RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428678.1

UPK3BP1-201, Transcript of uroplakin 3B pseudogene 1, humanhuman

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Gene UPK3BP1, Length 509 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BP1-201ENST00000428678 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa25.83■■□□□ 1.73
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UPK3BP1-201ENST00000428678 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa25.82■■□□□ 1.72
UPK3BP1-201ENST00000428678 RGPD2P0DJD1 1756 aa25.82■■□□□ 1.72
UPK3BP1-201ENST00000428678 FBLN1P23142 703 aa25.81■■□□□ 1.72
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
UPK3BP1-201ENST00000428678 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
UPK3BP1-201ENST00000428678 TESK2Q96S53 571 aa25.79■■□□□ 1.72
UPK3BP1-201ENST00000428678 LY75O60449 1722 aa25.78■■□□□ 1.72
UPK3BP1-201ENST00000428678 SHANK3Q9BYB0 1731 aa25.78■■□□□ 1.72
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UPK3BP1-201ENST00000428678 NSD2O96028 1365 aa25.78■■□□□ 1.72
UPK3BP1-201ENST00000428678 MEGF6O75095 1541 aa25.78■■□□□ 1.72
UPK3BP1-201ENST00000428678 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.77■■□□□ 1.72
UPK3BP1-201ENST00000428678 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.75■■□□□ 1.71
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UPK3BP1-201ENST00000428678 RTL1A6NKG5 1358 aa25.74■■□□□ 1.71
UPK3BP1-201ENST00000428678 MSH5O43196 834 aa25.74■■□□□ 1.71
UPK3BP1-201ENST00000428678 C1QTNF8P60827 252 aa25.74■■□□□ 1.71
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UPK3BP1-201ENST00000428678 SLC24A1O60721 1099 aa25.72■■□□□ 1.71
UPK3BP1-201ENST00000428678 USHBP1Q8N6Y0 703 aa25.72■■□□□ 1.71
UPK3BP1-201ENST00000428678 NLGN2Q8NFZ4 835 aa25.72■■□□□ 1.71
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UPK3BP1-201ENST00000428678 NBPF4Q96M43 638 aa25.71■■□□□ 1.71
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UPK3BP1-201ENST00000428678 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
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UPK3BP1-201ENST00000428678 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.63■■□□□ 1.69
UPK3BP1-201ENST00000428678 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.63■■□□□ 1.69
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UPK3BP1-201ENST00000428678 KIF20BQ96Q89 1820 aa25.61■■□□□ 1.69
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UPK3BP1-201ENST00000428678 FLT4P35916 1363 aa25.59■■□□□ 1.69
UPK3BP1-201ENST00000428678 PALLDQ8WX93 1383 aa25.59■■□□□ 1.69
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UPK3BP1-201ENST00000428678 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.58■■□□□ 1.68
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UPK3BP1-201ENST00000428678 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
UPK3BP1-201ENST00000428678 CYP27B1O15528 508 aa25.55■■□□□ 1.68
UPK3BP1-201ENST00000428678 KIF24Q5T7B8 1368 aa25.55■■□□□ 1.68
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UPK3BP1-201ENST00000428678 CDCA8Q53HL2 280 aa25.53■■□□□ 1.68
UPK3BP1-201ENST00000428678 AK7Q96M32 723 aa25.53■■□□□ 1.68
UPK3BP1-201ENST00000428678 CD2APQ9Y5K6 639 aa25.53■■□□□ 1.68
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UPK3BP1-201ENST00000428678 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
UPK3BP1-201ENST00000428678 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.51■■□□□ 1.67
UPK3BP1-201ENST00000428678 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.51■■□□□ 1.67
UPK3BP1-201ENST00000428678 ATP10DQ9P241 1426 aa25.49■■□□□ 1.67
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UPK3BP1-201ENST00000428678 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.48■■□□□ 1.67
UPK3BP1-201ENST00000428678 PIGBQ92521 554 aa25.48■■□□□ 1.67
UPK3BP1-201ENST00000428678 CARD14Q9BXL6 1004 aa25.48■■□□□ 1.67
UPK3BP1-201ENST00000428678 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.47■■□□□ 1.67
UPK3BP1-201ENST00000428678 UBR3Q6ZT12 1888 aa25.47■■□□□ 1.67
UPK3BP1-201ENST00000428678 SMIM5Q71RC9 77 aa25.46■■□□□ 1.67
UPK3BP1-201ENST00000428678 SPG7Q9UQ90 795 aa25.46■■□□□ 1.67
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UPK3BP1-201ENST00000428678 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25.42■■□□□ 1.66
UPK3BP1-201ENST00000428678 SIK1P57059 783 aa25.42■■□□□ 1.66
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UPK3BP1-201ENST00000428678 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
UPK3BP1-201ENST00000428678 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.41■■□□□ 1.66
UPK3BP1-201ENST00000428678 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa25.41■■□□□ 1.66
UPK3BP1-201ENST00000428678 LINC00116Q8NCU8 138 aa25.41■■□□□ 1.66
UPK3BP1-201ENST00000428678 TMOD3Q9NYL9 352 aa25.41■■□□□ 1.66
UPK3BP1-201ENST00000428678 SSFA2P28290 1259 aa25.4■■□□□ 1.66
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
UPK3BP1-201ENST00000428678 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.39■■□□□ 1.66
UPK3BP1-201ENST00000428678 EYA1Q99502 592 aa25.39■■□□□ 1.66
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UPK3BP1-201ENST00000428678 ADCY9O60503 1353 aa25.38■■□□□ 1.65
UPK3BP1-201ENST00000428678 GNPATO15228 680 aa25.37■■□□□ 1.65
UPK3BP1-201ENST00000428678 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.37■■□□□ 1.65
UPK3BP1-201ENST00000428678 PHKG2P15735 406 aa25.35■■□□□ 1.65
UPK3BP1-201ENST00000428678 ATP6V1AP38606 617 aa25.35■■□□□ 1.65
UPK3BP1-201ENST00000428678 ITPK1Q13572 414 aa25.35■■□□□ 1.65
UPK3BP1-201ENST00000428678 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.35■■□□□ 1.65
UPK3BP1-201ENST00000428678 POLKQ9UBT6 870 aa25.33■■□□□ 1.65
UPK3BP1-201ENST00000428678 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
UPK3BP1-201ENST00000428678 ATG3Q9NT62 314 aa25.31■■□□□ 1.64
UPK3BP1-201ENST00000428678 MMP10P09238 476 aa25.3■■□□□ 1.64
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