RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 ITSN2Q9NZM3 1697 aa17.66■□□□□ 0.42
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CCNDBP1-201ENST00000300213 IL16Q14005 1332 aa17.55■□□□□ 0.4
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CCNDBP1-201ENST00000300213 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa17.54■□□□□ 0.4
CCNDBP1-201ENST00000300213 BECN2A8MW95 431 aa17.54■□□□□ 0.4
CCNDBP1-201ENST00000300213 ELF2Q15723 593 aa17.54■□□□□ 0.4
CCNDBP1-201ENST00000300213 MAP3K11Q16584 847 aa17.54■□□□□ 0.4
CCNDBP1-201ENST00000300213 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
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CCNDBP1-201ENST00000300213 CASTP20810 708 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
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