RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461018.5

CNN3-204, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-204ENST00000461018 AMHR2Q16671 573 aa7.42□□□□□ -1.22
CNN3-204ENST00000461018 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
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CNN3-204ENST00000461018 HOXA2O43364 376 aa7.41□□□□□ -1.22
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CNN3-204ENST00000461018 RXRBP28702 533 aa7.41□□□□□ -1.22
CNN3-204ENST00000461018 USP46P62068 366 aa7.41□□□□□ -1.22
CNN3-204ENST00000461018 Q3C1V9 767 aa7.41□□□□□ -1.22
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CNN3-204ENST00000461018 J3QL48 77 aa7.36□□□□□ -1.23
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CNN3-204ENST00000461018 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa7.32□□□□□ -1.24
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CNN3-204ENST00000461018 RETREG3Q86VR2 466 aa7.3□□□□□ -1.24
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CNN3-204ENST00000461018 TXNDC2Q86VQ3 553 aa7.29□□□□□ -1.24
CNN3-204ENST00000461018 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
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CNN3-204ENST00000461018 ATP7AQ04656 1500 aa7.28□□□□□ -1.24
CNN3-204ENST00000461018 SYCP2Q9BX26 1530 aa7.28□□□□□ -1.24
CNN3-204ENST00000461018 PREX2Q70Z35 1606 aa7.28□□□□□ -1.24
CNN3-204ENST00000461018 JUNDP17535 347 aa7.28□□□□□ -1.24
CNN3-204ENST00000461018 WNT7BP56706 349 aa7.28□□□□□ -1.24
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CNN3-204ENST00000461018 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
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