RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443703.1

SETD4-211, Transcript of SET domain containing 4, humanhuman

TSL 5

Gene SETD4, Length 707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4-211ENST00000443703 NSD2O96028 1365 aa25.45■■□□□ 1.67
SETD4-211ENST00000443703 A0A1W2PP64 1363 aa25.44■■□□□ 1.66
SETD4-211ENST00000443703 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
SETD4-211ENST00000443703 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP25.43■■□□□ 1.66
SETD4-211ENST00000443703 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
SETD4-211ENST00000443703 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
SETD4-211ENST00000443703 LTN1O94822 1766 aa25.43■■□□□ 1.66
SETD4-211ENST00000443703 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.43■■□□□ 1.66
SETD4-211ENST00000443703 GRIN3BO60391 1043 aa25.42■■□□□ 1.66
SETD4-211ENST00000443703 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.42■■□□□ 1.66
SETD4-211ENST00000443703 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
SETD4-211ENST00000443703 MAP3K19Q56UN5 1328 aa25.4■■□□□ 1.66
SETD4-211ENST00000443703 HOXC9P31274 260 aa25.4■■□□□ 1.66
SETD4-211ENST00000443703 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
SETD4-211ENST00000443703 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
SETD4-211ENST00000443703 IFFO2Q5TF58 517 aa25.39■■□□□ 1.66
SETD4-211ENST00000443703 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.37■■□□□ 1.65
SETD4-211ENST00000443703 FBLN1P23142 703 aa25.37■■□□□ 1.65
SETD4-211ENST00000443703 SHANK3Q9BYB0 1731 aa25.36■■□□□ 1.65
SETD4-211ENST00000443703 COG3Q96JB2 828 aa25.35■■□□□ 1.65
SETD4-211ENST00000443703 AMPHP49418 695 aa25.34■■□□□ 1.65
SETD4-211ENST00000443703 MEGF6O75095 1541 aa25.33■■□□□ 1.65
SETD4-211ENST00000443703 NBPF6Q5VWK0 638 aa25.33■■□□□ 1.65
SETD4-211ENST00000443703 NBPF4Q96M43 638 aa25.33■■□□□ 1.65
SETD4-211ENST00000443703 USP47Q96K76 1375 aa25.32■■□□□ 1.64
SETD4-211ENST00000443703 LY75O60449 1722 aa25.32■■□□□ 1.64
SETD4-211ENST00000443703 CD2APQ9Y5K6 639 aa25.32■■□□□ 1.64
SETD4-211ENST00000443703 MSH5O43196 834 aa25.31■■□□□ 1.64
SETD4-211ENST00000443703 TESK2Q96S53 571 aa25.31■■□□□ 1.64
SETD4-211ENST00000443703 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
SETD4-211ENST00000443703 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.31■■□□□ 1.64
SETD4-211ENST00000443703 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa25.3■■□□□ 1.64
SETD4-211ENST00000443703 MSL1Q68DK7 614 aa25.29■■□□□ 1.64
SETD4-211ENST00000443703 DOT1LQ8TEK3 1739 aa25.27■■□□□ 1.64
SETD4-211ENST00000443703 FLAD1Q8NFF5 587 aa25.27■■□□□ 1.64
SETD4-211ENST00000443703 ATP10DQ9P241 1426 aa25.27■■□□□ 1.64
SETD4-211ENST00000443703 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
SETD4-211ENST00000443703 RTL1A6NKG5 1358 aa25.26■■□□□ 1.63
SETD4-211ENST00000443703 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
SETD4-211ENST00000443703 USHBP1Q8N6Y0 703 aa25.24■■□□□ 1.63
SETD4-211ENST00000443703 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.24■■□□□ 1.63
SETD4-211ENST00000443703 FYB1O15117 783 aa25.23■■□□□ 1.63
SETD4-211ENST00000443703 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
SETD4-211ENST00000443703 ADCY9O60503 1353 aa25.22■■□□□ 1.63
SETD4-211ENST00000443703 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.22■■□□□ 1.63
SETD4-211ENST00000443703 SLC24A1O60721 1099 aa25.21■■□□□ 1.63
SETD4-211ENST00000443703 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SETD4-211ENST00000443703 PALLDQ8WX93 1383 aa25.2■■□□□ 1.63
SETD4-211ENST00000443703 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
SETD4-211ENST00000443703 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.2■■□□□ 1.62
