RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225576.7

TVP23C-201, Transcript of trans-golgi network vesicle protein 23 homolog C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TVP23C, Length 1,527 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23C-201ENST00000225576 UBAP1LF5GYI3 381 aa21.66■■□□□ 1.06
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TVP23C-201ENST00000225576 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
TVP23C-201ENST00000225576 CRBNQ96SW2 442 aa21.65■■□□□ 1.06
TVP23C-201ENST00000225576 AMOTQ4VCS5 1084 aa21.65■■□□□ 1.06
TVP23C-201ENST00000225576 MAP3K5Q99683 1374 aa21.65■■□□□ 1.06
TVP23C-201ENST00000225576 CHRNA2Q15822 529 aa21.64■■□□□ 1.05
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TVP23C-201ENST00000225576 ALDH1L2Q3SY69 923 aa21.63■■□□□ 1.05
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TVP23C-201ENST00000225576 SSH1Q8WYL5 1049 aa21.61■■□□□ 1.05
TVP23C-201ENST00000225576 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.61■■□□□ 1.05
TVP23C-201ENST00000225576 PRDM11Q9NQV5 511 aa21.61■■□□□ 1.05
TVP23C-201ENST00000225576 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa21.61■■□□□ 1.05
TVP23C-201ENST00000225576 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
TVP23C-201ENST00000225576 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.6■■□□□ 1.05
TVP23C-201ENST00000225576 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.6■■□□□ 1.05
TVP23C-201ENST00000225576 NLRP2Q9NX02 1062 aa21.6■■□□□ 1.05
TVP23C-201ENST00000225576 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa21.6■■□□□ 1.05
TVP23C-201ENST00000225576 RGPD5Q99666 1765 aa21.6■■□□□ 1.05
TVP23C-201ENST00000225576 IL17REQ8NFR9 667 aa21.6■■□□□ 1.05
TVP23C-201ENST00000225576 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
TVP23C-201ENST00000225576 BABAM1Q9NWV8 329 aa21.6■■□□□ 1.05
TVP23C-201ENST00000225576 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa21.59■■□□□ 1.05
TVP23C-201ENST00000225576 AKAP4Q5JQC9 854 aa21.59■■□□□ 1.05
TVP23C-201ENST00000225576 SOCS7O14512 581 aa21.58■■□□□ 1.04
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TVP23C-201ENST00000225576 TSPYL6Q8N831 410 aa21.58■■□□□ 1.04
TVP23C-201ENST00000225576 C8orf58Q8NAV2 365 aa21.58■■□□□ 1.04
TVP23C-201ENST00000225576 TOM1O60784 492 aa21.57■■□□□ 1.04
TVP23C-201ENST00000225576 MS4A1P11836 297 aa21.57■■□□□ 1.04
TVP23C-201ENST00000225576 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.57■■□□□ 1.04
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
TVP23C-201ENST00000225576 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
TVP23C-201ENST00000225576 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa21.57■■□□□ 1.04
TVP23C-201ENST00000225576 LRRC37A3O60309 1634 aa21.56■■□□□ 1.04
TVP23C-201ENST00000225576 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa21.56■■□□□ 1.04
TVP23C-201ENST00000225576 KIF16BQ96L93 1317 aa21.56■■□□□ 1.04
TVP23C-201ENST00000225576 ABCA3Q99758 1704 aa21.56■■□□□ 1.04
TVP23C-201ENST00000225576 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.042e-14■■□□□ 13.7
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TVP23C-201ENST00000225576 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
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TVP23C-201ENST00000225576 TATP17735 454 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
TVP23C-201ENST00000225576 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.54■■□□□ 1.04
TVP23C-201ENST00000225576 WDR17Q8IZU2 1322 aa21.54■■□□□ 1.04
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TVP23C-201ENST00000225576 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
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TVP23C-201ENST00000225576 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa21.51■■□□□ 1.03
TVP23C-201ENST00000225576 AAMPQ13685 434 aa21.51■■□□□ 1.03
TVP23C-201ENST00000225576 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa21.51■■□□□ 1.03
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TVP23C-201ENST00000225576 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
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TVP23C-201ENST00000225576 SPG7Q9UQ90 795 aa21.5■■□□□ 1.03
TVP23C-201ENST00000225576 RNMTO43148 476 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
TVP23C-201ENST00000225576 RLBP1P12271 317 aa21.5■■□□□ 1.03
TVP23C-201ENST00000225576 TRIM27P14373 513 aa21.5■■□□□ 1.03
TVP23C-201ENST00000225576 PIP4K2BP78356 416 aa21.5■■□□□ 1.03
TVP23C-201ENST00000225576 LGR6Q9HBX8 967 aa21.5■■□□□ 1.03
TVP23C-201ENST00000225576 COG6Q9Y2V7 657 aa21.5■■□□□ 1.03
TVP23C-201ENST00000225576 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
TVP23C-201ENST00000225576 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
TVP23C-201ENST00000225576 TNNQ9UQP3 1299 aa21.49■■□□□ 1.03
TVP23C-201ENST00000225576 MEGF6O75095 1541 aa21.48■■□□□ 1.03
TVP23C-201ENST00000225576 KRT24Q2M2I5 525 aa21.48■■□□□ 1.03
TVP23C-201ENST00000225576 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa21.48■■□□□ 1.03
TVP23C-201ENST00000225576 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
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TVP23C-201ENST00000225576 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.47■■□□□ 1.03
TVP23C-201ENST00000225576 CARD10Q9BWT7 1032 aa21.47■■□□□ 1.03
TVP23C-201ENST00000225576 TEFQ10587 303 aa21.46■■□□□ 1.03
TVP23C-201ENST00000225576 EVA1CP58658 441 aa21.45■■□□□ 1.02
TVP23C-201ENST00000225576 MVPQ14764 893 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
TVP23C-201ENST00000225576 PHKG2P15735 406 aa21.45■■□□□ 1.02
TVP23C-201ENST00000225576 IFNL2Q8IZJ0 200 aa21.45■■□□□ 1.02
TVP23C-201ENST00000225576 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
TVP23C-201ENST00000225576 PHLPP1O60346 1717 aa21.42■■□□□ 1.02
TVP23C-201ENST00000225576 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa21.42■■□□□ 1.02
TVP23C-201ENST00000225576 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
TVP23C-201ENST00000225576 STRN4Q9NRL3 753 aa21.42■■□□□ 1.02
TVP23C-201ENST00000225576 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
TVP23C-201ENST00000225576 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
TVP23C-201ENST00000225576 HSPA1LP34931 641 aa21.41■■□□□ 1.02
TVP23C-201ENST00000225576 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
TVP23C-201ENST00000225576 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
TVP23C-201ENST00000225576 BTBD11A6QL63 1104 aa21.4■■□□□ 1.02
TVP23C-201ENST00000225576 BTG4Q9NY30 223 aa21.4■■□□□ 1.02
TVP23C-201ENST00000225576 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.4■■□□□ 1.02
TVP23C-201ENST00000225576 PKD1L3Q7Z443 1732 aa21.4■■□□□ 1.02
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