RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 CPDO75976 1380 aa7.88□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 LMO7Q8WWI1 1683 aa7.88□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 E9PSI1 815 aa7.88□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 DUSP27Q5VZP5 1158 aa7.88□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 AXIN2Q9Y2T1 843 aa7.88□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 TOM1O60784 492 aa7.87□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 ANKRD24Q8TF21 1146 aa7.87□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 KIAA0232Q92628 1395 aa7.87□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 NCAPD2Q15021 1401 aa7.87□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 NBPF6Q5VWK0 638 aa7.87□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 USHBP1Q8N6Y0 703 aa7.87□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 NBPF4Q96M43 638 aa7.87□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 CHRNA2Q15822 529 aa7.86□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 ERBB3P21860 1342 aa7.86□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 IL16Q14005 1332 aa7.86□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 PIP4K2BP78356 416 aa7.85□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 LMOD3Q0VAK6 560 aa7.85□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 RCAN3Q9UKA8 241 aa7.85□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 UBAP1LF5GYI3 381 aa7.85□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 MYH16Q9H6N6 1097 aa7.84□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 RNF123Q5XPI4 1314 aa7.84□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 GAS2L2Q8NHY3 880 aa7.84□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 CERKQ8TCT0 537 aa7.84□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 PRDM11Q9NQV5 511 aa7.84□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 LRRC37A3O60309 1634 aa7.84□□□□□ -1.15
CCR6-201ENST00000341935 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 FAM83GA6ND36 823 aa7.83□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 FKBP8Q14318 412 aa7.83□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 FANCIQ9NVI1 1328 aa7.82□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa7.82□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 NLRP2Q9NX02 1062 aa7.82□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 PLCH1Q4KWH8 1693 aa7.82□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 DCTN1Q14203 1278 aa7.82□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 TMEM132AQ24JP5 1023 aa7.82□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 IFT57Q9NWB7 429 aa7.82□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 MAP3K5Q99683 1374 aa7.82□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 PKD1L3Q7Z443 1732 aa7.81□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 GNAT3A8MTJ3 354 aa7.81□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 RRP1P56182 461 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 GNAI1P63096 354 aa7.81□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 MCM10Q7L590 875 aa7.81□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 WDR17Q8IZU2 1322 aa7.81□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 ZNF853P0CG23 659 aa7.81□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 CRB1P82279 1406 aa7.81□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa7.81□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 AMOTQ4VCS5 1084 aa7.81□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 MEGF6O75095 1541 aa7.8□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa7.8□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa7.8□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 NRAPQ86VF7 1730 aa7.79□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa7.79□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 PRDM10Q9NQV6 1147 aa7.79□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 MBIPQ9NS73 344 aa7.79□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa7.79□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 TATP17735 454 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 EVA1CP58658 441 aa7.79□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 AKAP4Q5JQC9 854 aa7.79□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa7.79□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 WNK3Q9BYP7 1800 aa7.78□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 STRN4Q9NRL3 753 aa7.78□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 BTG4Q9NY30 223 aa7.78□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 NWD2Q9ULI1 1742 aa7.78□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 CARD10Q9BWT7 1032 aa7.78□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa7.78□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 CHL1O00533 1208 aa7.78□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 BCAR3O75815 825 aa7.78□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 RARSP54136 660 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 C1orf141Q5JVX7 400 aa7.78□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 IL17REQ8NFR9 667 aa7.78□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 SHANK3Q9BYB0 1731 aa7.78□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa7.78□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 JCADQ9P266 1359 aa7.78□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 SCN11AQ9UI33 1791 aa7.78□□□□□ -1.16
CCR6-201ENST00000341935 PLIN1O60240 522 aa7.77□□□□□ -1.17
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