RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429299.2

LTB-210, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 897 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-210ENST00000429299 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
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LTB-210ENST00000429299 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.49■■□□□ 1.99
LTB-210ENST00000429299 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
LTB-210ENST00000429299 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
LTB-210ENST00000429299 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP27.46■■□□□ 1.99
LTB-210ENST00000429299 A0A1W2PP64 1363 aa27.46■■□□□ 1.99
LTB-210ENST00000429299 MSH5O43196 834 aa27.45■■□□□ 1.98
LTB-210ENST00000429299 NSD2O96028 1365 aa27.45■■□□□ 1.98
LTB-210ENST00000429299 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
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LTB-210ENST00000429299 AMPHP49418 695 aa27.43■■□□□ 1.98
LTB-210ENST00000429299 COG3Q96JB2 828 aa27.43■■□□□ 1.98
LTB-210ENST00000429299 MAP3K19Q56UN5 1328 aa27.42■■□□□ 1.98
LTB-210ENST00000429299 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.42■■□□□ 1.98
LTB-210ENST00000429299 LY75O60449 1722 aa27.41■■□□□ 1.98
LTB-210ENST00000429299 SHANK3Q9BYB0 1731 aa27.41■■□□□ 1.98
LTB-210ENST00000429299 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa27.41■■□□□ 1.98
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LTB-210ENST00000429299 DOT1LQ8TEK3 1739 aa27.37■■□□□ 1.97
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LTB-210ENST00000429299 MSL1Q68DK7 614 aa27.35■■□□□ 1.97
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LTB-210ENST00000429299 NBPF4Q96M43 638 aa27.34■■□□□ 1.97
LTB-210ENST00000429299 MEGF6O75095 1541 aa27.34■■□□□ 1.97
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LTB-210ENST00000429299 SLC24A1O60721 1099 aa27.32■■□□□ 1.96
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LTB-210ENST00000429299 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
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LTB-210ENST00000429299 TATP17735 454 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
LTB-210ENST00000429299 RGPD2P0DJD1 1756 aa27.27■■□□□ 1.96
LTB-210ENST00000429299 TESK2Q96S53 571 aa27.27■■□□□ 1.96
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LTB-210ENST00000429299 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa27.24■■□□□ 1.95
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LTB-210ENST00000429299 ITGB4P16144 1822 aa27.06■■□□□ 1.92
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LTB-210ENST00000429299 ITPK1Q13572 414 aa27■■□□□ 1.91
LTB-210ENST00000429299 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
LTB-210ENST00000429299 NCAPD2Q15021 1401 aa26.99■■□□□ 1.91
LTB-210ENST00000429299 PKD1L3Q7Z443 1732 aa26.99■■□□□ 1.91
LTB-210ENST00000429299 TOMM70O94826 608 aa26.99■■□□□ 1.91
LTB-210ENST00000429299 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
LTB-210ENST00000429299 IFNL2Q8IZJ0 200 aa26.97■■□□□ 1.91
LTB-210ENST00000429299 NLGN1Q8N2Q7 840 aa26.97■■□□□ 1.91
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