RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 DUOXA1Q1HG43 343 aa21.42■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 KIAA0408Q6ZU52 694 aa21.42■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 RABEPKQ7Z6M1 372 aa21.42■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 OR14C36Q8NHC7 312 aa21.42■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 PPP4R1Q8TF05 950 aa21.42■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 BTBD10Q9BSF8 475 aa21.42■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 FAM167BQ9BTA0 163 aa21.42■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 SP110Q9HB58 689 aa21.42■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 SERGEFQ9UGK8 458 aa21.42■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 SARDHQ9UL12 918 aa21.42■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 FZD4Q9ULV1 537 aa21.42■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 STK38LQ9Y2H1 464 aa21.42■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 HEATR9A2RTY3 570 aa21.41■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 G3V2L1 256 aa21.41■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 ITM2AO43736 263 aa21.41■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 AHSGP02765 367 aa21.41■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 GABRB3P28472 473 aa21.41■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 PRKAA2P54646 552 aa21.41■■□□□ 1.02
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SGMS1-210ENST00000619438 SERINC3Q13530 473 aa21.41■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 AADATQ8N5Z0 425 aa21.41■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa21.41■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 SORT1Q99523 831 aa21.41■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 NMUR2Q9GZQ4 415 aa21.41■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 PCED1AQ9H1Q7 454 aa21.41■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 NMRAL1Q9HBL8 299 aa21.41■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 NT5MQ9NPB1 228 aa21.41■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 DYRK4Q9NR20 520 aa21.41■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 SUSD2Q9UGT4 822 aa21.41■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 LRRC72A6NJI9 287 aa21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM114B3SHH9 223 aa21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 VAPBO95292 243 aa21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 PRNPP04156 253 aa21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 SERPINA6P08185 405 aa21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 MMP2P08253 660 aa21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 SLC10A7Q0GE19 358 aa21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 CARD16Q5EG05 197 aa21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 ARSIQ5FYB1 569 aa21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 TM6SF2Q9BZW4 377 aa21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 CAB39LQ9H9S4 337 aa21.4■■□□□ 1.02
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SGMS1-210ENST00000619438 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
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SGMS1-210ENST00000619438 ICE2Q659A1 982 aa21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 GALNT7Q86SF2 657 aa21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 CHST14Q8NCH0 376 aa21.4■■□□□ 1.02
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SGMS1-210ENST00000619438 ZNF599Q96NL3 588 aa21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 DNAJC28Q9NX36 388 aa21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 SLC39A10Q9ULF5 831 aa21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 SLC6A14Q9UN76 642 aa21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-210ENST00000619438 MYLKQ15746 1914 aa21.39■■□□□ 1.02
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SGMS1-210ENST00000619438 TBC1D3EA0A087X179 549 aa21.39■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa21.39■■□□□ 1.01
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SGMS1-210ENST00000619438 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa21.39■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa21.39■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 SLC23A3Q6PIS1 610 aa21.39■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 NCEH1Q6PIU2 408 aa21.39■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 TTC7BQ86TV6 843 aa21.39■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 TMIEQ8NEW7 156 aa21.39■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 ARRDC2Q8TBH0 407 aa21.39■■□□□ 1.01
SGMS1-210ENST00000619438 CALML6Q8TD86 181 aa21.39■■□□□ 1.01
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