RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325974.8

CCZ1-201, Transcript of CCZ1 homolog, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCZ1, Length 1,802 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1-201ENST00000325974 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa35.94■■■■□ 3.34
CCZ1-201ENST00000325974 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP35.94■■■■□ 3.34
CCZ1-201ENST00000325974 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
CCZ1-201ENST00000325974 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa35.93■■■■□ 3.34
CCZ1-201ENST00000325974 TSPYL6Q8N831 410 aa35.92■■■■□ 3.34
CCZ1-201ENST00000325974 GNAT3A8MTJ3 354 aa35.92■■■■□ 3.34
CCZ1-201ENST00000325974 COG6Q9Y2V7 657 aa35.92■■■■□ 3.34
CCZ1-201ENST00000325974 COL18A1P39060 1754 aa35.91■■■■□ 3.34
CCZ1-201ENST00000325974 LRRC37A3O60309 1634 aa35.91■■■■□ 3.34
CCZ1-201ENST00000325974 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
CCZ1-201ENST00000325974 CABLES1Q8TDN4 633 aa35.9■■■■□ 3.34
CCZ1-201ENST00000325974 TNNQ9UQP3 1299 aa35.9■■■■□ 3.34
CCZ1-201ENST00000325974 MAP3K5Q99683 1374 aa35.9■■■■□ 3.34
CCZ1-201ENST00000325974 MS4A1P11836 297 aa35.9■■■■□ 3.34
CCZ1-201ENST00000325974 RLBP1P12271 317 aa35.9■■■■□ 3.34
CCZ1-201ENST00000325974 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
CCZ1-201ENST00000325974 KIF16BQ96L93 1317 aa35.89■■■■□ 3.34
CCZ1-201ENST00000325974 C8orf58Q8NAV2 365 aa35.89■■■■□ 3.34
CCZ1-201ENST00000325974 ABCC6O95255 1503 aa35.89■■■■□ 3.34
CCZ1-201ENST00000325974 ERBB3P21860 1342 aa35.87■■■■□ 3.33
CCZ1-201ENST00000325974 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP35.86■■■■□ 3.33
CCZ1-201ENST00000325974 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
CCZ1-201ENST00000325974 KIAA0232Q92628 1395 aa35.85■■■■□ 3.33
CCZ1-201ENST00000325974 NHSL1Q5SYE7 1610 aa35.85■■■■□ 3.33
CCZ1-201ENST00000325974 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP35.85■■■■□ 3.33
CCZ1-201ENST00000325974 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa35.85■■■■□ 3.33
CCZ1-201ENST00000325974 CLUAP1Q96AJ1 413 aa35.85■■■■□ 3.33
CCZ1-201ENST00000325974 CPDO75976 1380 aa35.84■■■■□ 3.33
CCZ1-201ENST00000325974 LMO7Q8WWI1 1683 aa35.84■■■■□ 3.33
CCZ1-201ENST00000325974 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
CCZ1-201ENST00000325974 TRIM27P14373 513 aa35.83■■■■□ 3.33
CCZ1-201ENST00000325974 AAMPQ13685 434 aa35.83■■■■□ 3.33
CCZ1-201ENST00000325974 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP35.83■■■■□ 3.33
CCZ1-201ENST00000325974 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP35.81■■■■□ 3.32
CCZ1-201ENST00000325974 KDM2BQ8NHM5 1336 aa35.8■■■■□ 3.32
CCZ1-201ENST00000325974 IL17REQ8NFR9 667 aa35.8■■■■□ 3.32
CCZ1-201ENST00000325974 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
CCZ1-201ENST00000325974 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
CCZ1-201ENST00000325974 MVPQ14764 893 aaKnown RBP35.79■■■■□ 3.32
CCZ1-201ENST00000325974 AMOTQ4VCS5 1084 aa35.79■■■■□ 3.32
CCZ1-201ENST00000325974 TSPYL4Q9UJ04 414 aa35.79■■■■□ 3.32
CCZ1-201ENST00000325974 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP35.78■■■■□ 3.32
CCZ1-201ENST00000325974 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
CCZ1-201ENST00000325974 MIS18AQ9NYP9 233 aa35.76■■■■□ 3.32
CCZ1-201ENST00000325974 CHRNA2Q15822 529 aa35.75■■■■□ 3.31
CCZ1-201ENST00000325974 ARHGAP45Q92619 1136 aa35.75■■■■□ 3.31
CCZ1-201ENST00000325974 KRT24Q2M2I5 525 aa35.74■■■■□ 3.31
CCZ1-201ENST00000325974 BABAM1Q9NWV8 329 aa35.74■■■■□ 3.31
CCZ1-201ENST00000325974 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa35.73■■■■□ 3.31
CCZ1-201ENST00000325974 LTBP4Q8N2S1 1624 aa35.73■■■■□ 3.31
CCZ1-201ENST00000325974 ABCA3Q99758 1704 aa35.73■■■■□ 3.31
CCZ1-201ENST00000325974 AKAP4Q5JQC9 854 aa35.73■■■■□ 3.31
CCZ1-201ENST00000325974 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
CCZ1-201ENST00000325974 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP35.71■■■■□ 3.31
CCZ1-201ENST00000325974 NLRP2Q9NX02 1062 aa35.71■■■■□ 3.31
CCZ1-201ENST00000325974 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP35.69■■■■□ 3.3
CCZ1-201ENST00000325974 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa35.68■■■■□ 3.3
CCZ1-201ENST00000325974 DDX19BQ9UMR2 479 aa35.68■■■■□ 3.3
CCZ1-201ENST00000325974 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
CCZ1-201ENST00000325974 TMEM57Q8N5G2 664 aa35.67■■■■□ 3.3
CCZ1-201ENST00000325974 C1orf141Q5JVX7 400 aa35.67■■■■□ 3.3
CCZ1-201ENST00000325974 ITPRIPQ8IWB1 547 aa35.66■■■■□ 3.3
CCZ1-201ENST00000325974 PRDM11Q9NQV5 511 aa35.66■■■■□ 3.3
CCZ1-201ENST00000325974 LGR6Q9HBX8 967 aa35.65■■■■□ 3.3
CCZ1-201ENST00000325974 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa35.64■■■■□ 3.3
CCZ1-201ENST00000325974 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa35.64■■■■□ 3.3
CCZ1-201ENST00000325974 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa35.62■■■■□ 3.29
CCZ1-201ENST00000325974 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa35.62■■■■□ 3.29
CCZ1-201ENST00000325974 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
CCZ1-201ENST00000325974 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa35.61■■■■□ 3.29
CCZ1-201ENST00000325974 IGHDP01880 384 aa35.6■■■■□ 3.29
CCZ1-201ENST00000325974 TATP17735 454 aaPredicted RBP35.6■■■■□ 3.29
CCZ1-201ENST00000325974 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP35.6■■■■□ 3.29
CCZ1-201ENST00000325974 ABCC4O15439 1325 aa35.59■■■■□ 3.29
CCZ1-201ENST00000325974 RNMTO43148 476 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
CCZ1-201ENST00000325974 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa35.59■■■■□ 3.29
CCZ1-201ENST00000325974 KDM3BQ7LBC6 1761 aa35.59■■■■□ 3.29
CCZ1-201ENST00000325974 MEGF6O75095 1541 aa35.58■■■■□ 3.29
CCZ1-201ENST00000325974 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP35.57■■■■□ 3.29
CCZ1-201ENST00000325974 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa35.57■■■■□ 3.28
CCZ1-201ENST00000325974 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.28
CCZ1-201ENST00000325974 TEFQ10587 303 aa35.56■■■■□ 3.28
CCZ1-201ENST00000325974 WDR17Q8IZU2 1322 aa35.54■■■■□ 3.28
CCZ1-201ENST00000325974 SPG7Q9UQ90 795 aa35.54■■■■□ 3.28
CCZ1-201ENST00000325974 CACNA1FO60840 1977 aa35.54■■■■□ 3.28
CCZ1-201ENST00000325974 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP35.53■■■■□ 3.28
CCZ1-201ENST00000325974 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa35.53■■■■□ 3.28
CCZ1-201ENST00000325974 PKD1L3Q7Z443 1732 aa35.52■■■■□ 3.28
CCZ1-201ENST00000325974 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
CCZ1-201ENST00000325974 PTPRCP08575 1304 aa35.52■■■■□ 3.28
CCZ1-201ENST00000325974 SLC4A2P04920 1241 aa35.51■■■■□ 3.28
CCZ1-201ENST00000325974 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP35.51■■■■□ 3.28
CCZ1-201ENST00000325974 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
CCZ1-201ENST00000325974 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
CCZ1-201ENST00000325974 SCN11AQ9UI33 1791 aa35.49■■■■□ 3.27
CCZ1-201ENST00000325974 RGS12O14924 1447 aa35.49■■■■□ 3.27
CCZ1-201ENST00000325974 CCDC30Q5VVM6 783 aa35.48■■■■□ 3.27
CCZ1-201ENST00000325974 BTBD11A6QL63 1104 aa35.48■■■■□ 3.27
CCZ1-201ENST00000325974 SKAP1Q86WV1 359 aa35.48■■■■□ 3.27
CCZ1-201ENST00000325974 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms