RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294742.6

ARPC5-201, Transcript of actin related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ARPC5, Length 1,637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5-201ENST00000294742 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
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ARPC5-201ENST00000294742 BARGINQ6ZT62 677 aa22.03■■□□□ 1.12
ARPC5-201ENST00000294742 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
ARPC5-201ENST00000294742 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.02■■□□□ 1.12
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ARPC5-201ENST00000294742 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.01■■□□□ 1.11
ARPC5-201ENST00000294742 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
ARPC5-201ENST00000294742 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
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ARPC5-201ENST00000294742 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
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ARPC5-201ENST00000294742 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
ARPC5-201ENST00000294742 SHANK3Q9BYB0 1731 aa21.97■■□□□ 1.11
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ARPC5-201ENST00000294742 NEUROD2Q15784 382 aa21.97■■□□□ 1.11
ARPC5-201ENST00000294742 GAS2L2Q8NHY3 880 aa21.97■■□□□ 1.11
ARPC5-201ENST00000294742 LRRC37A3O60309 1634 aa21.97■■□□□ 1.11
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ARPC5-201ENST00000294742 SPG7Q9UQ90 795 aa21.96■■□□□ 1.11
ARPC5-201ENST00000294742 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
ARPC5-201ENST00000294742 RIPK4P57078 832 aa21.95■■□□□ 1.1
ARPC5-201ENST00000294742 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
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ARPC5-201ENST00000294742 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
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ARPC5-201ENST00000294742 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.94■■□□□ 1.1
ARPC5-201ENST00000294742 CYP27B1O15528 508 aa21.94■■□□□ 1.1
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ARPC5-201ENST00000294742 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa21.93■■□□□ 1.1
ARPC5-201ENST00000294742 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa21.93■■□□□ 1.1
ARPC5-201ENST00000294742 EXOC5O00471 708 aa21.92■■□□□ 1.1
ARPC5-201ENST00000294742 PHKG2P15735 406 aa21.92■■□□□ 1.1
ARPC5-201ENST00000294742 DDB1Q16531 1140 aa21.92■■□□□ 1.1
ARPC5-201ENST00000294742 AKAP4Q5JQC9 854 aa21.91■■□□□ 1.1
ARPC5-201ENST00000294742 MAP3K5Q99683 1374 aa21.91■■□□□ 1.1
ARPC5-201ENST00000294742 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
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ARPC5-201ENST00000294742 GNAT3A8MTJ3 354 aa21.9■■□□□ 1.1
ARPC5-201ENST00000294742 MYT1Q01538 1121 aa21.9■■□□□ 1.1
ARPC5-201ENST00000294742 CCDC27Q2M243 656 aa21.9■■□□□ 1.1
ARPC5-201ENST00000294742 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.9■■□□□ 1.1
ARPC5-201ENST00000294742 IFNL2Q8IZJ0 200 aa21.9■■□□□ 1.1
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ARPC5-201ENST00000294742 SEPT12Q8IYM1 358 aa21.89■■□□□ 1.09
ARPC5-201ENST00000294742 DCTN1Q14203 1278 aa21.88■■□□□ 1.09
ARPC5-201ENST00000294742 WWC1Q8IX03 1113 aa21.88■■□□□ 1.09
ARPC5-201ENST00000294742 NGEFQ8N5V2 710 aa21.88■■□□□ 1.09
ARPC5-201ENST00000294742 ZNF521Q96K83 1311 aa21.88■■□□□ 1.09
ARPC5-201ENST00000294742 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
ARPC5-201ENST00000294742 MCM10Q7L590 875 aa21.87■■□□□ 1.09
ARPC5-201ENST00000294742 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.87■■□□□ 1.09
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ARPC5-201ENST00000294742 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa21.86■■□□□ 1.09
ARPC5-201ENST00000294742 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
ARPC5-201ENST00000294742 IL17REQ8NFR9 667 aa21.86■■□□□ 1.09
ARPC5-201ENST00000294742 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
ARPC5-201ENST00000294742 LGR6Q9HBX8 967 aa21.86■■□□□ 1.09
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ARPC5-201ENST00000294742 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
ARPC5-201ENST00000294742 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
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ARPC5-201ENST00000294742 RGS12O14924 1447 aa21.84■■□□□ 1.09
ARPC5-201ENST00000294742 RNMTO43148 476 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
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ARPC5-201ENST00000294742 PDE3BQ13370 1112 aa21.82■■□□□ 1.08
ARPC5-201ENST00000294742 SCN11AQ9UI33 1791 aa21.82■■□□□ 1.08
ARPC5-201ENST00000294742 BRWD3Q6RI45 1802 aa21.82■■□□□ 1.08
ARPC5-201ENST00000294742 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa21.81■■□□□ 1.08
ARPC5-201ENST00000294742 WDR63Q8IWG1 891 aa21.8■■□□□ 1.08
ARPC5-201ENST00000294742 FAM182BQ5T319 152 aa21.79■■□□□ 1.08
ARPC5-201ENST00000294742 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
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ARPC5-201ENST00000294742 GOLGA2Q08379 1002 aa21.76■■□□□ 1.07
ARPC5-201ENST00000294742 SLC52A2Q9HAB3 445 aa21.76■■□□□ 1.07
ARPC5-201ENST00000294742 DOT1LQ8TEK3 1739 aa21.75■■□□□ 1.07
ARPC5-201ENST00000294742 IL16Q14005 1332 aa21.75■■□□□ 1.07
ARPC5-201ENST00000294742 ERVV-2B6SEH9 535 aa21.75■■□□□ 1.07
ARPC5-201ENST00000294742 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
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ARPC5-201ENST00000294742 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa21.73■■□□□ 1.07
ARPC5-201ENST00000294742 ACSBG1Q96GR2 724 aa21.73■■□□□ 1.07
ARPC5-201ENST00000294742 CABP4P57796 275 aa21.73■■□□□ 1.07
ARPC5-201ENST00000294742 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
ARPC5-201ENST00000294742 CFAP44Q96MT7 982 aa21.73■■□□□ 1.07
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