RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000248151.4

TUBBP1-201, Transcript of tubulin beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TUBBP1, Length 1,335 nt, Biotype transcribed processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBBP1-201ENST00000248151 PTF1AQ7RTS3 328 aa14.94□□□□□ -0.02
TUBBP1-201ENST00000248151 CFAP53Q96M91 514 aa14.94□□□□□ -0.02
TUBBP1-201ENST00000248151 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
TUBBP1-201ENST00000248151 SHANK3Q9BYB0 1731 aa14.94□□□□□ -0.02
TUBBP1-201ENST00000248151 ACSBG1Q96GR2 724 aa14.93□□□□□ -0.02
TUBBP1-201ENST00000248151 EP400Q96L91 3159 aa14.93□□□□□ -0.02
TUBBP1-201ENST00000248151 RGPD1P0DJD0 1748 aa14.93□□□□□ -0.02
TUBBP1-201ENST00000248151 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TUBBP1-201ENST00000248151 KCNQ2O43526 872 aa14.92□□□□□ -0.02
TUBBP1-201ENST00000248151 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa14.91□□□□□ -0.02
TUBBP1-201ENST00000248151 NCAPD2Q15021 1401 aa14.91□□□□□ -0.02
TUBBP1-201ENST00000248151 TNS2Q63HR2 1409 aa14.91□□□□□ -0.02
TUBBP1-201ENST00000248151 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TUBBP1-201ENST00000248151 DEFB132Q7Z7B7 95 aa14.91□□□□□ -0.02
TUBBP1-201ENST00000248151 CYP27B1O15528 508 aa14.9□□□□□ -0.02
TUBBP1-201ENST00000248151 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TUBBP1-201ENST00000248151 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
TUBBP1-201ENST00000248151 SPG7Q9UQ90 795 aa14.9□□□□□ -0.02
TUBBP1-201ENST00000248151 CCDC184Q52MB2 194 aa14.89□□□□□ -0.03
TUBBP1-201ENST00000248151 NUDCQ9Y266 331 aa14.89□□□□□ -0.03
TUBBP1-201ENST00000248151 APBA3O96018 575 aa14.88□□□□□ -0.03
TUBBP1-201ENST00000248151 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
TUBBP1-201ENST00000248151 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TUBBP1-201ENST00000248151 PKD1L3Q7Z443 1732 aa14.87□□□□□ -0.03
TUBBP1-201ENST00000248151 ANP32CO43423 234 aa14.87□□□□□ -0.03
TUBBP1-201ENST00000248151 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
TUBBP1-201ENST00000248151 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TUBBP1-201ENST00000248151 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
TUBBP1-201ENST00000248151 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TUBBP1-201ENST00000248151 CCDC125Q86Z20 511 aa14.86□□□□□ -0.03
TUBBP1-201ENST00000248151 PHACTR3Q96KR7 559 aa14.86□□□□□ -0.03
TUBBP1-201ENST00000248151 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa14.85□□□□□ -0.03
TUBBP1-201ENST00000248151 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa14.85□□□□□ -0.03
TUBBP1-201ENST00000248151 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
TUBBP1-201ENST00000248151 ITGB4P16144 1822 aa14.85□□□□□ -0.03
TUBBP1-201ENST00000248151 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
TUBBP1-201ENST00000248151 PHKG2P15735 406 aa14.85□□□□□ -0.03
TUBBP1-201ENST00000248151 PRKAR2BP31323 418 aa14.85□□□□□ -0.03
TUBBP1-201ENST00000248151 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
TUBBP1-201ENST00000248151 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
TUBBP1-201ENST00000248151 KDRP35968 1356 aa14.85□□□□□ -0.03
TUBBP1-201ENST00000248151 IFNL2Q8IZJ0 200 aa14.84□□□□□ -0.03
TUBBP1-201ENST00000248151 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
TUBBP1-201ENST00000248151 RSPH6AQ9H0K4 717 aa14.84□□□□□ -0.03
TUBBP1-201ENST00000248151 DOT1LQ8TEK3 1739 aa14.84□□□□□ -0.03
TUBBP1-201ENST00000248151 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
TUBBP1-201ENST00000248151 AMOTQ4VCS5 1084 aa14.83□□□□□ -0.04
TUBBP1-201ENST00000248151 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa14.83□□□□□ -0.04
