RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa35.84■■■■□ 3.33
CRIP1-201ENST00000330233 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP35.83■■■■□ 3.33
CRIP1-201ENST00000330233 KDRP35968 1356 aa35.83■■■■□ 3.33
CRIP1-201ENST00000330233 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP35.83■■■■□ 3.33
CRIP1-201ENST00000330233 FAM182BQ5T319 152 aa35.82■■■■□ 3.32
CRIP1-201ENST00000330233 SPG7Q9UQ90 795 aa35.82■■■■□ 3.32
CRIP1-201ENST00000330233 AEBP1Q8IUX7 1158 aa35.81■■■■□ 3.32
CRIP1-201ENST00000330233 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP35.8■■■■□ 3.32
CRIP1-201ENST00000330233 KAT6BQ8WYB5 2073 aa35.8■■■■□ 3.32
CRIP1-201ENST00000330233 HMOX1P09601 288 aa35.79■■■■□ 3.32
CRIP1-201ENST00000330233 SOCS7O14512 581 aa35.78■■■■□ 3.32
CRIP1-201ENST00000330233 PKD1L3Q7Z443 1732 aa35.77■■■■□ 3.32
CRIP1-201ENST00000330233 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
CRIP1-201ENST00000330233 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP35.77■■■■□ 3.32
CRIP1-201ENST00000330233 AMOTQ4VCS5 1084 aa35.77■■■■□ 3.32
CRIP1-201ENST00000330233 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
CRIP1-201ENST00000330233 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa35.76■■■■□ 3.32
CRIP1-201ENST00000330233 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa35.76■■■■□ 3.32
CRIP1-201ENST00000330233 SHANK3Q9BYB0 1731 aa35.75■■■■□ 3.31
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC125Q86Z20 511 aa35.75■■■■□ 3.31
CRIP1-201ENST00000330233 BCL9O00512 1426 aa35.74■■■■□ 3.31
CRIP1-201ENST00000330233 FCHSD2O94868 740 aa35.72■■■■□ 3.31
CRIP1-201ENST00000330233 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP35.72■■■■□ 3.31
CRIP1-201ENST00000330233 EP400Q96L91 3159 aa35.71■■■■□ 3.31
CRIP1-201ENST00000330233 SBF2Q86WG5 1849 aa35.71■■■■□ 3.31
CRIP1-201ENST00000330233 IFNL2Q8IZJ0 200 aa35.68■■■■□ 3.3
CRIP1-201ENST00000330233 CYP27B1O15528 508 aa35.67■■■■□ 3.3
CRIP1-201ENST00000330233 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
CRIP1-201ENST00000330233 RSPH6AQ9H0K4 717 aa35.66■■■■□ 3.3
CRIP1-201ENST00000330233 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
CRIP1-201ENST00000330233 TRIM37O94972 964 aa35.63■■■■□ 3.29
CRIP1-201ENST00000330233 PRKAR2BP31323 418 aa35.63■■■■□ 3.29
CRIP1-201ENST00000330233 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
CRIP1-201ENST00000330233 PHKG2P15735 406 aa35.62■■■■□ 3.29
CRIP1-201ENST00000330233 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP35.62■■■■□ 3.29
CRIP1-201ENST00000330233 C1orf141Q5JVX7 400 aa35.61■■■■□ 3.29
CRIP1-201ENST00000330233 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
CRIP1-201ENST00000330233 NEFMP07197 916 aa35.6■■■■□ 3.29
CRIP1-201ENST00000330233 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
CRIP1-201ENST00000330233 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
CRIP1-201ENST00000330233 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.29
CRIP1-201ENST00000330233 GAS2L2Q8NHY3 880 aa35.57■■■■□ 3.28
CRIP1-201ENST00000330233 ACSBG1Q96GR2 724 aa35.57■■■■□ 3.28
CRIP1-201ENST00000330233 AKAP4Q5JQC9 854 aa35.56■■■■□ 3.28
CRIP1-201ENST00000330233 PHACTR3Q96KR7 559 aa35.55■■■■□ 3.28
CRIP1-201ENST00000330233 MRS2Q9HD23 443 aa35.55■■■■□ 3.28
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC184Q52MB2 194 aa35.54■■■■□ 3.28
CRIP1-201ENST00000330233 DCAF5Q96JK2 942 aa35.54■■■■□ 3.28
CRIP1-201ENST00000330233 NHSQ6T4R5 1651 aa35.53■■■■□ 3.28
CRIP1-201ENST00000330233 KCNQ2O43526 872 aa35.53■■■■□ 3.28
CRIP1-201ENST00000330233 DOT1LQ8TEK3 1739 aa35.52■■■■□ 3.28
