RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
PRAME-208ENST00000438888 SYT17Q9BSW7 474 aa17.22■□□□□ 0.35
PRAME-208ENST00000438888 KLHL34Q8N239 644 aa17.21■□□□□ 0.35
PRAME-208ENST00000438888 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
PRAME-208ENST00000438888 ARXQ96QS3 562 aa17.21■□□□□ 0.35
PRAME-208ENST00000438888 SGIP1Q9BQI5 828 aa17.21■□□□□ 0.35
PRAME-208ENST00000438888 RTL1A6NKG5 1358 aa17.2■□□□□ 0.34
PRAME-208ENST00000438888 SLC24A1O60721 1099 aa17.2■□□□□ 0.34
PRAME-208ENST00000438888 DOT1LQ8TEK3 1739 aa17.2■□□□□ 0.34
PRAME-208ENST00000438888 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
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PRAME-208ENST00000438888 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
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PRAME-208ENST00000438888 LY75O60449 1722 aa17.09■□□□□ 0.33
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PRAME-208ENST00000438888 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
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PRAME-208ENST00000438888 CYP27B1O15528 508 aa17.06■□□□□ 0.32
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PRAME-208ENST00000438888 COL24A1Q17RW2 1714 aa17.01■□□□□ 0.31
PRAME-208ENST00000438888 SMIM5Q71RC9 77 aa17■□□□□ 0.31
PRAME-208ENST00000438888 AK7Q96M32 723 aa17■□□□□ 0.31
PRAME-208ENST00000438888 EYA1Q99502 592 aa17■□□□□ 0.31
PRAME-208ENST00000438888 SPG7Q9UQ90 795 aa17■□□□□ 0.31
PRAME-208ENST00000438888 CHD4Q14839 1912 aa17■□□□□ 0.31
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PRAME-208ENST00000438888 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
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PRAME-208ENST00000438888 POLKQ9UBT6 870 aa16.98■□□□□ 0.31
PRAME-208ENST00000438888 C4BP0C0L5 1744 aa16.97■□□□□ 0.31
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PRAME-208ENST00000438888 TMOD3Q9NYL9 352 aa16.97■□□□□ 0.31
PRAME-208ENST00000438888 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa16.96■□□□□ 0.31
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PRAME-208ENST00000438888 ITGB4P16144 1822 aa16.96■□□□□ 0.3
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PRAME-208ENST00000438888 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
PRAME-208ENST00000438888 LINC00116Q8NCU8 138 aa16.95■□□□□ 0.3
PRAME-208ENST00000438888 WWC3Q9ULE0 1092 aa16.95■□□□□ 0.3
PRAME-208ENST00000438888 TAF1LQ8IZX4 1826 aa16.94■□□□□ 0.3
PRAME-208ENST00000438888 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
PRAME-208ENST00000438888 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa16.94■□□□□ 0.3
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PRAME-208ENST00000438888 SIK1P57059 783 aa16.94■□□□□ 0.3
PRAME-208ENST00000438888 C1QTNF8P60827 252 aa16.94■□□□□ 0.3
PRAME-208ENST00000438888 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
PRAME-208ENST00000438888 ASAP1Q9ULH1 1129 aa16.94■□□□□ 0.3
PRAME-208ENST00000438888 GRIN3BO60391 1043 aa16.93■□□□□ 0.3
PRAME-208ENST00000438888 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
PRAME-208ENST00000438888 IFNL2Q8IZJ0 200 aa16.93■□□□□ 0.3
PRAME-208ENST00000438888 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
PRAME-208ENST00000438888 GNPATO15228 680 aa16.92■□□□□ 0.3
PRAME-208ENST00000438888 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
PRAME-208ENST00000438888 ITPK1Q13572 414 aa16.92■□□□□ 0.3
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