RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322326.12

IFT20-201, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

TSL 2

Gene IFT20, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-201ENST00000322326 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
IFT20-201ENST00000322326 LRRC4BQ9NT99 713 aa21.72■■□□□ 1.07
IFT20-201ENST00000322326 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.72■■□□□ 1.07
IFT20-201ENST00000322326 MAP3K5Q99683 1374 aa21.72■■□□□ 1.07
IFT20-201ENST00000322326 NSD3Q9BZ95 1437 aa21.72■■□□□ 1.07
IFT20-201ENST00000322326 CHD4Q14839 1912 aa21.71■■□□□ 1.07
IFT20-201ENST00000322326 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
IFT20-201ENST00000322326 SLC16A10Q8TF71 515 aa21.7■■□□□ 1.06
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IFT20-201ENST00000322326 AKT1S1Q96B36 256 aa21.69■■□□□ 1.06
IFT20-201ENST00000322326 QSER1Q2KHR3 1735 aa21.69■■□□□ 1.06
IFT20-201ENST00000322326 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.68■■□□□ 1.06
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IFT20-201ENST00000322326 POLD1P28340 1107 aa21.67■■□□□ 1.06
IFT20-201ENST00000322326 AMPHP49418 695 aa21.67■■□□□ 1.06
IFT20-201ENST00000322326 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
IFT20-201ENST00000322326 CARD14Q9BXL6 1004 aa21.67■■□□□ 1.06
IFT20-201ENST00000322326 MAP3K19Q56UN5 1328 aa21.66■■□□□ 1.06
IFT20-201ENST00000322326 HOXC9P31274 260 aa21.66■■□□□ 1.06
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IFT20-201ENST00000322326 GPR162Q16538 588 aa21.64■■□□□ 1.05
IFT20-201ENST00000322326 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa21.64■■□□□ 1.05
IFT20-201ENST00000322326 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa21.63■■□□□ 1.05
IFT20-201ENST00000322326 NSD2O96028 1365 aa21.63■■□□□ 1.05
IFT20-201ENST00000322326 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa21.63■■□□□ 1.05
IFT20-201ENST00000322326 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa21.63■■□□□ 1.05
IFT20-201ENST00000322326 KLHL34Q8N239 644 aa21.63■■□□□ 1.05
IFT20-201ENST00000322326 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
IFT20-201ENST00000322326 ANP32CO43423 234 aa21.62■■□□□ 1.05
IFT20-201ENST00000322326 RTL1A6NKG5 1358 aa21.61■■□□□ 1.05
IFT20-201ENST00000322326 RGPD2P0DJD1 1756 aa21.61■■□□□ 1.05
IFT20-201ENST00000322326 LY75O60449 1722 aa21.61■■□□□ 1.05
IFT20-201ENST00000322326 COL24A1Q17RW2 1714 aa21.61■■□□□ 1.05
IFT20-201ENST00000322326 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa21.6■■□□□ 1.05
IFT20-201ENST00000322326 KCNQ4P56696 695 aa21.6■■□□□ 1.05
IFT20-201ENST00000322326 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
IFT20-201ENST00000322326 SHANK3Q9BYB0 1731 aa21.6■■□□□ 1.05
IFT20-201ENST00000322326 MEGF6O75095 1541 aa21.6■■□□□ 1.05
IFT20-201ENST00000322326 FBLN1P23142 703 aa21.59■■□□□ 1.05
IFT20-201ENST00000322326 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
IFT20-201ENST00000322326 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
IFT20-201ENST00000322326 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
IFT20-201ENST00000322326 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
IFT20-201ENST00000322326 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
IFT20-201ENST00000322326 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa21.56■■□□□ 1.04
IFT20-201ENST00000322326 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
IFT20-201ENST00000322326 NBPF6Q5VWK0 638 aa21.55■■□□□ 1.04