CRIP1-201ENST00000330233 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
CRIP1-201ENST00000330233 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
CRIP1-201ENST00000330233 PLEKHF1Q96S99 279 aa35.52■■■■□ 3.28
CRIP1-201ENST00000330233 ADAMTS8Q9UP79 889 aa35.52■■■■□ 3.28
CRIP1-201ENST00000330233 APBA3O96018 575 aa35.51■■■■□ 3.27
CRIP1-201ENST00000330233 BAG6P46379 1132 aa35.5■■■■□ 3.27
CRIP1-201ENST00000330233 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
CRIP1-201ENST00000330233 ITGB4P16144 1822 aa35.49■■■■□ 3.27
CRIP1-201ENST00000330233 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa35.47■■■■□ 3.27
CRIP1-201ENST00000330233 ERVV-2B6SEH9 535 aa35.47■■■■□ 3.27
CRIP1-201ENST00000330233 PTF1AQ7RTS3 328 aa35.47■■■■□ 3.27
CRIP1-201ENST00000330233 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
CRIP1-201ENST00000330233 SCN11AQ9UI33 1791 aa35.45■■■■□ 3.27
CRIP1-201ENST00000330233 GNAT3A8MTJ3 354 aa35.45■■■■□ 3.27
CRIP1-201ENST00000330233 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa35.45■■■■□ 3.27
CRIP1-201ENST00000330233 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP35.45■■■■□ 3.27
CRIP1-201ENST00000330233 BTAF1O14981 1849 aa35.44■■■■□ 3.26
CRIP1-201ENST00000330233 PLSCR1O15162 318 aa35.44■■■■□ 3.26
CRIP1-201ENST00000330233 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa35.43■■■■□ 3.26
CRIP1-201ENST00000330233 MAP3K5Q99683 1374 aa35.42■■■■□ 3.26
CRIP1-201ENST00000330233 RUNDC1Q96C34 613 aa35.42■■■■□ 3.26
CRIP1-201ENST00000330233 DEFB132Q7Z7B7 95 aa35.41■■■■□ 3.26
CRIP1-201ENST00000330233 TMOD3Q9NYL9 352 aa35.4■■■■□ 3.26
CRIP1-201ENST00000330233 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP35.39■■■■□ 3.26
CRIP1-201ENST00000330233 CCER2I3L3R5 266 aa35.39■■■■□ 3.26
CRIP1-201ENST00000330233 RNMTO43148 476 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
CRIP1-201ENST00000330233 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP35.39■■■■□ 3.26
CRIP1-201ENST00000330233 DLG5Q8TDM6 1919 aa35.39■■■■□ 3.26
CRIP1-201ENST00000330233 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
CRIP1-201ENST00000330233 CABP4P57796 275 aa35.38■■■■□ 3.25
CRIP1-201ENST00000330233 NFE2L2Q16236 605 aa35.38■■■■□ 3.25
CRIP1-201ENST00000330233 LGR6Q9HBX8 967 aa35.38■■■■□ 3.25
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC146Q8IYE0 955 aa35.37■■■■□ 3.25
CRIP1-201ENST00000330233 PIGBQ92521 554 aa35.37■■■■□ 3.25
CRIP1-201ENST00000330233 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
CRIP1-201ENST00000330233 CAMKK2Q96RR4 588 aa35.36■■■■□ 3.25
CRIP1-201ENST00000330233 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP35.36■■■■□ 3.25
CRIP1-201ENST00000330233 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa35.36■■■■□ 3.25
CRIP1-201ENST00000330233 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa35.35■■■■□ 3.25
CRIP1-201ENST00000330233 IL17REQ8NFR9 667 aa35.33■■■■□ 3.25
CRIP1-201ENST00000330233 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa35.32■■■■□ 3.25
CRIP1-201ENST00000330233 SLC52A2Q9HAB3 445 aa35.32■■■■□ 3.25
CRIP1-201ENST00000330233 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.24
CRIP1-201ENST00000330233 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.24
CRIP1-201ENST00000330233 TMPOP42166 694 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
CRIP1-201ENST00000330233 RIPK4P57078 832 aa35.3■■■■□ 3.24
CRIP1-201ENST00000330233 MIER1Q8N108 512 aa35.3■■■■□ 3.24
CRIP1-201ENST00000330233 TEFQ10587 303 aa35.28■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms