2-208	ENST00000461648	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	33.88	■■■■□ 3.01
TSC2-208	ENST00000461648	BCL9	O00512	1426 aa		33.87	■■■■□ 3.01
TSC2-208	ENST00000461648	PHKG2	P15735	406 aa		33.87	■■■■□ 3.01
TSC2-208	ENST00000461648	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	33.87	■■■■□ 3.01
TSC2-208	ENST00000461648	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		33.87	■■■■□ 3.01
TSC2-208	ENST00000461648	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		33.87	■■■■□ 3.01
TSC2-208	ENST00000461648	SBF2	Q86WG5	1849 aa		33.86	■■■■□ 3.01
TSC2-208	ENST00000461648	NEFM	P07197	916 aa		33.85	■■■■□ 3.01
TSC2-208	ENST00000461648	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		33.84	■■■■□ 3.01
TSC2-208	ENST00000461648	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		33.84	■■■■□ 3.01
TSC2-208	ENST00000461648	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	33.82	■■■■□ 3
TSC2-208	ENST00000461648	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		33.81	■■■■□ 3
TSC2-208	ENST00000461648	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		33.81	■■■■□ 3
TSC2-208	ENST00000461648	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		33.81	■■■■□ 3
TSC2-208	ENST00000461648	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		33.8	■■■■□ 3
TSC2-208	ENST00000461648	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	33.79	■■■■□ 3
TSC2-208	ENST00000461648	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		33.79	■■■■□ 3
TSC2-208	ENST00000461648	RUNDC1	Q96C34	613 aa		33.78	■■■■□ 3
TSC2-208	ENST00000461648	NHS	Q6T4R5	1651 aa		33.77	■■■■□ 3
TSC2-208	ENST00000461648	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		33.77	■■■■□ 3
TSC2-208	ENST00000461648	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		33.76	■■■□□ 2.99
TSC2-208	ENST00000461648	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	33.75	■■■□□ 2.99
TSC2-208	ENST00000461648	TRIM37	O94972	964 aa		33.75	■■■□□ 2.99
TSC2-208	ENST00000461648	MAP3K5	Q99683	1374 aa		33.74	■■■□□ 2.99
TSC2-208	ENST00000461648	EP400	Q96L91	3159 aa		33.74	■■■□□ 2.99
TSC2-208	ENST00000461648	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		33.74	■■■□□ 2.99
TSC2-208	ENST00000461648	DCAF5	Q96JK2	942 aa		33.74	■■■□□ 2.99
TSC2-208	ENST00000461648	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		33.74	■■■□□ 2.99
TSC2-208	ENST00000461648	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		33.74	■■■□□ 2.99
TSC2-208	ENST00000461648	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	33.73	■■■□□ 2.99
TSC2-208	ENST00000461648	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		33.73	■■■□□ 2.99
TSC2-208	ENST00000461648	ITGB4	P16144	1822 aa		33.72	■■■□□ 2.99
TSC2-208	ENST00000461648	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		33.72	■■■□□ 2.99
TSC2-208	ENST00000461648	NFE2L2	Q16236	605 aa		33.72	■■■□□ 2.99
TSC2-208	ENST00000461648	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	33.72	■■■□□ 2.99
TSC2-208	ENST00000461648	KCNQ2	O43526	872 aa		33.71	■■■□□ 2.99
TSC2-208	ENST00000461648	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	33.71	■■■□□ 2.99
TSC2-208	ENST00000461648	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	33.7	■■■□□ 2.99
TSC2-208	ENST00000461648	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	33.7	■■■□□ 2.99
TSC2-208	ENST00000461648	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		33.7	■■■□□ 2.99
TSC2-208	ENST00000461648	CCDC125	Q86Z20	511 aa		33.69	■■■□□ 2.98
TSC2-208	ENST00000461648	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		33.68	■■■□□ 2.98
TSC2-208	ENST00000461648	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	33.68	■■■□□ 2.98
TSC2-208	ENST00000461648	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	33.67	■■■□□ 2.98
TSC2-208	ENST00000461648	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		33.66	■■■□□ 2.98
TSC2-208	ENST00000461648	BTAF1	O14981	1849 aa		33.66	■■■□□ 2.98
TSC2-208	ENST00000461648	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	33.66	■■■□□ 2.98
TSC2-208	ENST00000461648	LGR6	Q9HBX8	967 aa		33.66	■■■□□ 2.98
TSC2-208	ENST00000461648	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	33.65	■■■□□ 2.98
TSC2-208	ENST00000461648	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	33.64	■■■□□ 2.98
TSC2-208	ENST00000461648	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	33.64	■■■□□ 2.98
TSC2-208	ENST00000461648	APAF1	O14727	1248 aa		33.62	■■■□□ 2.97
TSC2-208	ENST00000461648	RIPK4	P57078	832 aa		33.62	■■■□□ 2.97
TSC2-208	ENST00000461648	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		33.62	■■■□□ 2.97
TSC2-208	ENST00000461648	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		33.62	■■■□□ 2.97
TSC2-208	ENST00000461648	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	33.62	■■■□□ 2.97
TSC2-208	ENST00000461648	CABP4	P57796	275 aa		33.61	■■■□□ 2.97
TSC2-208	ENST00000461648	SOCS7	O14512	581 aa		33.6	■■■□□ 2.97
TSC2-208	ENST00000461648	APBA3	O96018	575 aa		33.6	■■■□□ 2.97
TSC2-208	ENST00000461648	MRC1	P22897	1456 aa		33.6	■■■□□ 2.97
TSC2-208	ENST00000461648	NEUROD2	Q15784	382 aa		33.59	■■■□□ 2.97
TSC2-208	ENST00000461648	PIGB	Q92521	554 aa		33.59	■■■□□ 2.97
TSC2-208	ENST00000461648	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		33.59	■■■□□ 2.97
TSC2-208	ENST00000461648	MCM10	Q7L590	875 aa		33.58	■■■□□ 2.97
TSC2-208	ENST00000461648	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		33.57	■■■□□ 2.96
TSC2-208	ENST00000461648	DCTN1	Q14203	1278 aa		33.57	■■■□□ 2.96
TSC2-208	ENST00000461648	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		33.57	■■■□□ 2.96
TSC2-208	ENST00000461648	BAG6	P46379	1132 aa		33.56	■■■□□ 2.96
TSC2-208	ENST00000461648	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		33.56	■■■□□ 2.96

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