RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635880.1

GABRA1-211, Transcript of gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha1 subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene GABRA1, Length 1,739 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1-211ENST00000635880 CCDC154A6NI56 674 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 SAC3D1A6NKF1 404 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 GOLGA8CPA6NN73 597 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 ARPC2O15144 300 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 INSIG1O15503 277 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 SNX2O60749 519 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 ADAMTS4O75173 837 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 PKMP14618 531 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 LPOP22079 712 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 FGFR3P22607 806 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 HTR1EP28566 365 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 SLC11A2P49281 568 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 TTPAP49638 278 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 GSK3BP49841 420 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 CCT8P50990 548 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 ADARP55265 1226 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 CDH4P55283 916 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 HUNKP57058 714 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 NUP107P57740 925 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 IL2P60568 153 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 ERVK-8P63133 956 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 LIPEQ05469 1076 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 GPR17Q13304 367 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 PTPRCAPQ14761 206 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 KCNA10Q16322 511 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 FXNQ16595 210 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 SLC36A3Q495N2 470 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 XKR7Q5GH72 579 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 IL31Q6EBC2 164 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 NADSYN1Q6IA69 706 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 UGT3A1Q6NUS8 523 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 FKBP9P1Q75LS8 142 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 LPCAT2Q7L5N7 544 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 GPR141Q7Z602 305 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 LGI2Q8N0V4 545 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 TMEM199Q8N511 208 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 FIBCD1Q8N539 461 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 AADATQ8N5Z0 425 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 SNX31Q8N9S9 440 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 TERB1Q8NA31 727 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 FAM47BQ8NA70 645 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 ATAD1Q8NBU5 361 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 OR4K2Q8NGD2 314 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 SEPT8Q92599 483 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 LRCH3Q96II8 777 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 CEP295NLQ96MC4 621 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 HGH1Q9BTY7 390 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 ADI1Q9BV57 179 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 ADGRE3Q9BY15 652 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 ALG2Q9H553 416 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 ANAPC2Q9UJX6 822 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 PCTPQ9UKL6 214 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 PATJQ8NI35 1801 aa7.12□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 TCRBV5S2A0A599 114 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 LRRC14BA6NHZ5 514 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 CDC7O00311 574 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 ARNTLO00327 626 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 DLGAP1O14490 977 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 ACOX3O15254 700 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 INPP4BO15327 924 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 ACSL4O60488 711 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 TLR5O60602 858 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 CLDN11O75508 207 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 LDLRP01130 860 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 HMBSP08397 361 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 SPATA31D3P0C874 917 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 CDK4P11802 303 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 CR2P20023 1033 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 CST5P28325 142 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 RFC2P35250 354 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 CAPGP40121 348 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 DIO3P55073 304 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 OXCT1P55809 520 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 HPCAP84074 193 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 EMX2Q04743 252 aa7.11□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
GABRA1-211ENST00000635880 TSNQ15631 228 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms