RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429295.1

MRPL23-206, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L23, humanhuman

TSL 5

Gene MRPL23, Length 805 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23-206ENST00000429295 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa30.24■■■□□ 2.43
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MRPL23-206ENST00000429295 PAPPAQ13219 1627 aa30.23■■■□□ 2.43
MRPL23-206ENST00000429295 INSRP06213 1382 aa30.23■■■□□ 2.43
MRPL23-206ENST00000429295 NBPF6Q5VWK0 638 aa30.22■■■□□ 2.43
MRPL23-206ENST00000429295 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
MRPL23-206ENST00000429295 NBPF4Q96M43 638 aa30.22■■■□□ 2.43
MRPL23-206ENST00000429295 PTGER2P43116 358 aa30.21■■■□□ 2.43
MRPL23-206ENST00000429295 PANK3Q9H999 370 aa30.21■■■□□ 2.43
MRPL23-206ENST00000429295 DOT1LQ8TEK3 1739 aa30.2■■■□□ 2.43
MRPL23-206ENST00000429295 MTFR1LQ9H019 292 aa30.2■■■□□ 2.43
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MRPL23-206ENST00000429295 SHANK3Q9BYB0 1731 aa30.15■■■□□ 2.42
MRPL23-206ENST00000429295 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
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MRPL23-206ENST00000429295 POLKQ9UBT6 870 aa30.11■■■□□ 2.41
MRPL23-206ENST00000429295 WASHC2AQ641Q2 1341 aa30.11■■■□□ 2.41
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MRPL23-206ENST00000429295 CHD4Q14839 1912 aa30.08■■■□□ 2.41
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MRPL23-206ENST00000429295 POLD1P28340 1107 aa29.99■■■□□ 2.39
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MRPL23-206ENST00000429295 ITGB4P16144 1822 aa29.9■■■□□ 2.38
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MRPL23-206ENST00000429295 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP29.9■■■□□ 2.38
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MRPL23-206ENST00000429295 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
MRPL23-206ENST00000429295 PKD1L3Q7Z443 1732 aa29.87■■■□□ 2.37
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MRPL23-206ENST00000429295 IGSF1Q8N6C5 1336 aa29.86■■■□□ 2.37
MRPL23-206ENST00000429295 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa29.85■■■□□ 2.37
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MRPL23-206ENST00000429295 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
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MRPL23-206ENST00000429295 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
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MRPL23-206ENST00000429295 FLAD1Q8NFF5 587 aa29.74■■■□□ 2.35
MRPL23-206ENST00000429295 TMOD3Q9NYL9 352 aa29.74■■■□□ 2.35
MRPL23-206ENST00000429295 SULT6B1Q6IMI4 303 aa29.73■■■□□ 2.35
MRPL23-206ENST00000429295 AEBP1Q8IUX7 1158 aa29.73■■■□□ 2.35
MRPL23-206ENST00000429295 UBR3Q6ZT12 1888 aa29.72■■■□□ 2.35
MRPL23-206ENST00000429295 AK7Q96M32 723 aa29.72■■■□□ 2.35
MRPL23-206ENST00000429295 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa29.72■■■□□ 2.35
MRPL23-206ENST00000429295 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
MRPL23-206ENST00000429295 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.35
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