TUBBP1-201ENST00000248151 BTAF1O14981 1849 aa14.82□□□□□ -0.04
TUBBP1-201ENST00000248151 FCHSD2O94868 740 aa14.82□□□□□ -0.04
TUBBP1-201ENST00000248151 BAG6P46379 1132 aa14.82□□□□□ -0.04
TUBBP1-201ENST00000248151 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
TUBBP1-201ENST00000248151 C1orf141Q5JVX7 400 aa14.81□□□□□ -0.04
TUBBP1-201ENST00000248151 LGR6Q9HBX8 967 aa14.81□□□□□ -0.04
TUBBP1-201ENST00000248151 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa14.81□□□□□ -0.04
TUBBP1-201ENST00000248151 NHSQ6T4R5 1651 aa14.8□□□□□ -0.04
TUBBP1-201ENST00000248151 BCL9O00512 1426 aa14.8□□□□□ -0.04
TUBBP1-201ENST00000248151 CAMKK2Q96RR4 588 aa14.8□□□□□ -0.04
TUBBP1-201ENST00000248151 ADAMTS8Q9UP79 889 aa14.8□□□□□ -0.04
TUBBP1-201ENST00000248151 DLG5Q8TDM6 1919 aa14.79□□□□□ -0.04
TUBBP1-201ENST00000248151 CCDC146Q8IYE0 955 aa14.79□□□□□ -0.04
TUBBP1-201ENST00000248151 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa14.78□□□□□ -0.04
TUBBP1-201ENST00000248151 KCNQ4P56696 695 aa14.78□□□□□ -0.04
TUBBP1-201ENST00000248151 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP14.78□□□□□ -0.04
TUBBP1-201ENST00000248151 AKAP4Q5JQC9 854 aa14.78□□□□□ -0.04
TUBBP1-201ENST00000248151 PROM2Q8N271 834 aa14.78□□□□□ -0.04
TUBBP1-201ENST00000248151 PIGBQ92521 554 aa14.78□□□□□ -0.04
TUBBP1-201ENST00000248151 PLEKHF1Q96S99 279 aa14.78□□□□□ -0.04
TUBBP1-201ENST00000248151 SCN11AQ9UI33 1791 aa14.78□□□□□ -0.04
TUBBP1-201ENST00000248151 PLSCR1O15162 318 aa14.76□□□□□ -0.05
TUBBP1-201ENST00000248151 RNMTO43148 476 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TUBBP1-201ENST00000248151 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TUBBP1-201ENST00000248151 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa14.76□□□□□ -0.05
TUBBP1-201ENST00000248151 DCAF5Q96JK2 942 aa14.76□□□□□ -0.05
TUBBP1-201ENST00000248151 MRS2Q9HD23 443 aa14.76□□□□□ -0.05
TUBBP1-201ENST00000248151 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
TUBBP1-201ENST00000248151 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TUBBP1-201ENST00000248151 CABP4P57796 275 aa14.75□□□□□ -0.05
TUBBP1-201ENST00000248151 DCTN1Q14203 1278 aa14.75□□□□□ -0.05
TUBBP1-201ENST00000248151 IL17REQ8NFR9 667 aa14.75□□□□□ -0.05
TUBBP1-201ENST00000248151 GAS2L2Q8NHY3 880 aa14.75□□□□□ -0.05
TUBBP1-201ENST00000248151 TMOD3Q9NYL9 352 aa14.75□□□□□ -0.05
TUBBP1-201ENST00000248151 ASAP1Q9ULH1 1129 aa14.75□□□□□ -0.05
TUBBP1-201ENST00000248151 GNAT3A8MTJ3 354 aa14.74□□□□□ -0.05
TUBBP1-201ENST00000248151 TXNRD1Q16881 649 aa14.74□□□□□ -0.05
TUBBP1-201ENST00000248151 ERVV-2B6SEH9 535 aa14.73□□□□□ -0.05
TUBBP1-201ENST00000248151 NEFMP07197 916 aa14.73□□□□□ -0.05
TUBBP1-201ENST00000248151 NEUROD2Q15784 382 aa14.73□□□□□ -0.05
TUBBP1-201ENST00000248151 MCM10Q7L590 875 aa14.73□□□□□ -0.05
TUBBP1-201ENST00000248151 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TUBBP1-201ENST00000248151 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TUBBP1-201ENST00000248151 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TUBBP1-201ENST00000248151 ATG3Q9NT62 314 aa14.72□□□□□ -0.05
TUBBP1-201ENST00000248151 LRRC4BQ9NT99 713 aa14.72□□□□□ -0.05
TUBBP1-201ENST00000248151 MAP3K5Q99683 1374 aa14.71□□□□□ -0.05
TUBBP1-201ENST00000248151 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa14.71□□□□□ -0.05
TUBBP1-201ENST00000248151 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa14.71□□□□□ -0.05
TUBBP1-201ENST00000248151 NFE2L2Q16236 605 aa14.71□□□□□ -0.05
TUBBP1-201ENST00000248151 MIER1Q8N108 512 aa14.71□□□□□ -0.05
TUBBP1-201ENST00000248151 SLC39A6Q13433 755 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms