RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442312.6

SH3BP2-203, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-203ENST00000442312 CBX1P83916 185 aa14.64□□□□□ -0.07
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SH3BP2-203ENST00000442312 TOP2BQ02880 1626 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-203ENST00000442312 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-203ENST00000442312 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
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SH3BP2-203ENST00000442312 PDRG1Q9NUG6 133 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-203ENST00000442312 DAPK1P53355 1430 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-203ENST00000442312 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-203ENST00000442312 CCDC171Q6TFL3 1326 aa14.64□□□□□ -0.07
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SH3BP2-203ENST00000442312 UVSSAQ2YD98 709 aa14.63□□□□□ -0.07
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SH3BP2-203ENST00000442312 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa14.63□□□□□ -0.07
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SH3BP2-203ENST00000442312 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.072e-6■□□□□ 10.9
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SH3BP2-203ENST00000442312 PTPN23Q9H3S7 1636 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-203ENST00000442312 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
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SH3BP2-203ENST00000442312 STX1AQ16623 288 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-203ENST00000442312 CCDC150Q8NCX0 1101 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-203ENST00000442312 ZMYND15Q9H091 742 aa14.61□□□□□ -0.07
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SH3BP2-203ENST00000442312 FANCD2Q9BXW9 1451 aa14.61□□□□□ -0.07
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SH3BP2-203ENST00000442312 ALS2CR12Q96Q35 445 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-203ENST00000442312 MTHFSP49914 203 aa14.61□□□□□ -0.07
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SH3BP2-203ENST00000442312 CCDC69A6NI79 296 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-203ENST00000442312 TNNT1P13805 278 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-203ENST00000442312 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-203ENST00000442312 CASTP20810 708 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
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SH3BP2-203ENST00000442312 TAOK3Q9H2K8 898 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-203ENST00000442312 TOP1P11387 765 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-203ENST00000442312 CCDC158Q5M9N0 1113 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-203ENST00000442312 NECTIN2Q92692 538 aa14.6□□□□□ -0.07
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SH3BP2-203ENST00000442312 ANKRD62A6NC57 917 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-203ENST00000442312 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
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SH3BP2-203ENST00000442312 NF2P35240 595 aa14.58□□□□□ -0.07
SH3BP2-203ENST00000442312 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
SH3BP2-203ENST00000442312 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
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SH3BP2-203ENST00000442312 PRDM10Q9NQV6 1147 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-203ENST00000442312 MNAT1P51948 309 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-203ENST00000442312 DDX12PQ92771 950 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-203ENST00000442312 TANGO6Q9C0B7 1094 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-203ENST00000442312 IFFO1Q0D2I5 559 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-203ENST00000442312 C9orf84Q5VXU9 1444 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-203ENST00000442312 DNAAF4Q8WXU2 420 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-203ENST00000442312 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-203ENST00000442312 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-203ENST00000442312 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-203ENST00000442312 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-203ENST00000442312 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
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SH3BP2-203ENST00000442312 FKBP15Q5T1M5 1219 aa14.57□□□□□ -0.08
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SH3BP2-203ENST00000442312 FAM135AQ9P2D6 1515 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-203ENST00000442312 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-203ENST00000442312 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
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SH3BP2-203ENST00000442312 PTPRGP23470 1445 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-203ENST00000442312 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-203ENST00000442312 WWC2Q6AWC2 1192 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-203ENST00000442312 FBXO3Q9UK99 471 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-203ENST00000442312 ARFGAP3Q9NP61 516 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-203ENST00000442312 RAB11FIP3O75154 756 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-203ENST00000442312 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-203ENST00000442312 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-203ENST00000442312 UBE2HP62256 183 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-203ENST00000442312 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-203ENST00000442312 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP2-203ENST00000442312 ITSN2Q9NZM3 1697 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP2-203ENST00000442312 HSPA4P34932 840 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP2-203ENST00000442312 PAFAH1B1P43034 410 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP2-203ENST00000442312 ALDH1L2Q3SY69 923 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP2-203ENST00000442312 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa14.55□□□□□ -0.08
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