RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WFDC5Q8TCV5 224 aa16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MYO19Q96H55 970 aa16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PKP2Q99959 881 aa16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GIMAP2Q9UG22 337 aa16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF225Q9UK10 706 aa16.35■□□□□ 0.21
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NUDT4Q9NZJ9 180 aa16.34■□□□□ 0.21
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ABCD2Q9UBJ2 740 aa16.34■□□□□ 0.21
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DHRS7Q9Y394 339 aa16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa16.33■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A0A0U1RQS6 177 aa16.33■□□□□ 0.21
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NR5A2O00482 541 aa16.33■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 E2F3O00716 465 aa16.33■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.21
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CAPN3P20807 821 aa16.33■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP16.33■□□□□ 0.216e-7■□□□□ 10.4
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CPXM2Q8N436 756 aa16.33■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ACDQ96AP0 544 aa16.33■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM192AQ9GZU8 254 aa16.33■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 Q9H521 79 aa16.33■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PFDN4Q9NQP4 134 aa16.33■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SPG21Q9NZD8 308 aa16.33■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CD274Q9NZQ7 290 aa16.33■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TIMM22Q9Y584 194 aa16.33■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AP4S1Q9Y587 144 aa16.33■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HELZP42694 1942 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CARNS1A5YM72 827 aa16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 K7ERQ8 282 aa16.32■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ANGPT2O15123 496 aa16.32■□□□□ 0.2
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