RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327331.2

CDCA8-201, Transcript of cell division cycle associated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CDCA8, Length 2,303 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8-201ENST00000327331 ERBB3P21860 1342 aa14.98□□□□□ -0.01
CDCA8-201ENST00000327331 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa14.98□□□□□ -0.01
CDCA8-201ENST00000327331 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa14.97□□□□□ -0.01
CDCA8-201ENST00000327331 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
CDCA8-201ENST00000327331 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
CDCA8-201ENST00000327331 MIS18AQ9NYP9 233 aa14.97□□□□□ -0.01
CDCA8-201ENST00000327331 UBAP1LF5GYI3 381 aa14.96□□□□□ -0.01
CDCA8-201ENST00000327331 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CDCA8-201ENST00000327331 LMOD3Q0VAK6 560 aa14.95□□□□□ -0.02
CDCA8-201ENST00000327331 MBIPQ9NS73 344 aa14.95□□□□□ -0.02
CDCA8-201ENST00000327331 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CDCA8-201ENST00000327331 IL16Q14005 1332 aa14.94□□□□□ -0.02
CDCA8-201ENST00000327331 GAS2L2Q8NHY3 880 aa14.94□□□□□ -0.02
CDCA8-201ENST00000327331 EXOC6Q8TAG9 804 aa14.94□□□□□ -0.02
CDCA8-201ENST00000327331 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CDCA8-201ENST00000327331 STRN4Q9NRL3 753 aa14.94□□□□□ -0.02
CDCA8-201ENST00000327331 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CDCA8-201ENST00000327331 COL18A1P39060 1754 aa14.93□□□□□ -0.02
CDCA8-201ENST00000327331 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CDCA8-201ENST00000327331 TOM1O60784 492 aa14.93□□□□□ -0.02
CDCA8-201ENST00000327331 RARSP54136 660 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CDCA8-201ENST00000327331 KRT24Q2M2I5 525 aa14.93□□□□□ -0.02
CDCA8-201ENST00000327331 TSPYL6Q8N831 410 aa14.93□□□□□ -0.02
CDCA8-201ENST00000327331 CPDO75976 1380 aa14.92□□□□□ -0.02
CDCA8-201ENST00000327331 IFT57Q9NWB7 429 aa14.92□□□□□ -0.02
CDCA8-201ENST00000327331 TNNQ9UQP3 1299 aa14.92□□□□□ -0.02
CDCA8-201ENST00000327331 ABCA3Q99758 1704 aa14.91□□□□□ -0.02
CDCA8-201ENST00000327331 GNAT3A8MTJ3 354 aa14.91□□□□□ -0.02
CDCA8-201ENST00000327331 ZNF853P0CG23 659 aa14.91□□□□□ -0.02
CDCA8-201ENST00000327331 GNAI1P63096 354 aa14.91□□□□□ -0.02
CDCA8-201ENST00000327331 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CDCA8-201ENST00000327331 CRBNQ96SW2 442 aa14.91□□□□□ -0.02
CDCA8-201ENST00000327331 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa14.91□□□□□ -0.02
CDCA8-201ENST00000327331 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CDCA8-201ENST00000327331 IL17REQ8NFR9 667 aa14.91□□□□□ -0.02
CDCA8-201ENST00000327331 CFAP44Q96MT7 982 aa14.91□□□□□ -0.02
CDCA8-201ENST00000327331 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CDCA8-201ENST00000327331 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CDCA8-201ENST00000327331 CANXP27824 592 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CDCA8-201ENST00000327331 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CDCA8-201ENST00000327331 LGR6Q9HBX8 967 aa14.9□□□□□ -0.02
CDCA8-201ENST00000327331 USP35Q9P2H5 1018 aa14.9□□□□□ -0.02
CDCA8-201ENST00000327331 MAP3K5Q99683 1374 aa14.9□□□□□ -0.02
CDCA8-201ENST00000327331 ADAMTS2O95450 1211 aa14.89□□□□□ -0.03
CDCA8-201ENST00000327331 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa14.89□□□□□ -0.03
CDCA8-201ENST00000327331 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa14.89□□□□□ -0.03
CDCA8-201ENST00000327331 C8orf58Q8NAV2 365 aa14.89□□□□□ -0.03
CDCA8-201ENST00000327331 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CDCA8-201ENST00000327331 CRB1P82279 1406 aa14.89□□□□□ -0.03
CDCA8-201ENST00000327331 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CDCA8-201ENST00000327331 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CDCA8-201ENST00000327331 SSH1Q8WYL5 1049 aa14.88□□□□□ -0.03
CDCA8-201ENST00000327331 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa14.88□□□□□ -0.03
CDCA8-201ENST00000327331 PHLPP1O60346 1717 aa14.88□□□□□ -0.03
CDCA8-201ENST00000327331 MEGF6O75095 1541 aa14.88□□□□□ -0.03
CDCA8-201ENST00000327331 SMC4Q9NTJ3 1288 aa14.88□□□□□ -0.03
CDCA8-201ENST00000327331 BTG4Q9NY30 223 aa14.88□□□□□ -0.03
CDCA8-201ENST00000327331 EVA1CP58658 441 aa14.87□□□□□ -0.03
CDCA8-201ENST00000327331 CLUAP1Q96AJ1 413 aa14.87□□□□□ -0.03
CDCA8-201ENST00000327331 NCAPD2Q15021 1401 aa14.87□□□□□ -0.03
CDCA8-201ENST00000327331 PANK1Q8TE04 598 aa14.87□□□□□ -0.03
CDCA8-201ENST00000327331 TSPYL4Q9UJ04 414 aa14.87□□□□□ -0.03
CDCA8-201ENST00000327331 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CDCA8-201ENST00000327331 CHL1O00533 1208 aa14.86□□□□□ -0.03
CDCA8-201ENST00000327331 TATP17735 454 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CDCA8-201ENST00000327331 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CDCA8-201ENST00000327331 WDR17Q8IZU2 1322 aa14.85□□□□□ -0.03
CDCA8-201ENST00000327331 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CDCA8-201ENST00000327331 LMO7Q8WWI1 1683 aa14.85□□□□□ -0.03
CDCA8-201ENST00000327331 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CDCA8-201ENST00000327331 C1orf141Q5JVX7 400 aa14.85□□□□□ -0.03
CDCA8-201ENST00000327331 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CDCA8-201ENST00000327331 VAMP4O75379 141 aa14.84□□□□□ -0.03
CDCA8-201ENST00000327331 CERKQ8TCT0 537 aa14.84□□□□□ -0.03
CDCA8-201ENST00000327331 AMOTQ4VCS5 1084 aa14.84□□□□□ -0.03
CDCA8-201ENST00000327331 RLBP1P12271 317 aa14.83□□□□□ -0.03
CDCA8-201ENST00000327331 AKAP4Q5JQC9 854 aa14.83□□□□□ -0.03
CDCA8-201ENST00000327331 COG6Q9Y2V7 657 aa14.83□□□□□ -0.04
CDCA8-201ENST00000327331 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CDCA8-201ENST00000327331 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CDCA8-201ENST00000327331 NECTIN2Q92692 538 aa14.82□□□□□ -0.04
CDCA8-201ENST00000327331 ABCC6O95255 1503 aa14.81□□□□□ -0.04
CDCA8-201ENST00000327331 RNMTO43148 476 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
CDCA8-201ENST00000327331 KCNQ3O43525 872 aa14.81□□□□□ -0.04
CDCA8-201ENST00000327331 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CDCA8-201ENST00000327331 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CDCA8-201ENST00000327331 LRRC37A3O60309 1634 aa14.8□□□□□ -0.04
CDCA8-201ENST00000327331 CYP27B1O15528 508 aa14.8□□□□□ -0.04
CDCA8-201ENST00000327331 TEFQ10587 303 aa14.8□□□□□ -0.04
CDCA8-201ENST00000327331 PHKG2P15735 406 aa14.8□□□□□ -0.04
CDCA8-201ENST00000327331 SPG7Q9UQ90 795 aa14.8□□□□□ -0.04
CDCA8-201ENST00000327331 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa14.79□□□□□ -0.04
CDCA8-201ENST00000327331 CARD10Q9BWT7 1032 aa14.79□□□□□ -0.04
CDCA8-201ENST00000327331 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
CDCA8-201ENST00000327331 TRIM27P14373 513 aa14.78□□□□□ -0.04
CDCA8-201ENST00000327331 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa14.78□□□□□ -0.04
CDCA8-201ENST00000327331 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
CDCA8-201ENST00000327331 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
CDCA8-201ENST00000327331 BTBD11A6QL63 1104 aa14.77□□□□□ -0.04
CDCA8-201ENST00000327331 IL2RBP14784 551 aa14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 148.7 ms