RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329565.5

SNN-201, Transcript of stannin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNN, Length 3,312 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNN-201ENST00000329565 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
SNN-201ENST00000329565 LRSAM1Q6UWE0 723 aa22.64■■□□□ 1.21
SNN-201ENST00000329565 VGLL3A8MV65 326 aa22.64■■□□□ 1.21
SNN-201ENST00000329565 ZBTB22O15209 634 aa22.64■■□□□ 1.21
SNN-201ENST00000329565 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.64■■□□□ 1.21
SNN-201ENST00000329565 ABCC4O15439 1325 aa22.63■■□□□ 1.21
SNN-201ENST00000329565 NEK4P51957 841 aa22.63■■□□□ 1.21
SNN-201ENST00000329565 TERF1P54274 439 aa22.63■■□□□ 1.21
SNN-201ENST00000329565 DMTNQ08495 405 aa22.63■■□□□ 1.21
SNN-201ENST00000329565 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.63■■□□□ 1.21
SNN-201ENST00000329565 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
SNN-201ENST00000329565 DCTPP1Q9H773 170 aa22.62■■□□□ 1.21
SNN-201ENST00000329565 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SNN-201ENST00000329565 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.62■■□□□ 1.21
SNN-201ENST00000329565 MED14O60244 1454 aa22.62■■□□□ 1.21
SNN-201ENST00000329565 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SNN-201ENST00000329565 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.61■■□□□ 1.21
SNN-201ENST00000329565 USP32Q8NFA0 1604 aa22.61■■□□□ 1.21
SNN-201ENST00000329565 CASC1Q6TDU7 716 aa22.61■■□□□ 1.21
SNN-201ENST00000329565 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.6■■□□□ 1.21
SNN-201ENST00000329565 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SNN-201ENST00000329565 PPLO60437 1756 aa22.6■■□□□ 1.21
SNN-201ENST00000329565 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP22.6■■□□□ 1.21
SNN-201ENST00000329565 HS1BP3Q53T59 392 aa22.59■■□□□ 1.21
SNN-201ENST00000329565 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.59■■□□□ 1.21
SNN-201ENST00000329565 MEIS3Q99687 375 aa22.59■■□□□ 1.21
SNN-201ENST00000329565 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.59■■□□□ 1.21
SNN-201ENST00000329565 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SNN-201ENST00000329565 ZNF428Q96B54 188 aa22.59■■□□□ 1.21
SNN-201ENST00000329565 IFT57Q9NWB7 429 aa22.59■■□□□ 1.21
SNN-201ENST00000329565 SPC24Q8NBT2 197 aa22.59■■□□□ 1.21
SNN-201ENST00000329565 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
SNN-201ENST00000329565 TSPY26PQ9H489 355 aa22.58■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 NME9Q86XW9 330 aa22.57■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.57■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.57■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22.57■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 RAPGEF3O95398 923 aa22.57■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 PTCH1Q13635 1447 aa22.57■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 MYRIPQ8NFW9 859 aa22.56■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.56■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 CEP85Q6P2H3 762 aa22.55■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 TMX3Q96JJ7 454 aa22.55■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 CFAP44Q96MT7 982 aa22.55■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 REC8O95072 547 aa22.54■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.54■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 SOX12O15370 315 aa22.54■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.54■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 KIF3AQ9Y496 699 aa22.54■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 MCM10Q7L590 875 aa22.54■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.53■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.53■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 F6X3S4 739 aa22.53■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.53■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 ERC2O15083 957 aa22.53■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.53■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 PIK3R4Q99570 1358 aa22.53■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.52■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.52■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 ZNF853P0CG23 659 aa22.52■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.52■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.52■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.52■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.52■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 ADCY5O95622 1261 aa22.52■■□□□ 1.2
SNN-201ENST00000329565 RILPL2Q969X0 211 aa22.51■■□□□ 1.19
SNN-201ENST00000329565 PALD1Q9ULE6 856 aa22.51■■□□□ 1.19
SNN-201ENST00000329565 MSH6P52701 1360 aa22.51■■□□□ 1.19
SNN-201ENST00000329565 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.51■■□□□ 1.19
SNN-201ENST00000329565 IL13P35225 146 aa22.5■■□□□ 1.19
SNN-201ENST00000329565 PLCD3Q8N3E9 789 aa22.5■■□□□ 1.19
SNN-201ENST00000329565 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.5■■□□□ 1.19
SNN-201ENST00000329565 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.49■■□□□ 1.19
SNN-201ENST00000329565 PDE4CQ08493 712 aa22.49■■□□□ 1.19
SNN-201ENST00000329565 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.48■■□□□ 1.19
SNN-201ENST00000329565 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
SNN-201ENST00000329565 SLC4A2P04920 1241 aa22.47■■□□□ 1.19
SNN-201ENST00000329565 MCM5P33992 734 aa22.47■■□□□ 1.19
SNN-201ENST00000329565 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.47■■□□□ 1.19
SNN-201ENST00000329565 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.47■■□□□ 1.19
SNN-201ENST00000329565 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SNN-201ENST00000329565 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SNN-201ENST00000329565 NECTIN2Q92692 538 aa22.46■■□□□ 1.19
SNN-201ENST00000329565 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SNN-201ENST00000329565 PDE1AP54750 535 aa22.46■■□□□ 1.19
SNN-201ENST00000329565 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.45■■□□□ 1.19
SNN-201ENST00000329565 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SNN-201ENST00000329565 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.45■■□□□ 1.18
SNN-201ENST00000329565 ASXL2Q76L83 1435 aa22.45■■□□□ 1.18
SNN-201ENST00000329565 ATP10DQ9P241 1426 aa22.44■■□□□ 1.18
SNN-201ENST00000329565 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.7 ms