IFT20-201ENST00000322326 NBPF4Q96M43 638 aa21.55■■□□□ 1.04
IFT20-201ENST00000322326 FYB1O15117 783 aa21.54■■□□□ 1.04
IFT20-201ENST00000322326 MSH5O43196 834 aa21.54■■□□□ 1.04
IFT20-201ENST00000322326 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
IFT20-201ENST00000322326 RALBP1Q15311 655 aa21.54■■□□□ 1.04
IFT20-201ENST00000322326 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.54■■□□□ 1.04
IFT20-201ENST00000322326 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
IFT20-201ENST00000322326 TATP17735 454 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
IFT20-201ENST00000322326 C1QTNF8P60827 252 aa21.53■■□□□ 1.04
IFT20-201ENST00000322326 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.52■■□□□ 1.04
IFT20-201ENST00000322326 MORC1Q86VD1 984 aa21.52■■□□□ 1.04
IFT20-201ENST00000322326 USHBP1Q8N6Y0 703 aa21.52■■□□□ 1.04
IFT20-201ENST00000322326 NLGN2Q8NFZ4 835 aa21.51■■□□□ 1.03
IFT20-201ENST00000322326 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
IFT20-201ENST00000322326 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa21.5■■□□□ 1.03
IFT20-201ENST00000322326 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa21.5■■□□□ 1.03
IFT20-201ENST00000322326 INSRP06213 1382 aa21.49■■□□□ 1.03
IFT20-201ENST00000322326 FLT4P35916 1363 aa21.48■■□□□ 1.03
IFT20-201ENST00000322326 KIF24Q5T7B8 1368 aa21.48■■□□□ 1.03
IFT20-201ENST00000322326 C5P01031 1676 aa21.48■■□□□ 1.03
IFT20-201ENST00000322326 GRIN3BO60391 1043 aa21.48■■□□□ 1.03
IFT20-201ENST00000322326 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
IFT20-201ENST00000322326 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa21.47■■□□□ 1.03
IFT20-201ENST00000322326 FLAD1Q8NFF5 587 aa21.47■■□□□ 1.03
IFT20-201ENST00000322326 MIER1Q8N108 512 aa21.46■■□□□ 1.03
IFT20-201ENST00000322326 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
IFT20-201ENST00000322326 PALLDQ8WX93 1383 aa21.46■■□□□ 1.03
IFT20-201ENST00000322326 MSL1Q68DK7 614 aa21.45■■□□□ 1.02
IFT20-201ENST00000322326 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa21.44■■□□□ 1.02
IFT20-201ENST00000322326 TAF1LQ8IZX4 1826 aa21.43■■□□□ 1.02
IFT20-201ENST00000322326 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.02
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IFT20-201ENST00000322326 CD2APQ9Y5K6 639 aa21.41■■□□□ 1.02
IFT20-201ENST00000322326 PPP2R1AP30153 589 aa21.4■■□□□ 1.02
IFT20-201ENST00000322326 AK7Q96M32 723 aa21.4■■□□□ 1.02
IFT20-201ENST00000322326 ITGB4P16144 1822 aa21.4■■□□□ 1.02
IFT20-201ENST00000322326 C4BP0C0L5 1744 aa21.39■■□□□ 1.01
IFT20-201ENST00000322326 PKD1L3Q7Z443 1732 aa21.39■■□□□ 1.01
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IFT20-201ENST00000322326 CCER2I3L3R5 266 aa21.39■■□□□ 1.01
IFT20-201ENST00000322326 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa21.38■■□□□ 1.01
IFT20-201ENST00000322326 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa21.38■■□□□ 1.01
IFT20-201ENST00000322326 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
IFT20-201ENST00000322326 SPG7Q9UQ90 795 aa21.37■■□□□ 1.01
IFT20-201ENST00000322326 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
IFT20-201ENST00000322326 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
IFT20-201ENST00000322326 PIGBQ92521 554 aa21.35■■□□□ 1.01
IFT20-201ENST00000322326 NCAPD2Q15021 1401 aa21.35■■□□□ 1.01
IFT20-201ENST00000322326 UBR3Q6ZT12 1888 aa21.34■■□□□ 1.01
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