RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429299.2

LTB-210, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 897 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-210ENST00000429299 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
LTB-210ENST00000429299 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
LTB-210ENST00000429299 IFFO2Q5TF58 517 aa27.49■■□□□ 1.99
LTB-210ENST00000429299 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.49■■□□□ 1.99
LTB-210ENST00000429299 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
LTB-210ENST00000429299 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
LTB-210ENST00000429299 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP27.46■■□□□ 1.99
LTB-210ENST00000429299 A0A1W2PP64 1363 aa27.46■■□□□ 1.99
LTB-210ENST00000429299 MSH5O43196 834 aa27.45■■□□□ 1.98
LTB-210ENST00000429299 NSD2O96028 1365 aa27.45■■□□□ 1.98
LTB-210ENST00000429299 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
LTB-210ENST00000429299 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
LTB-210ENST00000429299 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
LTB-210ENST00000429299 HOXC9P31274 260 aa27.43■■□□□ 1.98
LTB-210ENST00000429299 AMPHP49418 695 aa27.43■■□□□ 1.98
LTB-210ENST00000429299 COG3Q96JB2 828 aa27.43■■□□□ 1.98
LTB-210ENST00000429299 MAP3K19Q56UN5 1328 aa27.42■■□□□ 1.98
LTB-210ENST00000429299 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.42■■□□□ 1.98
LTB-210ENST00000429299 LY75O60449 1722 aa27.41■■□□□ 1.98
LTB-210ENST00000429299 SHANK3Q9BYB0 1731 aa27.41■■□□□ 1.98
LTB-210ENST00000429299 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa27.41■■□□□ 1.98
LTB-210ENST00000429299 USP47Q96K76 1375 aa27.41■■□□□ 1.98
LTB-210ENST00000429299 CD2APQ9Y5K6 639 aa27.39■■□□□ 1.98
LTB-210ENST00000429299 CGNL1Q0VF96 1302 aa27.39■■□□□ 1.97
LTB-210ENST00000429299 FLAD1Q8NFF5 587 aa27.37■■□□□ 1.97
LTB-210ENST00000429299 DOT1LQ8TEK3 1739 aa27.37■■□□□ 1.97
LTB-210ENST00000429299 FBLN1P23142 703 aa27.35■■□□□ 1.97
LTB-210ENST00000429299 MSL1Q68DK7 614 aa27.35■■□□□ 1.97
LTB-210ENST00000429299 NBPF6Q5VWK0 638 aa27.34■■□□□ 1.97
LTB-210ENST00000429299 NBPF4Q96M43 638 aa27.34■■□□□ 1.97
LTB-210ENST00000429299 MEGF6O75095 1541 aa27.34■■□□□ 1.97
LTB-210ENST00000429299 ATP10DQ9P241 1426 aa27.33■■□□□ 1.96
LTB-210ENST00000429299 SLC24A1O60721 1099 aa27.32■■□□□ 1.96
LTB-210ENST00000429299 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa27.32■■□□□ 1.96
LTB-210ENST00000429299 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
LTB-210ENST00000429299 RTL1A6NKG5 1358 aa27.3■■□□□ 1.96
LTB-210ENST00000429299 TATP17735 454 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
LTB-210ENST00000429299 RGPD2P0DJD1 1756 aa27.27■■□□□ 1.96
LTB-210ENST00000429299 TESK2Q96S53 571 aa27.27■■□□□ 1.96
LTB-210ENST00000429299 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
LTB-210ENST00000429299 USHBP1Q8N6Y0 703 aa27.26■■□□□ 1.95
LTB-210ENST00000429299 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa27.25■■□□□ 1.95
LTB-210ENST00000429299 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa27.25■■□□□ 1.95
LTB-210ENST00000429299 HSPA6P17066 643 aa27.25■■□□□ 1.95
LTB-210ENST00000429299 PALLDQ8WX93 1383 aa27.24■■□□□ 1.95
LTB-210ENST00000429299 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa27.24■■□□□ 1.95
LTB-210ENST00000429299 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
