RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376504.3

PTF1A-201, Transcript of pancreas associated transcription factor 1a, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTF1A, Length 1,537 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1A-201ENST00000376504 TATP17735 454 aaPredicted RBP42.02■■■■■ 4.32
PTF1A-201ENST00000376504 VPS72Q15906 364 aa42.02■■■■■ 4.32
PTF1A-201ENST00000376504 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP42.01■■■■■ 4.32
PTF1A-201ENST00000376504 NGEFQ8N5V2 710 aa42.01■■■■■ 4.32
PTF1A-201ENST00000376504 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa42.01■■■■■ 4.32
PTF1A-201ENST00000376504 DISP2A7MBM2 1401 aa42■■■■■ 4.31
PTF1A-201ENST00000376504 RIPK4P57078 832 aa41.99■■■■■ 4.31
PTF1A-201ENST00000376504 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP41.99■■■■■ 4.31
PTF1A-201ENST00000376504 IL2RBP14784 551 aa41.98■■■■■ 4.31
PTF1A-201ENST00000376504 GAS2L2Q8NHY3 880 aa41.98■■■■■ 4.31
PTF1A-201ENST00000376504 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP41.97■■■■■ 4.31
PTF1A-201ENST00000376504 CCDC27Q2M243 656 aa41.96■■■■■ 4.31
PTF1A-201ENST00000376504 AMOTQ4VCS5 1084 aa41.96■■■■■ 4.31
PTF1A-201ENST00000376504 TRIM35Q9UPQ4 493 aa41.96■■■■■ 4.31
PTF1A-201ENST00000376504 ZNF521Q96K83 1311 aa41.96■■■■■ 4.31
PTF1A-201ENST00000376504 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
PTF1A-201ENST00000376504 SHANK3Q9BYB0 1731 aa41.95■■■■■ 4.31
PTF1A-201ENST00000376504 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP41.94■■■■■ 4.3
PTF1A-201ENST00000376504 ATRNO75882 1429 aa41.94■■■■■ 4.3
PTF1A-201ENST00000376504 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP41.93■■■■■ 4.3
PTF1A-201ENST00000376504 WWC1Q8IX03 1113 aa41.92■■■■■ 4.3
PTF1A-201ENST00000376504 GLI3P10071 1580 aa41.89■■■■■ 4.3
PTF1A-201ENST00000376504 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP41.89■■■■■ 4.3
PTF1A-201ENST00000376504 BARGINQ6ZT62 677 aa41.88■■■■■ 4.29
PTF1A-201ENST00000376504 SPG7Q9UQ90 795 aa41.88■■■■■ 4.29
PTF1A-201ENST00000376504 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP41.87■■■■■ 4.29
PTF1A-201ENST00000376504 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP41.86■■■■■ 4.29
PTF1A-201ENST00000376504 MAP3K5Q99683 1374 aa41.86■■■■■ 4.29
PTF1A-201ENST00000376504 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP41.85■■■■■ 4.29
PTF1A-201ENST00000376504 LMOD3Q0VAK6 560 aa41.84■■■■■ 4.29
PTF1A-201ENST00000376504 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP41.83■■■■■ 4.29
PTF1A-201ENST00000376504 GNAT3A8MTJ3 354 aa41.82■■■■■ 4.29
PTF1A-201ENST00000376504 AKAP4Q5JQC9 854 aa41.82■■■■■ 4.29
PTF1A-201ENST00000376504 LRRC37A3O60309 1634 aa41.81■■■■■ 4.28
PTF1A-201ENST00000376504 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP41.81■■■■■ 4.28
PTF1A-201ENST00000376504 CYP27B1O15528 508 aa41.79■■■■■ 4.28
PTF1A-201ENST00000376504 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP41.79■■■■■ 4.28
PTF1A-201ENST00000376504 DCTN1Q14203 1278 aa41.79■■■■■ 4.28
PTF1A-201ENST00000376504 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP41.79■■■■■ 4.28
PTF1A-201ENST00000376504 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP41.79■■■■■ 4.28
PTF1A-201ENST00000376504 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa41.79■■■■■ 4.28
PTF1A-201ENST00000376504 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa41.78■■■■■ 4.28
PTF1A-201ENST00000376504 PHKG2P15735 406 aa41.78■■■■■ 4.28
PTF1A-201ENST00000376504 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP41.78■■■■■ 4.28
PTF1A-201ENST00000376504 C1orf141Q5JVX7 400 aa41.78■■■■■ 4.28
PTF1A-201ENST00000376504 WDR63Q8IWG1 891 aa41.78■■■■■ 4.28
PTF1A-201ENST00000376504 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP41.78■■■■■ 4.28
PTF1A-201ENST00000376504 TNS2Q63HR2 1409 aa41.77■■■■■ 4.28
PTF1A-201ENST00000376504 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa41.77■■■■■ 4.28
PTF1A-201ENST00000376504 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa41.77■■■■■ 4.28
PTF1A-201ENST00000376504 MCM10Q7L590 875 aa41.76■■■■■ 4.28
PTF1A-201ENST00000376504 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP41.75■■■■■ 4.27
PTF1A-201ENST00000376504 IFNL2Q8IZJ0 200 aa41.75■■■■■ 4.27
PTF1A-201ENST00000376504 SCN11AQ9UI33 1791 aa41.75■■■■■ 4.27
PTF1A-201ENST00000376504 GOLGA2Q08379 1002 aa41.74■■■■■ 4.27
PTF1A-201ENST00000376504 PDE3BQ13370 1112 aa41.74■■■■■ 4.27
PTF1A-201ENST00000376504 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP41.74■■■■■ 4.27
PTF1A-201ENST00000376504 CDCA7LQ96GN5 454 aa41.74■■■■■ 4.27
PTF1A-201ENST00000376504 IL17REQ8NFR9 667 aa41.73■■■■■ 4.27
PTF1A-201ENST00000376504 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP41.73■■■■■ 4.27
PTF1A-201ENST00000376504 EXOC5O00471 708 aa41.71■■■■■ 4.27
PTF1A-201ENST00000376504 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa41.7■■■■■ 4.27
PTF1A-201ENST00000376504 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP41.7■■■■■ 4.27
PTF1A-201ENST00000376504 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa41.69■■■■■ 4.27
PTF1A-201ENST00000376504 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP41.69■■■■■ 4.26
PTF1A-201ENST00000376504 LGR6Q9HBX8 967 aa41.69■■■■■ 4.26
PTF1A-201ENST00000376504 IL16Q14005 1332 aa41.68■■■■■ 4.26
PTF1A-201ENST00000376504 DDB1Q16531 1140 aa41.68■■■■■ 4.26
PTF1A-201ENST00000376504 RNMTO43148 476 aaKnown RBP41.67■■■■■ 4.26
PTF1A-201ENST00000376504 SLFN5Q08AF3 891 aa41.67■■■■■ 4.26
PTF1A-201ENST00000376504 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP41.66■■■■■ 4.26
PTF1A-201ENST00000376504 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP41.65■■■■■ 4.26
PTF1A-201ENST00000376504 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
PTF1A-201ENST00000376504 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP41.64■■■■■ 4.26
PTF1A-201ENST00000376504 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP41.64■■■■■ 4.26
PTF1A-201ENST00000376504 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
PTF1A-201ENST00000376504 E9PSI1 815 aa41.63■■■■■ 4.25
PTF1A-201ENST00000376504 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.25
PTF1A-201ENST00000376504 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa41.61■■■■■ 4.25
PTF1A-201ENST00000376504 DCAF5Q96JK2 942 aa41.61■■■■■ 4.25
PTF1A-201ENST00000376504 ZNF853P0CG23 659 aa41.59■■■■■ 4.25
PTF1A-201ENST00000376504 DUSP27Q5VZP5 1158 aa41.59■■■■■ 4.25
PTF1A-201ENST00000376504 IFT57Q9NWB7 429 aa41.59■■■■■ 4.25
PTF1A-201ENST00000376504 MRC1P22897 1456 aa41.58■■■■■ 4.25
PTF1A-201ENST00000376504 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.25
PTF1A-201ENST00000376504 A0A0G2JS52 829 aa41.56■■■■■ 4.24
PTF1A-201ENST00000376504 MYT1Q01538 1121 aa41.56■■■■■ 4.24
PTF1A-201ENST00000376504 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP41.56■■■■■ 4.24
PTF1A-201ENST00000376504 CFAP44Q96MT7 982 aa41.56■■■■■ 4.24
PTF1A-201ENST00000376504 GNAI1P63096 354 aa41.55■■■■■ 4.24
PTF1A-201ENST00000376504 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP41.54■■■■■ 4.24
PTF1A-201ENST00000376504 SEPT12Q8IYM1 358 aa41.54■■■■■ 4.24
PTF1A-201ENST00000376504 MYH16Q9H6N6 1097 aa41.53■■■■■ 4.24
PTF1A-201ENST00000376504 BRWD3Q6RI45 1802 aa41.52■■■■■ 4.24
PTF1A-201ENST00000376504 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
PTF1A-201ENST00000376504 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP41.52■■■■■ 4.24
PTF1A-201ENST00000376504 FANCIQ9NVI1 1328 aa41.51■■■■■ 4.24
PTF1A-201ENST00000376504 CHL1O00533 1208 aa41.51■■■■■ 4.24
PTF1A-201ENST00000376504 TEFQ10587 303 aa41.51■■■■■ 4.24
PTF1A-201ENST00000376504 ITGB4P16144 1822 aa41.51■■■■■ 4.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms