RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659		F5H5T6	163 aa		15.21	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PLOD2	O00469	737 aa		15.21	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TEX28	O15482	410 aa		15.21	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	LILRB3	O75022	631 aa		15.21	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	FGF18	O76093	207 aa		15.21	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CSPG5	O95196	566 aa		15.21	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	HLA-DQB2	P05538	268 aa		15.21	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	POLB	P06746	335 aa		15.21	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	MAPKAPK2	P49137	400 aa		15.21	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SLC11A2	P49281	568 aa		15.21	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	EPHB3	P54753	998 aa		15.21	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	GEM	P55040	296 aa		15.21	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	C1QTNF8	P60827	252 aa		15.21	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	GNA12	Q03113	381 aa		15.21	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	15.21	■□□□□ 0.03	3e-7	■■■□□ 14.9
BBS1-225	ENST00000630659	C5orf22	Q49AR2	442 aa		15.21	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		15.21	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	GRTP1	Q5TC63	336 aa		15.21	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TTC23L	Q6PF05	361 aa		15.21	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	LGI2	Q8N0V4	545 aa		15.21	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	MAPK15	Q8TD08	544 aa		15.21	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		15.21	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	VMP1	Q96GC9	406 aa		15.21	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		15.21	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	IL22	Q9GZX6	179 aa		15.21	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ZBP1	Q9H171	429 aa		15.21	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		15.21	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		15.21	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		15.21	■□□□□ 0.03
BBS1-225	ENST00000630659	RAMP2	O60895	175 aa		15.21	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	UGT2B4	P06133	528 aa		15.21	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	NAT1	P18440	290 aa		15.21	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	HPCAL1	P37235	193 aa		15.21	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	GP5	P40197	560 aa		15.21	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	KRT6C	P48668	564 aa		15.21	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	RENBP	P51606	427 aa		15.21	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CDH17	Q12864	832 aa		15.21	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		15.21	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		15.21	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		15.21	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		15.21	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		15.21	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PARP8	Q8N3A8	854 aa		15.21	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		15.21	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	OR2T3	Q8NH03	318 aa		15.21	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		15.21	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		15.21	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		15.21	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		15.21	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CPNE1	Q99829	537 aa		15.21	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		15.21	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		15.21	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	MAGEB16	A2A368	324 aa		15.2	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		15.2	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	AQP12B	A6NM10	295 aa		15.2	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		15.2	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SOCS2	O14508	198 aa		15.2	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	KMO	O15229	486 aa		15.2	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PEX11B	O96011	259 aa		15.2	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CTSA	P10619	480 aa		15.2	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TGM1	P22735	817 aa		15.2	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	OR1E1	P30953	314 aa		15.2	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CAPG	P40121	348 aa		15.2	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CDC20	Q12834	499 aa		15.2	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	INPP5A	Q14642	412 aa		15.2	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PARP15	Q460N3	678 aa		15.2	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		15.2	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	15.2	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	LPGAT1	Q92604	370 aa		15.2	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	PSMG2	Q969U7	264 aa		15.2	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	TXNDC15	Q96J42	360 aa		15.2	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	APOL2	Q9BQE5	337 aa		15.2	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		15.2	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		15.2	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		15.2	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SP110	Q9HB58	689 aa		15.2	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659		J3KR12	359 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CLOCK	O15516	846 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	STC2	O76061	302 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	MYO1D	O94832	1006 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SLC6A4	P31645	630 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	SPATS1	Q496A3	300 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BBS1-225	ENST00000630659	BROX	Q5VW32	411 aa		15.19	■□□□□ 0.02

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms