RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

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Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 PSEN2P49810 448 aa6.93□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 FGD1P98174 961 aa6.93□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 PSME1Q06323 249 aa6.93□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 CHMP4AQ9BY43 222 aa6.93□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 RBCK1Q9BYM8 510 aa6.93□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM13AO94988 1023 aa6.92□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 P4HBP07237 508 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 MTMR3Q13615 1198 aa6.92□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 RNF20Q5VTR2 975 aa6.92□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 C9orf131Q5VYM1 1079 aa6.92□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 DPH6Q7L8W6 267 aa6.92□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa6.92□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 COL26A1Q96A83 441 aa6.92□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa6.92□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 M0R2N6 131 aa6.91□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 NPR3P17342 541 aa6.91□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 TMC7Q7Z402 723 aa6.91□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM87AQ8NBN3 555 aa6.91□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 HELQQ8TDG4 1101 aa6.91□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 THAP11Q96EK4 314 aa6.91□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 TANGO6Q9C0B7 1094 aa6.91□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 ANKRD62A6NC57 917 aa6.9□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 ARHGAP33O14559 1287 aa6.9□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 LGR5O75473 907 aa6.9□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa6.9□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 USP4Q13107 963 aa6.9□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 GIMAP6Q6P9H5 292 aa6.9□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 SCUBE3Q8IX30 993 aa6.9□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 NUDT12Q9BQG2 462 aa6.9□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 NBPF3Q9H094 633 aa6.9□□□□□ -1.3
CBX1P4-201ENST00000439415 TREHO43280 583 aa6.89□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 NDUFB5O43674 189 aa6.89□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 NR1I2O75469 434 aa6.89□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 MYT1Q01538 1121 aa6.89□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 LDLRAD1Q5T700 205 aa6.89□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 CAPN12Q6ZSI9 719 aa6.89□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa6.89□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 NT5DC4Q86YG4 428 aa6.89□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC43A3Q8NBI5 491 aa6.89□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 MRS2Q9HD23 443 aa6.89□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 DXOO77932 396 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 MSS51Q4VC12 460 aa6.88□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 LRCH3Q96II8 777 aa6.88□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 CITED4Q96RK1 184 aa6.88□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 TINF2Q9BSI4 451 aa6.88□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 TGIF2Q9GZN2 237 aa6.88□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa6.88□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 LDHBP07195 334 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 RNF34Q969K3 372 aa6.87□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 NLRP2Q9NX02 1062 aa6.87□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 PARP2Q9UGN5 583 aa6.87□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 BRPF3Q9ULD4 1205 aa6.87□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 FOXO3O43524 673 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 SORBS3O60504 671 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 ATP2B1P20020 1258 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 PLCB3Q01970 1234 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 TMC4Q7Z404 712 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 TMC1Q8TDI8 760 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 DMRTB1Q96MA1 342 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 LNPKQ9C0E8 428 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 CCSER2Q9H7U1 834 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa6.86□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 ERBB3P21860 1342 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 IGFBP4P22692 258 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 MAPK8P45983 427 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 MMP16P51512 607 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 DAB2P98082 770 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 DSC3Q14574 896 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 NBPF20Q3BBV1 942 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 ARMC5Q96C12 935 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 CARD14Q9BXL6 1004 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 CAPN10Q9HC96 672 aa6.85□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa6.84□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 MPSTP25325 297 aa6.84□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 FANCCQ00597 558 aa6.84□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 EHHADHQ08426 723 aa6.84□□□□□ -1.31
CBX1P4-201ENST00000439415 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
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