LTB-210ENST00000429299 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa27.23■■□□□ 1.95
LTB-210ENST00000429299 FYB1O15117 783 aa27.23■■□□□ 1.95
LTB-210ENST00000429299 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
LTB-210ENST00000429299 ADCY9O60503 1353 aa27.22■■□□□ 1.95
LTB-210ENST00000429299 C5P01031 1676 aa27.21■■□□□ 1.95
LTB-210ENST00000429299 AK7Q96M32 723 aa27.21■■□□□ 1.95
LTB-210ENST00000429299 GGNBP2Q9H3C7 697 aa27.2■■□□□ 1.94
LTB-210ENST00000429299 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa27.19■■□□□ 1.94
LTB-210ENST00000429299 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
LTB-210ENST00000429299 INSRP06213 1382 aa27.19■■□□□ 1.94
LTB-210ENST00000429299 CYP27B1O15528 508 aa27.18■■□□□ 1.94
LTB-210ENST00000429299 TONSLQ96HA7 1378 aa27.18■■□□□ 1.94
LTB-210ENST00000429299 TAF1LQ8IZX4 1826 aa27.17■■□□□ 1.94
LTB-210ENST00000429299 IGSF1Q8N6C5 1336 aa27.16■■□□□ 1.94
LTB-210ENST00000429299 NSD3Q9BZ95 1437 aa27.16■■□□□ 1.94
LTB-210ENST00000429299 KIF24Q5T7B8 1368 aa27.15■■□□□ 1.94
LTB-210ENST00000429299 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
LTB-210ENST00000429299 AMIGO3Q86WK7 504 aa27.15■■□□□ 1.94
LTB-210ENST00000429299 PIGBQ92521 554 aa27.14■■□□□ 1.94
LTB-210ENST00000429299 PHF14O94880 888 aa27.13■■□□□ 1.93
LTB-210ENST00000429299 SSFA2P28290 1259 aa27.13■■□□□ 1.93
LTB-210ENST00000429299 C4BP0C0L5 1744 aa27.13■■□□□ 1.93
LTB-210ENST00000429299 FLT4P35916 1363 aa27.12■■□□□ 1.93
LTB-210ENST00000429299 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
LTB-210ENST00000429299 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa27.09■■□□□ 1.93
LTB-210ENST00000429299 KIF3CO14782 793 aa27.09■■□□□ 1.93
LTB-210ENST00000429299 SIK1P57059 783 aa27.09■■□□□ 1.93
LTB-210ENST00000429299 SMIM5Q71RC9 77 aa27.09■■□□□ 1.93
LTB-210ENST00000429299 WWC3Q9ULE0 1092 aa27.09■■□□□ 1.93
LTB-210ENST00000429299 TMF1P82094 1093 aa27.08■■□□□ 1.93
LTB-210ENST00000429299 UBR3Q6ZT12 1888 aa27.07■■□□□ 1.92
LTB-210ENST00000429299 SPG7Q9UQ90 795 aa27.07■■□□□ 1.92
LTB-210ENST00000429299 ITGB4P16144 1822 aa27.06■■□□□ 1.92
LTB-210ENST00000429299 LINC00116Q8NCU8 138 aa27.06■■□□□ 1.92
LTB-210ENST00000429299 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP27.04■■□□□ 1.92
LTB-210ENST00000429299 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa27.04■■□□□ 1.92
LTB-210ENST00000429299 TMOD3Q9NYL9 352 aa27.03■■□□□ 1.92
LTB-210ENST00000429299 GNPATO15228 680 aa27.02■■□□□ 1.92
LTB-210ENST00000429299 APLP1P51693 650 aa27.02■■□□□ 1.92
LTB-210ENST00000429299 CDCA8Q53HL2 280 aa27.02■■□□□ 1.92
LTB-210ENST00000429299 ATP6V1AP38606 617 aa27.01■■□□□ 1.91
LTB-210ENST00000429299 ASAP1Q9ULH1 1129 aa27.01■■□□□ 1.91
LTB-210ENST00000429299 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa27.01■■□□□ 1.91
LTB-210ENST00000429299 MMP10P09238 476 aa27■■□□□ 1.91
LTB-210ENST00000429299 TGFB2P61812 414 aa27■■□□□ 1.91
LTB-210ENST00000429299 ITPK1Q13572 414 aa27■■□□□ 1.91
LTB-210ENST00000429299 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
LTB-210ENST00000429299 NCAPD2Q15021 1401 aa26.99■■□□□ 1.91
LTB-210ENST00000429299 PKD1L3Q7Z443 1732 aa26.99■■□□□ 1.91
LTB-210ENST00000429299 TOMM70O94826 608 aa26.99■■□□□ 1.91
LTB-210ENST00000429299 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
LTB-210ENST00000429299 IFNL2Q8IZJ0 200 aa26.97■■□□□ 1.91
LTB-210ENST00000429299 NLGN1Q8N2Q7 840 aa26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms