RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367379.5

PTPRC-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-204ENST00000367379 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
PTPRC-204ENST00000367379 MTMR14Q8NCE2 650 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRC-204ENST00000367379 KCNMA1Q12791 1236 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRC-204ENST00000367379 RNF20Q5VTR2 975 aa11.34□□□□□ -0.59
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
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PTPRC-204ENST00000367379 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa11.33□□□□□ -0.6
PTPRC-204ENST00000367379 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
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PTPRC-204ENST00000367379 A0A1W2PRU2 124 aa11.31□□□□□ -0.6
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PTPRC-204ENST00000367379 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
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PTPRC-204ENST00000367379 GMCL1Q96IK5 515 aa11.27□□□□□ -0.61
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PTPRC-204ENST00000367379 RAB6BQ9NRW1 208 aa11.17□□□□□ -0.62
PTPRC-204ENST00000367379 GPR25O00155 361 aa11.16□□□□□ -0.62
PTPRC-204ENST00000367379 TPRNQ4KMQ1 711 aa11.16□□□□□ -0.62
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PTPRC-204ENST00000367379 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PTPRC-204ENST00000367379 ENAMQ9NRM1 1142 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRC-204ENST00000367379 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
PTPRC-204ENST00000367379 BCRP11274 1271 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRC-204ENST00000367379 ACDQ96AP0 544 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRC-204ENST00000367379 DOLKQ9UPQ8 538 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRC-204ENST00000367379 USP4Q13107 963 aa11.07□□□□□ -0.64
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