RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377078.2

USP11-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

TSL 5

Gene USP11, Length 1,077 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-202ENST00000377078 NSD2O96028 1365 aa23.54■■□□□ 1.36
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USP11-202ENST00000377078 STK32BQ9NY57 414 aa23.53■■□□□ 1.36
USP11-202ENST00000377078 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.53■■□□□ 1.36
USP11-202ENST00000377078 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
USP11-202ENST00000377078 PROM2Q8N271 834 aa23.52■■□□□ 1.36
USP11-202ENST00000377078 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
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USP11-202ENST00000377078 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.5■■□□□ 1.35
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USP11-202ENST00000377078 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
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USP11-202ENST00000377078 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.43■■□□□ 1.34
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USP11-202ENST00000377078 IL13P35225 146 aa23.22■■□□□ 1.31
USP11-202ENST00000377078 C1orf141Q5JVX7 400 aa23.22■■□□□ 1.31
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USP11-202ENST00000377078 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa23.17■■□□□ 1.3
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USP11-202ENST00000377078 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
USP11-202ENST00000377078 ATG3Q9NT62 314 aa23.12■■□□□ 1.29
USP11-202ENST00000377078 TAF1LQ8IZX4 1826 aa23.12■■□□□ 1.29
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USP11-202ENST00000377078 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
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