SETD4-211ENST00000443703 CYP27B1O15528 508 aa25.19■■□□□ 1.62
SETD4-211ENST00000443703 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.18■■□□□ 1.62
SETD4-211ENST00000443703 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.18■■□□□ 1.62
SETD4-211ENST00000443703 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa25.18■■□□□ 1.62
SETD4-211ENST00000443703 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.18■■□□□ 1.62
SETD4-211ENST00000443703 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.18■■□□□ 1.62
SETD4-211ENST00000443703 HSPA6P17066 643 aa25.17■■□□□ 1.62
SETD4-211ENST00000443703 RGPD2P0DJD1 1756 aa25.17■■□□□ 1.62
SETD4-211ENST00000443703 INSRP06213 1382 aa25.17■■□□□ 1.62
SETD4-211ENST00000443703 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
SETD4-211ENST00000443703 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
SETD4-211ENST00000443703 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
SETD4-211ENST00000443703 KIF24Q5T7B8 1368 aa25.13■■□□□ 1.61
SETD4-211ENST00000443703 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.12■■□□□ 1.61
SETD4-211ENST00000443703 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SETD4-211ENST00000443703 SMIM5Q71RC9 77 aa25.12■■□□□ 1.61
SETD4-211ENST00000443703 PIGBQ92521 554 aa25.12■■□□□ 1.61
SETD4-211ENST00000443703 AK7Q96M32 723 aa25.12■■□□□ 1.61
SETD4-211ENST00000443703 C5P01031 1676 aa25.12■■□□□ 1.61
SETD4-211ENST00000443703 FLT4P35916 1363 aa25.1■■□□□ 1.61
SETD4-211ENST00000443703 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
SETD4-211ENST00000443703 SSFA2P28290 1259 aa25.09■■□□□ 1.61
SETD4-211ENST00000443703 KIF3CO14782 793 aa25.08■■□□□ 1.61
SETD4-211ENST00000443703 C4BP0C0L5 1744 aa25.07■■□□□ 1.6
SETD4-211ENST00000443703 PHF14O94880 888 aa25.07■■□□□ 1.6
SETD4-211ENST00000443703 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.06■■□□□ 1.6
SETD4-211ENST00000443703 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25.06■■□□□ 1.6
SETD4-211ENST00000443703 SIK1P57059 783 aa25.06■■□□□ 1.6
SETD4-211ENST00000443703 LINC00116Q8NCU8 138 aa25.06■■□□□ 1.6
SETD4-211ENST00000443703 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.05■■□□□ 1.6
SETD4-211ENST00000443703 NCAPD2Q15021 1401 aa25.05■■□□□ 1.6
SETD4-211ENST00000443703 WWC3Q9ULE0 1092 aa25.05■■□□□ 1.6
SETD4-211ENST00000443703 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.04■■□□□ 1.6
SETD4-211ENST00000443703 TMF1P82094 1093 aa25.04■■□□□ 1.6
SETD4-211ENST00000443703 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.03■■□□□ 1.6
SETD4-211ENST00000443703 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.03■■□□□ 1.6
SETD4-211ENST00000443703 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.03■■□□□ 1.6
SETD4-211ENST00000443703 ITPK1Q13572 414 aa25.02■■□□□ 1.6
SETD4-211ENST00000443703 SPG7Q9UQ90 795 aa25.02■■□□□ 1.6
SETD4-211ENST00000443703 CARD14Q9BXL6 1004 aa25.01■■□□□ 1.59
SETD4-211ENST00000443703 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.01■■□□□ 1.59
SETD4-211ENST00000443703 UBR3Q6ZT12 1888 aa24.98■■□□□ 1.59
SETD4-211ENST00000443703 GNPATO15228 680 aa24.98■■□□□ 1.59
SETD4-211ENST00000443703 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.98■■□□□ 1.59
SETD4-211ENST00000443703 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.97■■□□□ 1.59
SETD4-211ENST00000443703 MMP10P09238 476 aa24.97■■□□□ 1.59
SETD4-211ENST00000443703 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
SETD4-211ENST00000443703 ATP6V1AP38606 617 aa24.97■■□□□ 1.59
SETD4-211ENST00000443703 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
SETD4-211ENST00000443703 TGFB2P61812 414 aa24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms