RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322175.7

TPRX1-201, Transcript of tetrapeptide repeat homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TPRX1, Length 1,924 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRX1-201ENST00000322175 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
TPRX1-201ENST00000322175 HMOX1P09601 288 aa20.61■□□□□ 0.89
TPRX1-201ENST00000322175 PDE3BQ13370 1112 aa20.61■□□□□ 0.89
TPRX1-201ENST00000322175 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa20.61■□□□□ 0.89
TPRX1-201ENST00000322175 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
TPRX1-201ENST00000322175 MEGF6O75095 1541 aa20.59■□□□□ 0.89
TPRX1-201ENST00000322175 ADAMTS8Q9UP79 889 aa20.59■□□□□ 0.89
TPRX1-201ENST00000322175 TATP17735 454 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
TPRX1-201ENST00000322175 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
TPRX1-201ENST00000322175 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
TPRX1-201ENST00000322175 NCAPD2Q15021 1401 aa20.56■□□□□ 0.88
TPRX1-201ENST00000322175 WNK3Q9BYP7 1800 aa20.55■□□□□ 0.88
TPRX1-201ENST00000322175 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
TPRX1-201ENST00000322175 NUDCQ9Y266 331 aa20.55■□□□□ 0.88
TPRX1-201ENST00000322175 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
TPRX1-201ENST00000322175 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
TPRX1-201ENST00000322175 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.55■□□□□ 0.88
TPRX1-201ENST00000322175 LRRC37A3O60309 1634 aa20.54■□□□□ 0.88
TPRX1-201ENST00000322175 RGPD1P0DJD0 1748 aa20.54■□□□□ 0.88
TPRX1-201ENST00000322175 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa20.53■□□□□ 0.88
TPRX1-201ENST00000322175 KDRP35968 1356 aa20.51■□□□□ 0.87
TPRX1-201ENST00000322175 TNS2Q63HR2 1409 aa20.51■□□□□ 0.87
TPRX1-201ENST00000322175 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
TPRX1-201ENST00000322175 CYP27B1O15528 508 aa20.49■□□□□ 0.87
TPRX1-201ENST00000322175 SPG7Q9UQ90 795 aa20.49■□□□□ 0.87
TPRX1-201ENST00000322175 FAM196AQ6ZSG2 479 aa20.48■□□□□ 0.87
TPRX1-201ENST00000322175 RSPH6AQ9H0K4 717 aa20.48■□□□□ 0.87
TPRX1-201ENST00000322175 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
TPRX1-201ENST00000322175 PRKAR2BP31323 418 aa20.47■□□□□ 0.87
TPRX1-201ENST00000322175 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
TPRX1-201ENST00000322175 PHACTR3Q96KR7 559 aa20.47■□□□□ 0.87
TPRX1-201ENST00000322175 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
TPRX1-201ENST00000322175 ACSBG1Q96GR2 724 aa20.46■□□□□ 0.87
TPRX1-201ENST00000322175 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
TPRX1-201ENST00000322175 TRIM37O94972 964 aa20.45■□□□□ 0.86
TPRX1-201ENST00000322175 PTF1AQ7RTS3 328 aa20.45■□□□□ 0.86
TPRX1-201ENST00000322175 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
TPRX1-201ENST00000322175 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa20.45■□□□□ 0.86
TPRX1-201ENST00000322175 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa20.45■□□□□ 0.86
TPRX1-201ENST00000322175 FCHSD2O94868 740 aa20.45■□□□□ 0.86
TPRX1-201ENST00000322175 SHANK3Q9BYB0 1731 aa20.44■□□□□ 0.86
TPRX1-201ENST00000322175 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
TPRX1-201ENST00000322175 AMOTQ4VCS5 1084 aa20.44■□□□□ 0.86
TPRX1-201ENST00000322175 KCNQ2O43526 872 aa20.43■□□□□ 0.86
TPRX1-201ENST00000322175 PHKG2P15735 406 aa20.43■□□□□ 0.86
TPRX1-201ENST00000322175 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
TPRX1-201ENST00000322175 FKBP8Q14318 412 aa20.43■□□□□ 0.86
TPRX1-201ENST00000322175 IFNL2Q8IZJ0 200 aa20.43■□□□□ 0.86
TPRX1-201ENST00000322175 SOCS7O14512 581 aa20.42■□□□□ 0.86
TPRX1-201ENST00000322175 PKD1L3Q7Z443 1732 aa20.41■□□□□ 0.86
TPRX1-201ENST00000322175 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.41■□□□□ 0.86
TPRX1-201ENST00000322175 KAT6BQ8WYB5 2073 aa20.4■□□□□ 0.86
TPRX1-201ENST00000322175 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
TPRX1-201ENST00000322175 PLEKHF1Q96S99 279 aa20.4■□□□□ 0.86
TPRX1-201ENST00000322175 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
TPRX1-201ENST00000322175 C1orf141Q5JVX7 400 aa20.39■□□□□ 0.85
TPRX1-201ENST00000322175 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa20.39■□□□□ 0.85
TPRX1-201ENST00000322175 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
TPRX1-201ENST00000322175 CDCA7LQ96GN5 454 aa20.38■□□□□ 0.85
TPRX1-201ENST00000322175 ZNF521Q96K83 1311 aa20.36■□□□□ 0.85
TPRX1-201ENST00000322175 BCL9O00512 1426 aa20.36■□□□□ 0.85
TPRX1-201ENST00000322175 APAF1O14727 1248 aa20.36■□□□□ 0.85
TPRX1-201ENST00000322175 AKAP4Q5JQC9 854 aa20.36■□□□□ 0.85
TPRX1-201ENST00000322175 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa20.36■□□□□ 0.85
TPRX1-201ENST00000322175 APBA3O96018 575 aa20.35■□□□□ 0.85
TPRX1-201ENST00000322175 DEFB132Q7Z7B7 95 aa20.35■□□□□ 0.85
TPRX1-201ENST00000322175 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
TPRX1-201ENST00000322175 LGR6Q9HBX8 967 aa20.35■□□□□ 0.85
TPRX1-201ENST00000322175 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TPRX1-201ENST00000322175 GAS2L2Q8NHY3 880 aa20.35■□□□□ 0.85
TPRX1-201ENST00000322175 SBF2Q86WG5 1849 aa20.35■□□□□ 0.85
TPRX1-201ENST00000322175 NEFLP07196 543 aa20.34■□□□□ 0.85
TPRX1-201ENST00000322175 NEFMP07197 916 aa20.34■□□□□ 0.85
TPRX1-201ENST00000322175 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
TPRX1-201ENST00000322175 CCDC125Q86Z20 511 aa20.33■□□□□ 0.85
TPRX1-201ENST00000322175 DCAF5Q96JK2 942 aa20.33■□□□□ 0.85
TPRX1-201ENST00000322175 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.32■□□□□ 0.84
TPRX1-201ENST00000322175 GNAT3A8MTJ3 354 aa20.32■□□□□ 0.84
TPRX1-201ENST00000322175 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
TPRX1-201ENST00000322175 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
TPRX1-201ENST00000322175 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
TPRX1-201ENST00000322175 RUNDC1Q96C34 613 aa20.31■□□□□ 0.84
TPRX1-201ENST00000322175 RNF123Q5XPI4 1314 aa20.31■□□□□ 0.84
TPRX1-201ENST00000322175 DOT1LQ8TEK3 1739 aa20.31■□□□□ 0.84
TPRX1-201ENST00000322175 NEUROD2Q15784 382 aa20.31■□□□□ 0.84
TPRX1-201ENST00000322175 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
TPRX1-201ENST00000322175 RNMTO43148 476 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
TPRX1-201ENST00000322175 DCTN1Q14203 1278 aa20.3■□□□□ 0.84
TPRX1-201ENST00000322175 IL17REQ8NFR9 667 aa20.3■□□□□ 0.84
TPRX1-201ENST00000322175 PIGBQ92521 554 aa20.3■□□□□ 0.84
TPRX1-201ENST00000322175 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
TPRX1-201ENST00000322175 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa20.29■□□□□ 0.84
TPRX1-201ENST00000322175 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa20.29■□□□□ 0.84
TPRX1-201ENST00000322175 NFE2L2Q16236 605 aa20.29■□□□□ 0.84
TPRX1-201ENST00000322175 MCM10Q7L590 875 aa20.29■□□□□ 0.84
TPRX1-201ENST00000322175 MAP3K5Q99683 1374 aa20.29■□□□□ 0.84
TPRX1-201ENST00000322175 CABP4P57796 275 aa20.28■□□□□ 0.84
TPRX1-201ENST00000322175 TMOD3Q9NYL9 352 aa20.28■□□□□ 0.84
TPRX1-201ENST00000322175 ERVV-2B6SEH9 535 aa20.27■□□□□ 0.84
TPRX1-201ENST00000322175 BAG6P46379 1132 aa20.27■□□□□ 0.84
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